定位于染色体9p21-22的一个新基因UBAP1的克隆测序及在鼻咽癌中的表达分析

在染色体 9p2 1 2 2鼻咽癌杂合性丢失 (lossofheterozygosity,LOH)高频区 ,应用EST介导的定位 侯选克隆策略 ,用RT PCR及Northern杂交检测了 2 2个表达序列标记 (expressedsequencetag ,EST)在鼻咽癌细胞株HNE1和原代培养的正常鼻咽上皮细胞中的表达差异 ,并对其中一个在鼻咽癌细胞株HNE1中表达下调的EST检测了在鼻咽癌活检组织中的表达 .用生物信息学方法获得其全长cDNA序列 ,GenBank登录号AF2 2 2 0 4 3.该基因cDNA全长 2 70 1bp ,其开放阅读框 (openreadingframe ,ORF)编码一个含 50 2个氨基酸、分子量为 55kD的碱性蛋白质 ,在蛋白羧基端含有 2个连续的重要UBA功能域 (ubiquitinassociateddomain) ,属于遍在蛋白相关蛋白家族的一个新成员 ,经国际人类基因命名委员会同意 ,将其命名为UBAP1 (ubiquitinassociatedprotein 1 ) .Northern表达分析显示UBAP1在所检测的人组织中广泛表达 ,但在人的心脏、骨骼肌及肝脏中的表达较强 .UBAP1基因在63 2 % ( 1 2 1 9)的鼻咽癌活检组织中表达下调 .UBAP1基因作为一个遍在蛋白相关蛋白家族的新成员 ,结合其在 9p的重要定位信息 ,有必要进一步研究其表达下调参与鼻咽癌发生发展的可能机制 .

染色体9p21单核苷酸多态性与冠心病/心肌梗死相关性的研究进展

冠状动脉性心脏病(CAD)及其严重临床类型心肌梗死是当今社会造成人类死亡的首要原因,其病因复杂,目前研究认为CAD是由遗传因素和环境因素共同作用而发病的多基因遗传病.全基因组关联研究(GWAS)发现了许多与CAD相关的易感基因位点,其中染色体9p21多态性和CAD及心肌梗死相关性成为研究热点,但目前基因造成CAD高发的具体作用途径仍不清楚,对近年相关研究进展作一综述.

云南高原地区汉族急性心肌梗死患者染色体9p21基因多态性分析

目的探讨云南高原地区汉族急性心肌梗死(AMI)患者染色体9p21基因多态性。方法选择500例AMI患者及350例无冠状动脉粥样硬化性心脏病(CAD)患者,采用Sequenom Mass Array系统基因分型观察两者染色体9p21的10个相关位点(rs10757274、rs10811656、rs1333042、rs1333048、rs1333049、rs2383206、rs2383207、rs4977574、rs7865618和rs944797)的基因多态性。结果染色体9p21的10个位点中,8个位点(rs10757274、rs10811656、rs1333042、rs1333048、rs1333049、rs2383206、rs4977574和rs7865618)的基因存在多态性变异,基因型在AMI及无CAD患者中均达到遗传平衡(P均>0.01)。rs1333048纯合子CC等位基因的OR为1.52(95%CI:1.05~2.19,P=0.027)。结论染色体9p21基因rs1333048的CC基因型是云南高原地区汉族人群AMI的危险基因型。

染色体9p21基因多态性与云南彝族人群心肌梗死的相关性研究

目的 探讨9p21单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）与云南彝族心肌梗死（myocardial infarction,MI）的相关性。方法 选择110例冠状动脉造影证实的MI患者和110例对照组作为研究对象,应用DNA直接测序法,检测9p21的基因位点和SNP分型及分析。结果 心肌梗死组和对照组染色体9p21上10个基因位点中有9个位点达到了Hardy-Weinberg平衡,其中rs1333049 GG基因型频率在病例组和对照组分别为30.91%和18.18%,G等位基因频率分别为58.3%和44.9%,2组比较差异有统计学意义（P〈0.05）;rs2383206 GG基因型频率分别为31.82%和18.18%,G等位基因频率分别为55.3%和41.1%;2组间比较差异有统计学意义。结论 9p21位点rs1333049、rs2383206的多态性与云南彝族MI有关。

