一个基于同位素标记实验的代谢通量估计高效率算法

基于碳同位素标记实验的代谢通量分析(13CMFA)是代谢工程中的重要方法,它可以对微生物中心代谢网络中的所有代谢通量进行精确量化分析。13CMFA通过逐步拟合同位素标记状态测量数据对胞内的代谢通量进行估计,这对应于一个测量结果和计算结果之间误差平方和极小化的优化问题,该优化问题具有非线性、带有众多约束条件和存在多个局部极小点等特点,如何高效地求解是13CMFA中的难点,也是实现通量精确估计的关键。论文在对目标问题解空间的特性分析基础上,将空间知识引入到搜索过程中,针对通量估计问题提出了一个进化优化算法。实验结果和分析表明,该算法较普通进化算法具有更快的收敛速度和更好的全局寻优能力。

标记免疫实验技术和分析仪器

本文介绍了各种标记免疫实验技术的原理和以这些原理为基础的免疫化学分析仪，如光度计，荧光计，荧光偏振仪，时间分辨荧光计和化学发光计等。列举了有代表性的仪器系统作为实例。最后简单讨论了如何评价和选择免疫分析仪。

互联网上机械设计虚拟实验室设计型实验研究

互联网上机械设计虚拟实验是机械设计课程课堂教学过程的有益补充。设计型实验项目的实现需要建立基于XML的机构及其各零部件三维参数化数据库,并基于XML在几何数据描述表达上及VRML在产品可视化上的特点和优点,构造一个基于B/W/D(浏览器/网络/设计)结构的、能提供交互功能的三维虚拟实验系统。实践表明方法切实可行。

分布式光纤在相似模型实验中的铺装与定位研究

为了解决分布式光纤在相似模型实验中的铺装方法以及光纤位置与被测模型的对应关系问题,提高测量结果的准确性,通过描述一个完整的分布式光纤测量相似模型变形的实验实例,给出了一种相似材料模型实验中分布式光纤的铺装方法,详细表述了铺装前光纤标记方法和整个铺装过程。给出了温度标记定位实验的详细步骤,并对定位实验结果及误差进行了详细分析,确定了光纤在模型中的实际位置,且定位误差不超过5 cm,定位精度较高。为采用分布式光纤测量模型实验内部变形的研究者提供了一种可借鉴的分布式光纤铺装、定位及分析方法。

典型抗生素对湿地反硝化甲烷厌氧氧化的影响

选取甲烷排放通量较高并且受喹诺酮类抗生素(QNs)污染较严重的白洋淀湿地为研究对象,通过开展13C标记的微宇宙实验,研究典型QNs包括:氧氟沙星(OFL)、诺氟沙星(NOR)和氟甲喹(FLU)对白洋淀湿地DAMO过程的短期影响.结果表明:3种QNs均促进了微生物DAMO过程,且对DAMO的促进效果表现为OFL>NOR>FLU;除添加2ng/g的OFL对DAMO反应速率潜势的影响基本可以忽略外,添加其他浓度(20,200,2000ng/g)的OFL均促进了白洋淀湿地的DAMO过程,并且这种促进作用总体呈现出剂量效应;进一步分析QNs对NO_(2)^(-),NO_(3)^(-)分别驱动的DAMO的影响发现,200ng/g的NOR抑制了由细菌驱动的以NO_(2)^(-)为电子受体的DAMO过程(nitrite-DAMO),但更大程度地促进了由古菌驱动的以NO_(3)^(-)为电子受体的DAMO过程(nitrate-DAMO),最终表现为QNs对NO_(3)^(-)和NO_(2)^(-)共同驱动的总体的DAMO过程的促进作用.

CaO固硫过程中Ca^(2+)在CaSO_4产物层内扩散的研究

应用标记实验技术 ,研究CaO固硫反应过程中产物层扩散控制阶段的反应机理 .利用扫描电镜和反射式光学显微镜 ,对压制烧结并带有Pt标记的CaO样品在固硫反应前后的形貌变化观察 ,结果表明 :经过较长时间的固硫反应后 ,在Pt标记层外表面形成一层覆盖物 ,XRD分析结果证明该覆盖物是CaSO4.利用电化学综合测试仪测量了CaO及CaSO4在高温下的电导率 ,结果表明在 10 0 0℃时CaSO4的电导率达到了 10 -3 数量级 ,说明在高温下CaSO4内Ca2 + 有较高的离子迁移特性 .根据标记实验、电导率测试的结果和CaO掺杂体系的固硫动力学数据的分析认为 :CaO固硫反应在后期的扩散层控制阶段的主要反应是Ca2 + 通过CaSO4产物层扩散至CaSO4外表面与SO2 和O2 进行反应 ,生成CaSO4,而不是SO2 和O2 气体通过CaSO4产物层向内扩散 ,在颗粒内部与CaO发生固硫反应 .

