染色体9p21-22区域两个新的SNPs位点在湖南汉族人群中的多态分布

目的 在人类染色体 9p2 1- 2 2区域克隆的两个候选抑瘤基因 NGX6和 UBAP1以及该区域另一个已知抑瘤基因 CDKN2 A中筛查未知的单核苷酸多态 ( single nucleotide polymorphisms,SNPs)。方法 用 96名正常人外周血白细胞基因组 DNA在 3个基因的外显子及基因上下游调控区中逐段 PCR扩增、大规模测序。结果 在 UBAP1基因第 6外显子及 CDKN2 A基因第 4外显子中各发现一个新的 SNP位点 ,db SNP登录号为 rs3135 92 9和 rs30 884 4 0 ,其多态信息含量分别为 0 .10 2和 0 .2 13。两个 SNPs之间不存在连锁不平衡 ,单倍型分析表明两个 SNPs联用 ,其多态信息含量可达到 0 .30 2。结论 多个 SNP联用 ,其多态信息含量明显提高 ,可克服 SNPs信息量不足的弱点 ;两个 SNPs均位于基因的 3′非翻译区 。

人恶性肿瘤中染色体9p21-p22区带的杂合性丢失

人类恶性肿瘤中常发生染色体杂合性丢失，从而丢失抑癌基因的某一个等位基因。人类９号染色体特别是该染色体的９ｐ２１－ｐ２２区带，在多种肿瘤中都存在着染色体的杂合性丢失。在定位克隆抑癌基因的过程中，对肿瘤中高频率染色体杂合性丢失的分析是对抑癌基因进行定位并最终发现和克隆该类基因的先决条件之一。

精细定位和克隆9p21-22区域内鼻咽癌候选抑瘤基因

目的：进一步精细限定鼻咽癌９ｐ２１－２２区域等位基因杂合性丢失的频率和范围，筛选和克隆其共同缺失区内鼻咽癌相关的候选抑瘤基因。方法：应用１１个定位于 ９ｐ２１－２２区域的高密度微卫星位点，检测 ２５例低分化鼻咽癌患者的杂合性丢失，确定其共同缺失区；用ＲＴ－ＰＣＲ和Ｎｏｒｔｈｅｒｎ筛出在鼻咽癌细胞株ＨＮＥ１和鼻咽癌活检组织中表达下调的、定位于共同缺失区内的 ３’末端ＥＳＴｓ（Ｅｘｐｒｅｓｓ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ｔａｇｓ）；采用 ＲＡＣＥ技术和生物信息学资源克隆出候选ＥＳＴ的全长ｃＤＮＡ。结果： ２５例患者中有１７例（６８％）存在一个或多个位点的杂合性丢失，其中Ｄ９ｓ１６１（３５．０％，７／２０），Ｄ９Ｓ１６７８（３１．５％，６／１９），Ｄ９Ｓ２６３（３．３％，６／１８）和Ｄ９Ｓ１８５３（３３．３％，７／２１）四个紧邻位点的丢失频率相对较高，并发现六位患者在该四个位点表现为连续性缺失；筛选Ｄ９Ｓ１６１－Ｄ９Ｓ１８５３区域内２５个代表新基因的３’末端ＥＳＴｓ序列，发现一个ＥＳＴ（ｄｂＥＳＴ：２０８８２５）在鼻咽癌细胞株ＨＮＥ１及７３％（１１／１５）的活检组织中表达降低， Ｍｕｌｔｉｐｌｅ Ｔｉｓｓｕｅ Ｎｏｒｔ