口腔鳞癌中染色体9p杂合性丢失的研究

目的 :探讨口腔鳞状细胞癌中 9号染色体短臂等位基因的杂合性丢失和微卫星不稳定与口腔鳞状细胞癌发生、发展之间的关系。方法 :采用PCR法检测 2 4例口腔鳞状细胞癌中染色体 9p上 8个微卫星多态位点。结果 :在2 4例口腔鳞状细胞癌中 ,10例 (41 6 7% )鳞癌组织至少有一个微卫星位点发生杂合性丢失。其主要发生在染色体9p2 1的D9S171(2 1 0 5 % )和D9S30 4(10 .0 0 % ) ,以及 9p2 2_2 3的D9S16 8(2 2 2 2 % )和D9S16 2 (15 38% )。然而 ,这些基因位点的杂合性丢失与肿瘤病理学类型、肿瘤的大小及转移性在统计学上无显著相关性 (P >0 0 5 )。此外 ,微卫星不稳定仅在 2例患者中出现 ,没有 1例患者符合微卫星不稳定的判定标准 ,即两个或两个以上的微卫星多态位点的异常。结论 :本研究中发现的口腔鳞状细胞癌在染色体 9p2 1_2 3区域发生高频率的杂合性丢失 ,提示在 9p2 1_2 3区域可能存在多个与部分口腔鳞状细胞癌相关的肿瘤抑制基因 。

胶质瘤中染色体9p21区域D9S319座位的杂合性缺失研究

目的 :探讨染色体 9p2 1区域D9S319座位的杂合性缺失 (LOH)在胶质瘤的发生发展中的作用。方法 :应用微卫星多态标记_PCR法对 2 5例胶质瘤组织进行检测。结果 :2 1例可提供LOH分析信息 ,杂合性缺失率为 5 7% (12 / 2 1) ,其中胶质母细胞瘤、间变型星形细胞瘤、星形细胞瘤分别为 70 % (7/ 10 )、 43% (3/ 7)、 5 0 % (2 / 4)。结论 :染色体 9p2 1区域杂合性缺失与胶质瘤发生发展密切相关 ,该区域可能存在抑癌基因 ,抑癌基因失活将影响胶质瘤的发生发展。

染色体9p21上rs10757278单核苷酸多态性与冠心病的相关性研究

目的:研究染色体9p21上rs10757278位点的基因多态性在昆明汉族人群冠心病(CHD)患者中的分布特征,探讨其与CHD发病的相关性。方法:选择150例冠状动脉造影证实的CHD患者为冠心病组和150例对照组为研究对象,采用聚合酶链式反应(PCR)对rs10757278位点进行单核苷酸多态性(SNP)分型及分析。结果:冠心病组和对照组rs10757278 GG基因型频率分别为36.0%和22.7%,G等位基因频率分别为58.0%和36.0%,两组间比较,差异具有统计学意义(P<0.05)。Logistic回归分析显示,rs10757278 GG基因型为CHD的危险基因型。结论:染色体9p21的rs10757278单核苷酸多态性位点是昆明高原地区汉族人群冠心病发生的易感位点。

浙江温州地区人群染色体9p21上rs1333049位点的单核苷酸多态性分布与冠心病的相关性

目的研究浙江温州地区汉族人群中染色体9p21上的rs1333049位点上的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与冠心病的相关性。方法对冠心病组(至少1支主要冠状动脉内径狭窄≥50.00%)181例和对照组173例,采用聚合酶链反应和基因测序方法,检测染色体9p21上rs1333049位点基因多态性。结果 3种基因型均可在rs1333049位点上检测到,并且其基因型的分布亦符合Hardy-Weinberg平衡定律。冠心病组rs13330149位点的CC、CG基因型分布及C等位基因频率均高于对照组,差异有统计学意义(均P<0.01)。结论 rs1333049位点G/C基因的多态性与冠心病发病相关,其中的C等位基因亦可能是浙江温州地区汉族人群冠心病患者的易感性标志之一。

