标签指导的多尺度图神经网络蛋白质作用关系预测方法

提出了一种标签指导的多尺度图神经网络蛋白质作用关系(label guided multi-scale graph neural network protein-protein interactions,LGMG-PPI)预测方法,不仅增强了数据的表征能力,还引入了标签信息指导学习。首先,通过图数据增强得到多尺度图表示,并将多尺度图表示输入图神经网络得到多尺度蛋白质表示,再引入对比学习进一步提高蛋白质表征能力;其次,构造自学习的标签关系图,学习标签之间的关系,得到标签的特征表示;最后,通过标签的特征表示,对蛋白质作用关系的预测进行指导。在3个公开的数据集上进行了实验,与最优基准方法相比,LGMG-PPI方法具有更好的性能,相比最优基准方法,在SHS27k、SHS148k和STRING这3个数据集上的micro-F1分数分别提升了2.01%、0.94%和0.93%。