3号染色体短臂21-22区域63个新基因在鼻咽癌组织中的差异表达

目的寻找与鼻咽癌发病密切相关的未知基因。方法对63个定位于3号染色体短臂21-22D3S1609-D3S1295区域的单拷贝并代表未知基因的EST簇进行网上克隆,在获取基因大片段或全长cDNA序列的基础上,应用半定量逆转录-聚合酶链反应检测63个未知基因在4种鼻咽癌细胞株、32例鼻咽部低分化鳞状细胞癌组织和16例鼻咽部慢性炎症组织中的表达状况。结果49个未知基因在鼻咽癌组织和鼻咽部慢性炎症组织间的表达水平无显著性差异;8个未知基因在鼻咽癌和鼻咽部慢性炎症组织中均不表达;2个未知基因在鼻咽癌组织中表达明显增强;4个未知基因在鼻咽癌组织中表达明显减弱,其中Hs.27566基因在鼻咽癌细胞和组织中均显著低表达或不表达。结论在染色体3p21-22D3S1609-D3S1295区域构建了63个未知基因在鼻咽癌的表达差异谱;筛选出6个在鼻咽癌组织中差异表达的未知基因。

云南高原地区汉族急性心肌梗死患者染色体9p21基因多态性分析

目的探讨云南高原地区汉族急性心肌梗死(AMI)患者染色体9p21基因多态性。方法选择500例AMI患者及350例无冠状动脉粥样硬化性心脏病(CAD)患者,采用Sequenom Mass Array系统基因分型观察两者染色体9p21的10个相关位点(rs10757274、rs10811656、rs1333042、rs1333048、rs1333049、rs2383206、rs2383207、rs4977574、rs7865618和rs944797)的基因多态性。结果染色体9p21的10个位点中,8个位点(rs10757274、rs10811656、rs1333042、rs1333048、rs1333049、rs2383206、rs4977574和rs7865618)的基因存在多态性变异,基因型在AMI及无CAD患者中均达到遗传平衡(P均>0.01)。rs1333048纯合子CC等位基因的OR为1.52(95%CI:1.05~2.19,P=0.027)。结论染色体9p21基因rs1333048的CC基因型是云南高原地区汉族人群AMI的危险基因型。

染色体9p21单核苷酸多态性与冠心病/心肌梗死相关性的研究进展

冠状动脉性心脏病(CAD)及其严重临床类型心肌梗死是当今社会造成人类死亡的首要原因,其病因复杂,目前研究认为CAD是由遗传因素和环境因素共同作用而发病的多基因遗传病.全基因组关联研究(GWAS)发现了许多与CAD相关的易感基因位点,其中染色体9p21多态性和CAD及心肌梗死相关性成为研究热点,但目前基因造成CAD高发的具体作用途径仍不清楚,对近年相关研究进展作一综述.

肾盂尿路上皮癌患者尿NMP22、TPS、CYFRA21-1、CA19-9的检测与评估

目的探讨尿液核基质蛋白22（nuclear matrix protein 22,NMP22）、组织多肽特异性抗原（tissue polypeptide-specific antigen,TPS）、CYFRA21-1、糖链蛋白19-9（carbohydrate antigen 19-9,CA19-9）对肾盂尿路上皮癌的诊断价值。方法回顾性分析山西省肿瘤医院2010年1月至2015年12月检测的至少两种上述尿液肿瘤标志物的患者资料,共218人次,包括肾盂尿路上皮癌63例（A组）、膀胱尿路上皮癌46例（B组）、非尿路上皮肿瘤的泌尿系其他疾病62例（C组）、A组行根治术后2年未复发47例（D组）,另有健康志愿者20例（E组）。比较各组尿NMP22、TPS、CYFRA21-1、CA19-9表达水平,并绘制受试者工作特征（receiver operating characteristic,ROC）曲线,计算ROC曲线下面积。结果 A组NMP22水平高于B组,差异有统计学意义（P=0.001）。A组与B组的TPS、CYFRA21-1、CA19-9水平差异无统计学意义（P〉0.05）。A组和B组的TPS、NMP22、CYFRA21-1、CA19-9水平均高于C组、D组、E组,差异有统计学意义（P〈0.05）。C组、D组及E组的NMP22、TPS、CYFRA21-1、CA19-9水平差异无统计学意义（P〉0.05）。A组中NMP22、TPS、CYFRA21-1、CA19-9水平在不同病理分级、临床分期、肿瘤大小、是否肾积水等的差异无统计学意义（P〉0.05）。A组NMP22、TPS、CYFRA21-1、CA19-9的诊断准确率高于尿脱落细胞学检查,差异有统计学意义（P〈0.05）。四种肿瘤标志物的ROC曲线下面积为0.7~0.9,诊断效能中等,最高者为NMP22与CYFRA21-1的组合,为0.884。结论尿液NMP22、TPS、CYFRA21-1、CA19-9对肾盂尿路上皮癌的诊断有帮助,诊断效能中等,但它们对肾盂癌肿瘤分期和病理分级的预测、术后监测、预后判断等方面的作用有待进一步研究。