染色体9p21多态性位点rs2383206与中国汉族人群冠心病的meta分析

目的：分析中国汉族人群中染色体9p21基因多态性位点rs2383206与冠心病的相关性分析。方法：以PubMed、EBSCO、CNKI等为搜索数据库，检索从建库到2018年2月发表有关中国地区汉族人群染色体9p21多态性位点rs2383206与冠心病相关性的随机病例对照研究，并用stata12．0软件进行统计meta分析比较。结果：11篇文献符合条件，Meta分析结果显示中国汉族人群染色体9p21．3单核苷酸多态性位点rs2383206与冠心病存在明显相关性，OR=1．18（95％Cl,1．10-1．26，P=0．00）。结论：中国汉族人群染色体9p21单核苷酸多态性位点rs2383206与冠心病发病风险增高相关，其中G等位基因可能为冠心病的危险因子。

鼻咽癌染色体9p21～22区域精细缺失图谱的构建

目的 进一步精细限定鼻咽癌9p21 ～22 区域等位基因杂合性丢失的频率和范围,为发现和分离克隆该区域内的鼻咽癌抑瘤基因提供新线索和依据。方法 应用11 个定位于9p21 ～22 区域的高密度微卫星位点,检测25 例低分化鼻咽癌患者的杂合性丢失。结果 25 例患者中,有17 例存在一个或多个位点的杂合性丢失,占68-0 % 。其中D9S161(35 .0 % ) 、D9S1678(31 .6 % ) 、D9S263(33 .3 % ) 和D9S1853(33 .3 % )4 个紧邻位点的丢失频率相对较高,并发现有6 例患者在这些位点表现为连续性缺失。结论 鼻咽癌染色体9p21 ～22 区域D9S161 ～D9S1853 位点之间(2 .7 cM) 是鼻咽癌患者的一个较小共同缺失区,该区域内的抑瘤基因失活可能是鼻咽癌发生发展过程中的重要事件。

染色体9p21-22区域两个新的SNPs位点在湖南汉族人群中的多态分布

目的 在人类染色体 9p2 1- 2 2区域克隆的两个候选抑瘤基因 NGX6和 UBAP1以及该区域另一个已知抑瘤基因 CDKN2 A中筛查未知的单核苷酸多态 ( single nucleotide polymorphisms,SNPs)。方法 用 96名正常人外周血白细胞基因组 DNA在 3个基因的外显子及基因上下游调控区中逐段 PCR扩增、大规模测序。结果 在 UBAP1基因第 6外显子及 CDKN2 A基因第 4外显子中各发现一个新的 SNP位点 ,db SNP登录号为 rs3135 92 9和 rs30 884 4 0 ,其多态信息含量分别为 0 .10 2和 0 .2 13。两个 SNPs之间不存在连锁不平衡 ,单倍型分析表明两个 SNPs联用 ,其多态信息含量可达到 0 .30 2。结论 多个 SNP联用 ,其多态信息含量明显提高 ,可克服 SNPs信息量不足的弱点 ;两个 SNPs均位于基因的 3′非翻译区 。

染色体9p21相关基因多态性在中国人群中与冠心病的关系

众所周知,冠心病的发生发展是基因、环境等众多因素共同作用的结果。目前的研究提出大概50%的冠心病源于基因异常。近些年,全基因组相关联研究(genome-wide association study,GWAS)取得了重大突破,研究证实染色体9p21与冠心病发病相关,目前已报道的研究,主要集中于欧洲人群或亚洲其他地区人群。很少有研究针对中国人群中该区域多态性与冠心病之间的关系进行较为系统的综述。这篇综述主要总结了在中国人群中9p21区域的基因多态性与冠心病目前的研究现状,并提出了未来的研究方向。

