云南省2株柯萨奇病毒A12型VP1区基因特征分析

目的:了解云南省手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)监测中分离到的2株柯萨奇病毒A12型(Coxsackievirus A12,CV-A12)VP1区基因序列特征。方法:对HFMD监测中获得的临床标本开展RD细胞上的病毒分离培养,通过荧光定量PCR和测序方法鉴定为CV-A12的毒株,进一步对其VP1区进行序列测定,并搜集GenBank中CV-A12其他型别的参考株,共同构建系统进化树,分析CV-A12的VP1区基因特征。结果:获得2株CV-A12分离株的VP1区序列(888 bp),与2018年的云南参考株毒株同源性最高,其VP1区氨基酸在多个位点上与其他云南参考株存在特异突变。结论:云南省HFMD标本中发现的CV-A12已经发生地区特异性VP1基因变异。

青岛市柯萨奇病毒A12型VP1区基因特征及相关重症手足口病临床表现

目的 了解2011—2016年柯萨奇病毒A12型（CV-A12）青岛分离株的基因特征及所致重症手足口病临床特点.方法 人横纹肌肉瘤（human rhabdomyosarcoma,RD）细胞和人喉癌（human laryngeal carcinoma,Hep-2）细胞分离自2011—2016年青岛地区儿童手足口病及部分疱疹性咽峡炎和流感样病例咽拭子标本中非EV-A71、非CV-A16毒株,半巢式反转录PCR扩增肠道病毒部分VP1序列,结合序列分析鉴定CV-A12毒株;对全部CV-A12分离株进行VP1基因全长序列扩增及基因序列测定,以MEGA7.0软件进行遗传进化及分子特征分析;收集CV-A12所致重症手足口病临床资料并分析其特征.结果 青岛市手足口病、疱疹性咽颊炎和儿童流感样病例中CV-A12分离率分别为0.3％（18/6798）、1.2％（2/169）和0.1％（1/676）.CV-A12感染所致手足口病在2013年及以前以轻症病例为主（84.6％,11/13）,2013年以后以伴有神经系统症状的住院重症病例为主（100％,5/5）.VP1区遗传进化分析显示,全球CV-A12分为A、B两个基因型,2011—2016年青岛地区毒株均属于B基因型且88.9％（16/18）位于B2亚型;2013年后致手足口病重症病例毒株均为B2亚型B2b分支毒株.结论 CV-A12是青岛儿童手足口病、疱疹性咽颊炎和流感样疾病的病原之一;B2亚型毒株为近年来青岛CV-A12主要流行毒株,其感染所致手足口病能导致神经系统损害.

2011-2020年福建省手足口病相关柯萨奇病毒A组8型和12型分子流行病学特征分析

目的研究福建省2011-2020年手足口病(hand foot and mouth disease,HFMD)相关柯萨奇病毒A组8型(CVA8)和12型(CVA12)型的流行病学及全基因组序列特征。方法对2011-2020年福建省疾病预防控制中心实验室收集的HFMD相关CVA8和CVA12病例进行流行病学特征分析;采用MegaⅩ和Simplot 3.5.1等软件对病毒VP1区和全基因组序列遗传进化分析和重组分析。结果2011-2020年福建省HFMD相关CVA8和CVA12感染各7例。获得4株CVA8完整VP1基因福建分离株,其中2株属于D基因型,2株属于E基因型;获得CVA12完整VP1基因福建分离株6株,其中2株属于B1基因亚型,4株属于B2基因亚型。比对CVA8和CVA12全基因组序列与其原型株核苷酸相似性分别为68.7%~77.7%和69.1%~78%。结合P2和P3区进化树和重组分析结果显示,CVA12-2011FJQZ168在P3区与EVA71可能发生重组,CVA8-2011FJQZ146在P2-P3区与CVA7、在P3区与CVA12-2011FJQZ168可能发生重组。结论2011-2020年福建省发现散发CVA8和CVA12感染相关手足口病病例,CVA8和CVA12福建分离株在系统进化树均存在不同的进化分支,在非结构区域存在疑似重组现象。需进一步加强对CVA8和CVA12的监测。