miR-21-5p调控MMP-9对急性缺血性卒中认知障碍的影响

目的探讨微小RNA-21-5p(miR-21-5p)调控基质金属蛋白酶-9(MMP-9)对急性缺血性卒中(AIS)后认知障碍的影响。方法选取2020年10月至2021年10月,河北医科大学第二医院神经内科收治住院的AIS患者58例。入院后收集患者的人口学、既往史、美国国立卫生研究院卒中量表(NIHSS)评分等资料,对血清MMP-9、miR-21-5p进行检测。6个月后对患者进行随访,使用蒙特利尔认知评定量表(MoCA)评估认知功能,并将其分为两组:卒中后认知障碍组(PSCI)和卒中后非认知障碍组(N-PSCI)。探讨急性期miR-21-5p、MMP-9的关系,以及MMP-9在卒中后认知障碍中的作用。结果血清miR-21-5p与MMP-9存在相关性(r=-0.426,P=0.001),线性回归分析结果:β=-0.15,P=0.001。PSCI患者miR-21-5p低于N-PSCI组患者(P<0.05);PSCI发病率62.1%(36/58)。两组患者年龄、受教育年限比较差异有统计学意义(P<0.05)。采用受试者工作特征(ROC)曲线绘制图形,通过计算约登指数,寻找MMP-9最佳预测点。结果曲线下面积(AUC)为0.728,95%CI为0.591~0.866,最佳分界点为140.70,敏感度为0.594,特异性为0.850(P=0.006)。结论AIS患者miR-21-5p抑制血清MMP-9的表达。急性期MMP-9水平升高与PSCI相关,对PSCI有一定的预测价值。

染色体9p21单核苷酸多态性与脑梗死的相关性分析

目的：探讨染色体9p21的单核苷酸多态性（SNP）与脑梗死易感性的关系。方法应用聚合酶链反应-高温连接酶检测反应（ PCR-LDR）检测528例非心源性脑梗死患者（375例合并颈动脉斑块，153例无颈动脉斑块）、258名正常对照者的染色体9p21．3区带 rs10757278、rs1333049、rs2383206、rs1537378、rs4977574和rs23832076个位点的SNP。同时采用多元Logistic回归分析和χ2检验对统计有意义的位点分析基因交互作用，计算比值比（ OR）和95％可信区间（ CI）。结果在45-65岁的中年人群中，rs2383206和rs4977574的G等位基因在脑梗死无颈动脉斑块组的携带人数（分别为55．0％和54．2％）明显多于正常对照组（45．9％和44．4％，P＝0．024、0．015）；而同时含有rs2383206和rs49775742个位点GG纯合突变基因型的个体发生脑梗死的风险可能是同时携带非GG纯合突变基因型（GA＋AA）个体的1．733倍。6个位点之间都存在强的连锁不平衡关系。结论染色体9p21区带中rs2383206、rs49775742个位点的SNP与急性脑梗死的发生易感性可能有一定关联。