转录因子和转录激活因子4人细胞毒性T淋巴细胞相关抗原-4和染色体9p21．3遗传多态性与闽南地区人群类风湿关节炎相关性研究

目的探讨转录因子和转录激活因子4（STAT4）rs7574865、人细胞毒性T淋巴细胞相关抗原-4（CTLA-4）rs3087243基因以及染色体9p21.3 rs1333049单核苷酸多态性（SNPs）与闽南地区人群RA的关联。方法选取119例RA患者和125名健康对照者，应用三引物扩增法（AS-PCR）对RA相关的3个SNPs位点进行基因分型，并应用SPSS 18.0统计软件分析不同基因型与RA发病的相关性。采用χ2检验和Logistic回归模型进行分析。结果RA组STAT4 rs7574865各基因型分布频率与健康对照组比较，差异有统计学意义（P〈0.01），与G/T杂合基因型相比，TT与GG纯合性携带者患病风险要低（OR=0.498和0.300，P=0.018和P=0.002）；CTLA-4 rs3087243各基因型分布频率与健康对照组比较，差异无统计学意义（χ^2=4.083，P=0.130），但根据计算，其中与A/G基因型相比，GG型携带者患病风险要低（OR=0.580，P=0.04）；9p21.3上的SNP（rs1333049）无论基因型还是等位基因在RA与健康志愿者组间差异无统计学意义，但是经计算发现与GG基因型携带者相比，CC和GC携带者发病风险要低（OR=0.565，P=0.049 5）。结论STAT4 rs7574865和CTLA-4 rs3087243和rs1333049与闽南地区人群RA发病均有一定相关性。

中国汉族人群中染色体9p21.3基因多态性与阿尔茨海默病的相关性研究

目的:探讨中国汉族人群中染色体9p21.3 rs1333049基因与阿尔茨海默病(AD)的相关性。方法:采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术检测266例AD患者(AD组)与323例非AD者(对照组)的rs1333049基因多态性分布,并通过x^2检验和Logistic回归进行疾病关联分析。结果:AD组和对照组SNP rs1333049基因型频率及等位基因频率差异均有统计学意义(P<0.05);调整混杂因素影响后Logistic回归分析表明,在显性模型和递加模型中,两组的分布差异仍有统计学意义(P<0.05),提示等位基因C增加了AD发病的易感性。结论:中国汉族人群中rs1333049基因与AD的发病存在相关性。

冠心病患者9p21染色体位点CDKN2A、CDKN2B、MTAP及ANRIL的表达变化

目的探讨冠心病患者9p21染色体位点CDKN2A、CDKN2B、MTAP及ANRIL的表达变化。方法选取冠心病患者30例为病例组,以同期体检的健康人群30例为对照组。采集两组患者空腹抗凝静脉血2 m L,采用实时荧光定量PCR法测定9p21染色体位点CDKN2A、CDKN2B、MTAP和ANRIL的mRNA表达水平,并比较差异。结果与对照组相比,病例组的外周血9p21染色体区域的CDKN2A、CDKN2B mRNA表达水平降低(P均<0.05),MTAP mRNA表达水平升高(P<0.05),ANRIL mRNA表达水平无统计学差异(P>0.05)。结论冠心病患者9p21染色体位点CDKN2A、CDKN2B表达下降,MTAP表达升高。

