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新疆柔叶真藓居群18S核糖体RNA基因序列分析
1
作者
阿丽娅.哈斯木
库热西.马木提汗
买买提明.苏来曼
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第10期3941-3948,共8页
柔叶真藓(Bryum cellulare Hook.)是真藓属植物。目前对分布在新疆阿尔金山国家级自然保护区不同地理居群的柔叶真藓遗传多样性研究还未见报道。本研究以采自于该保护区四个不同地理居群的柔叶真藓为样品对其18S核糖体RNA基因(18S r DNA...
柔叶真藓(Bryum cellulare Hook.)是真藓属植物。目前对分布在新疆阿尔金山国家级自然保护区不同地理居群的柔叶真藓遗传多样性研究还未见报道。本研究以采自于该保护区四个不同地理居群的柔叶真藓为样品对其18S核糖体RNA基因(18S r DNA)序列进行分析。结果表明:样本测序拼接完成后的序列长度在1 712~1 761 bp之间,进行空位剪切及比对后长度为1 698 bp。整个序列中有三个碱基位置上的差异,其中变异位点有12个,A、T、C、G的平均含量比率分别为24%、27%、23%、26%。再通过从NCBI的Gen Bank进行同源性搜索得到的相似性序列均属于真藓属,增大了序列的可靠性。将与其序列结合检测遗传距离及构建系统进化树,进行同源性分析可知,这种差异由于18S核糖体RNA基因序列本身的特性,表明种群的遗传距离与地理环境和位置有一定的相关性,其中在环境的变化及变异的可能性对四个不同地理居群的柔叶真藓植物有影响。
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关键词
阿尔金山国家级自然保护区
柔叶真藓
18S核糖体RNA基因
原文传递
题名
新疆柔叶真藓居群18S核糖体RNA基因序列分析
1
作者
阿丽娅.哈斯木
库热西.马木提汗
买买提明.苏来曼
机构
新疆师范大学生命科学学院
新疆大学生命科学与技术学院
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第10期3941-3948,共8页
基金
国家自然科学基金项目(31460048
31660052)资助
文摘
柔叶真藓(Bryum cellulare Hook.)是真藓属植物。目前对分布在新疆阿尔金山国家级自然保护区不同地理居群的柔叶真藓遗传多样性研究还未见报道。本研究以采自于该保护区四个不同地理居群的柔叶真藓为样品对其18S核糖体RNA基因(18S r DNA)序列进行分析。结果表明:样本测序拼接完成后的序列长度在1 712~1 761 bp之间,进行空位剪切及比对后长度为1 698 bp。整个序列中有三个碱基位置上的差异,其中变异位点有12个,A、T、C、G的平均含量比率分别为24%、27%、23%、26%。再通过从NCBI的Gen Bank进行同源性搜索得到的相似性序列均属于真藓属,增大了序列的可靠性。将与其序列结合检测遗传距离及构建系统进化树,进行同源性分析可知,这种差异由于18S核糖体RNA基因序列本身的特性,表明种群的遗传距离与地理环境和位置有一定的相关性,其中在环境的变化及变异的可能性对四个不同地理居群的柔叶真藓植物有影响。
关键词
阿尔金山国家级自然保护区
柔叶真藓
18S核糖体RNA基因
Keywords
Altun mountain national nature reserve, Bryum cellulare Hook., 18S ribosomal RNA gene
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
新疆柔叶真藓居群18S核糖体RNA基因序列分析
阿丽娅.哈斯木
库热西.马木提汗
买买提明.苏来曼
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2017
0
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