冠心病患者9p21染色体位点CDKN2A、CDKN2B、MTAP及ANRIL的表达变化

目的探讨冠心病患者9p21染色体位点CDKN2A、CDKN2B、MTAP及ANRIL的表达变化。方法选取冠心病患者30例为病例组,以同期体检的健康人群30例为对照组。采集两组患者空腹抗凝静脉血2 m L,采用实时荧光定量PCR法测定9p21染色体位点CDKN2A、CDKN2B、MTAP和ANRIL的mRNA表达水平,并比较差异。结果与对照组相比,病例组的外周血9p21染色体区域的CDKN2A、CDKN2B mRNA表达水平降低(P均<0.05),MTAP mRNA表达水平升高(P<0.05),ANRIL mRNA表达水平无统计学差异(P>0.05)。结论冠心病患者9p21染色体位点CDKN2A、CDKN2B表达下降,MTAP表达升高。

染色体9p21基因多态性与云南彝族人群心肌梗死的相关性研究

目的 探讨9p21单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）与云南彝族心肌梗死（myocardial infarction,MI）的相关性。方法 选择110例冠状动脉造影证实的MI患者和110例对照组作为研究对象,应用DNA直接测序法,检测9p21的基因位点和SNP分型及分析。结果 心肌梗死组和对照组染色体9p21上10个基因位点中有9个位点达到了Hardy-Weinberg平衡,其中rs1333049 GG基因型频率在病例组和对照组分别为30.91%和18.18%,G等位基因频率分别为58.3%和44.9%,2组比较差异有统计学意义（P〈0.05）;rs2383206 GG基因型频率分别为31.82%和18.18%,G等位基因频率分别为55.3%和41.1%;2组间比较差异有统计学意义。结论 9p21位点rs1333049、rs2383206的多态性与云南彝族MI有关。

9p21染色体位点基因表达水平与冠心病病情发展的相关性

目的观察9p21染色体位点相关基因与冠心病病情发展相关性。方法采用实时荧光PCR扩增法分别测定稳定型心绞痛患者(30例)、不稳定型心绞痛患者(30例)、急性心肌梗死患者(30例)、健康人群患者(30例)的外周血9p21染色体位点相关基因[细胞周期依赖性激酶抑制基因(CDKN)2A、CDKN2B、甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)和INK4基因座中反义非编码RNA(ANRIL)]表达水平,分析不同冠心病病情分期患者及健康人群外周血9p21染色体位点相关基因表达差异。结果与健康人群组比较,稳定型心绞痛组、不稳定型心绞痛组和急性心肌梗死组患者外周血9p21染色体位点CDKN2A、CDKN2B基因表达水平显著降低(均P<0.05),而MTAP基因表达水平显著提升(P<0.05),而ANRIL基因表达差异无统计学意义(P>0.05)。同时稳定型心绞痛组、不稳定型心绞痛组和急性心肌梗死组患者外周血9p21染色体位点CDKN2A、CDKN2B、MTAP基因表达水平两两比较差异均有统计学意义(均P<0.05),ANRIL基因表达水平两两比较差异均无统计学意义(均P>0.05)。结论 9p21染色体区域的CDKN2A、CDKN2B、MTAP基因与冠心病发生密切相关,且随着冠心病病情发展,9p21染色体区域的CDKN2A、CDKN2B、MTAP基因表达与正常健康人群差异越明显,9p21染色体位点CDKN2A、CDKN2B、MTAP基因表达水平可能是汉族冠心病人群临床诊治的潜在靶基因。