9p21染色体位点基因表达水平与冠心病病情发展的相关性

目的观察9p21染色体位点相关基因与冠心病病情发展相关性。方法采用实时荧光PCR扩增法分别测定稳定型心绞痛患者(30例)、不稳定型心绞痛患者(30例)、急性心肌梗死患者(30例)、健康人群患者(30例)的外周血9p21染色体位点相关基因[细胞周期依赖性激酶抑制基因(CDKN)2A、CDKN2B、甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)和INK4基因座中反义非编码RNA(ANRIL)]表达水平,分析不同冠心病病情分期患者及健康人群外周血9p21染色体位点相关基因表达差异。结果与健康人群组比较,稳定型心绞痛组、不稳定型心绞痛组和急性心肌梗死组患者外周血9p21染色体位点CDKN2A、CDKN2B基因表达水平显著降低(均P<0.05),而MTAP基因表达水平显著提升(P<0.05),而ANRIL基因表达差异无统计学意义(P>0.05)。同时稳定型心绞痛组、不稳定型心绞痛组和急性心肌梗死组患者外周血9p21染色体位点CDKN2A、CDKN2B、MTAP基因表达水平两两比较差异均有统计学意义(均P<0.05),ANRIL基因表达水平两两比较差异均无统计学意义(均P>0.05)。结论 9p21染色体区域的CDKN2A、CDKN2B、MTAP基因与冠心病发生密切相关,且随着冠心病病情发展,9p21染色体区域的CDKN2A、CDKN2B、MTAP基因表达与正常健康人群差异越明显,9p21染色体位点CDKN2A、CDKN2B、MTAP基因表达水平可能是汉族冠心病人群临床诊治的潜在靶基因。

9p21染色体单核苷酸多态性与冠心病相关性的研究进展

冠心病是全世界范围内导致死亡的疾病,全基因组关联研究(GWAS)发现了许多与冠心病相关的易感基因位点。本文综述9p21染色体单核苷酸多态性(SNP)和冠心病的关系,9p21风险基因的表达不仅增加冠心病的发病率,同时提高心肌梗死的发病率,并与早发冠心病和再发心肌梗死相关联,但目前基因造成冠心病高发的具体作用途径仍不清楚。

人类第9号染色体微卫星改变与非小细胞肺癌发生及转移的关系

目的 探讨人类第 9号染色体短臂 (9p)上微卫星改变与肺癌发生及转移的相关性。方法 应用聚合酶链反应 (PCR)结合微卫星银染分析方法检测 32例非小细胞肺癌 (NSCLC)组织中两个微卫星标志物IFNA和D9S171的改变。结果 32例NSCLC患者中 ,14例 (43 .8% )出现了微卫星标志物改变。其中伴有淋巴结转移的肺癌组织中微卫星改变检出率为 6 4.7% ,不伴转移的肺癌组织中微卫星改变检出率为 2 0 % ,两组间比较有显著性差异 (P <0 .0 5 )。 16例良性肺部疾病组织均未检出微卫星改变。结论 人类第 9号染色体微卫星改变在NSCLC中普遍存在 ,有可能成为肺癌早期诊断和转移判断的分子标志物。

新疆维吾尔族人群9p21单核苷酸多态性与冠心病的关联性研究

目的研究染色体9p21上两个单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）位点（rs2383206、rs10757274）在新疆维吾尔族人群中的分布，探讨其与冠心病（coronary heart disease，CHD）的关联性。方法采用病例对照研究，选择172例冠状动脉造影证实的CHD患者和147例患者为对照组作为研究对象，应用LDR—PCR技术对rs2383206、rsl0757274位点进行SNP分型及分析。结果rs2383206GG基因型频率在冠心病组和对照组分别为34．9％和24．4％，G等位基因频率分别为58．1％和49．3％；两组间比较差异均有统计学意义（P〈0．05）；rsl0757274GG基因型频率在冠心病组和对照组分别为32．O％和21．8％，G等位基因频率分别为54．9％和46．6％；两组间比较差异均有统计学意义（P〈0．05）。调整相关因素后，多因素Logistic回归分析，结果提示两个SNP的GG基因型仍是CHD的危险基因型，rs2383206的OR值为1．91，95％CI（1．03～3．53），rsl0757274的OR值为2．03，95％CI（1．08～3．80），P值均〈0．05。结论9p21位点rs2383206、rsl0757274的多态性与维吾尔族族人CHD有关联。