长链非编码RNAMIR22HG和微RNA-9-3p在骨关节炎病人血清中的表达及与病情严重程度的相关性

目的 探究长链非编码RNA(lncRNA)MIR22HG和微RNA-9-3p(miR-9-3p)在骨关节炎(OA)病人血清中的表达及与病情严重程度的相关性。方法 选取2020年10月至2021年10月在南充市中医医院确诊为OA的病人120例,作为OA组,60例体检健康人群作为对照组;采用实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应(qRT-PCR)检测血清lncRNA MIR22HG和miR-9-3p的表达水平;Pearson法分析lncRNA MIR22HG和miR-9-3p的相关性以及二者与视觉模拟(VAS)评分、美国特种外科医院膝关节评分(HSS)以及西安大略和麦马斯特大学骨关节炎指数可视化量表(WOMAC)评分的相关性;绘制受试者操作特征(ROC)曲线分析lncRNA MIR22HG和miR-9-3p对OA的诊断价值。结果 OA组的血清中lncRNA MIR22HG表达水平显著高于对照组(1.48±0.25比1.01±0.22),miR-9-3p的表达水平显著低于对照组(0.72±0.13比1.05±0.12)(P<0.05);相关性分析显示,lncRNA MIR22HG和miR-9-3p的表达水平呈负相关关系(P<0.05);KLⅣ级血清lncRNA MIR22HG的表达水平、VAS评分、WOMAC评分显著高于KLⅢ级和KLⅡ级,KLⅢ级显著高于KLⅡ级(P<0.05),KLⅣ级血清miR-9-3p的表达水平、HSS评分显著低于KLⅢ级和KLⅡ级,KLⅢ级显著低于KLⅡ级(P<0.05);OA病人lncRNA MIR22HG的表达水平与VAS评分、WOMAC评分均呈正相关,与HSS评分呈负相关(P<0.05);miR-9-3p表达水平与VAS评分、WOMAC评分均呈负相关,与HSS评分呈正相关(P<0.05);二者联合诊断的AUC高于lncRNA MIR22HG、miR-9-3p单独诊断的AUC值(Z=2.22,P=0.012;Z=1.43,P=0.025)。结论OA病人血清中lncRNA MIR22HG表达水平显著升高,miR-9-3p表达水平显著降低,二者与OA病情严重程度密切相关,且对OA具有一定的诊断价值。

胶质瘤中染色体9p21区域D9S319座位的杂合性缺失研究

目的 :探讨染色体 9p2 1区域D9S319座位的杂合性缺失 (LOH)在胶质瘤的发生发展中的作用。方法 :应用微卫星多态标记_PCR法对 2 5例胶质瘤组织进行检测。结果 :2 1例可提供LOH分析信息 ,杂合性缺失率为 5 7% (12 / 2 1) ,其中胶质母细胞瘤、间变型星形细胞瘤、星形细胞瘤分别为 70 % (7/ 10 )、 43% (3/ 7)、 5 0 % (2 / 4)。结论 :染色体 9p2 1区域杂合性缺失与胶质瘤发生发展密切相关 ,该区域可能存在抑癌基因 ,抑癌基因失活将影响胶质瘤的发生发展。

染色体9p21上rs10757278单核苷酸多态性与冠心病的相关性研究

目的:研究染色体9p21上rs10757278位点的基因多态性在昆明汉族人群冠心病(CHD)患者中的分布特征,探讨其与CHD发病的相关性。方法:选择150例冠状动脉造影证实的CHD患者为冠心病组和150例对照组为研究对象,采用聚合酶链式反应(PCR)对rs10757278位点进行单核苷酸多态性(SNP)分型及分析。结果:冠心病组和对照组rs10757278 GG基因型频率分别为36.0%和22.7%,G等位基因频率分别为58.0%和36.0%,两组间比较,差异具有统计学意义(P<0.05)。Logistic回归分析显示,rs10757278 GG基因型为CHD的危险基因型。结论:染色体9p21的rs10757278单核苷酸多态性位点是昆明高原地区汉族人群冠心病发生的易感位点。

46,XY,t(5;9)(p15;q22)世界首报染色体异常核型分析

本文对自然流产夫妇进行了外周血染色体核型分析,并通过G带和高分辨技术确定了世界首报染色体异常核型的畸变类型为相互易位。讨论了畸变机理和治疗措施。

9p21染色体单核苷酸多态性与冠心病相关性的研究进展

冠心病是全世界范围内导致死亡的疾病,全基因组关联研究(GWAS)发现了许多与冠心病相关的易感基因位点。本文综述9p21染色体单核苷酸多态性(SNP)和冠心病的关系,9p21风险基因的表达不仅增加冠心病的发病率,同时提高心肌梗死的发病率,并与早发冠心病和再发心肌梗死相关联,但目前基因造成冠心病高发的具体作用途径仍不清楚。

浙江温州地区人群染色体9p21上rs1333049位点的单核苷酸多态性分布与冠心病的相关性

目的研究浙江温州地区汉族人群中染色体9p21上的rs1333049位点上的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与冠心病的相关性。方法对冠心病组(至少1支主要冠状动脉内径狭窄≥50.00%)181例和对照组173例,采用聚合酶链反应和基因测序方法,检测染色体9p21上rs1333049位点基因多态性。结果 3种基因型均可在rs1333049位点上检测到,并且其基因型的分布亦符合Hardy-Weinberg平衡定律。冠心病组rs13330149位点的CC、CG基因型分布及C等位基因频率均高于对照组,差异有统计学意义(均P<0.01)。结论 rs1333049位点G/C基因的多态性与冠心病发病相关,其中的C等位基因亦可能是浙江温州地区汉族人群冠心病患者的易感性标志之一。

Detailed Deletion Mapping of Chromosome 9p21-22 in Nasopharyngeal Carcinoma

Objective: To further refine the extent of deletion on chromosome 9p21-22 in nasopharyngeal carcinoma (NPC) and provide evidence for discovering new tumor suppressor gene. Methods: Loss of heterozygosity (LOH) on chromosome 9p21-22 was analyzed in 25 paired blood and tumor samples by using 11 high-density microsatellite polymorphic markers. Results: 17 of 25 cases (68.0%) showed LOH at one or more loci. Higher frequencies of LOH were found at four loci: D9S161 (35.0%), D9S1678 (31.5%), D9S263 (33.3%) and D9S1853 (33.3%), where 6 cases had a contiguous stretch of allelic loss. Conclusion: The minimal common region of deletion might be defined between D9S161 and D9S1853 (estimated about 2.7 cM in extent) at 9p21.1, suggesting that inactivation of one or more tumor suppressor genes located in this region may be an important step in NPC.

重症急性胰腺炎患者外周血miR-21-3p、miR-22-3p与并发肺损伤的相关性

目的探讨重症急性胰腺炎(SAP)患者外周血miR-21-3p、miR-22-3p与并发肺损伤(ALI)的相关性。方法选择2017年7月~2020年2月本院收治的124例SAP患者作为研究对象,按照是否合并ALI分为单纯SAP组(78例)、SAP合并ALI组(46例);另选择同期体检的50例健康志愿者作为对照组。采集患者外周静脉血,采用实时荧光反转录定量聚合酶链式反应检测miR-21-3p、miR-22-3p表达,收集SAP患者临床资料。结果单纯SAP组、SAP合并ALI组患者外周血miR-21-3p、miR-22-3p显著高于对照组(P<0.05);SAP合并ALI组高于单纯SAP组(P<0.05)。不同CT分级、伴有胸水与否、急性生理学与慢性健康状况Ⅱ(APACHEⅡ)评分患者外周血miR-21-3p、miR-22-3p水平比较差异具统计学意义(P<0.05);CT分级为E级、合并胸水、APACHEⅡ评分≥15分患者外周血miR-21-3p、miR-22-3p水平高于CT分级为D级、无胸水、APACHEⅡ评分<15分的患者(P<0.05)。Logistic回归分析显示,CT分级、胸水、外周血miR-21-3p、miR-22-3p表达水平与SAP患者并发ALI相关(P<0.05)。外周血miR-21-3p、miR-22-3p诊断ALI曲线下面积(AUC)为0.770、0.812,当截点值为2.668、1.815时,约登指数最大;两者联合诊断AUC为0.869。结论SAP患者外周血miR-21-3p、miR-22-3p与ALI并发密切相关,临床可检测其水平明确SAP程度及是否发生ALI,对指导临床治疗具有重要价值。