内流性钾通道2.1蛋白在大鼠脊髓和小脑的分布

目的:内流性钾通道(Kir)2.1蛋白在大鼠脊髓和小脑的分布。方法:免疫荧光组织化学和免疫荧光双标记。结果:在脊髓灰质前角的运动神经元和白质的星形胶质细胞呈现 Kir2.1免疫反应活性强阳性。少数少突胶质细胞呈现Kir2.1和GS共存。在小脑蒲肯野氏细胞及纤维呈Kir2.1免疫活性强阳性。双标记显示近蒲肯野氏细胞旁的少突胶质细胞的Kir2.1蛋白和GS蛋白共存。结论:脊髓和小脑灰质和白质中的Kir2.1表达不一,这种分布可能与保持细胞外的K^+平衡、促进K^+的内流维持细胞兴奋性有重要关系。

DNA半保留复制和半不连续复制的提出与确立

笔者介绍了DNA的半保留复制和半不连续复制提出与确立的过程:沃森和克里克提出DNA半保留复制的思路;Meselson和Stahl的实验验证;冈崎提出不连续复制的思路,并通过步步深入的实验证实。

螺旋藻全蛋白与家族分类

采用相对和绝对定量同位素标记实验的方法对螺旋藻全蛋白进行定性分析,并选用合理的统筹归类方法对其进行实用性归类。结果表明,共定性检测到螺旋藻蛋白质数为2 085个,其中已知蛋白1 562个;通过序列分类法将869个蛋白共分成233个蛋白超家族与87个(均为已知蛋白)蛋白家族;根据蛋白的性质、结构和功能可分成7大类,发现蛋白超家族在抗氧化、抗癌、抗肿瘤、免疫调节等方面具有重要功能,可被广泛应用于食品、保健和医药等领域。由此可见,螺旋藻活性蛋白具有极大的开发前景。

基于强连通分量的^13C MFA计算模型稳定性判断

基于碳同位素标记实验的代谢通量分析，是代谢工程中一种强大的定量分析工具。^13C MFA在进行定量分析时，需要给定代谢网络及其对应的碳原子转移网络，同时为了保证计算的正确性和可靠性，要求所给定的碳原子转移网络中不能含有陷阱（trap）。本文基于有向图中强连通分量的概念，给出了trap的一种形式化定义，并利用一种基于深度优先搜索的图论算法，实现了对trap的自动检测。实验结果表明，该算法能够得到正确可靠的结果。

一种新的蛋白质亚细胞定位预测训练集构造方法

设计了一种新的蛋白质亚细胞定位预测训练集构造方法.该方法针对传统预测方法缺乏足够的实验标记数据的问题,基于主动学习策略从非实验标记蛋白质数据中主动选择有效数据,并与原有的实验标记数据共同训练预测模型,以提高基准分类器的预测精度.结合支持向量机分类器,该方法在病毒蛋白质独立测试集上进行了预测实验,测试结果表明,该方法能够有效地提高基准分类器的预测能力,性能优于现有的病毒蛋白质预测系统.

生物芯片研究现状及应用前景

生物芯片(Biochip)是以预先设计的方式将大量的生物讯息密码(寡核苷酸、cDNA、基因组DNA、蛋白质等)固定在玻片、硅片等固相载体上组成的密集分子阵列,可分为基因芯片、蛋白质芯片、芯片实验室三类。生物芯片技术的本质是生物信号的平行分析,它利用核酸分子杂交、蛋白分子亲和原理,通过荧光标记技术检测杂交或亲和与否,再经过计算机分析处理可迅速获得所需信息。在医学、分子生物学等领域,生物芯片技术以其高效、高信息量的优势,显现出巨大的应用价值和商业市场,其发展前景非常乐观。

胆道闭锁早期诊断的研究进展

胆道闭锁(BA)是以肝内外胆管进行性纤维化为特征的小儿外科常见严重疾病,如能在早期明确诊断并且施行手术可显著改善患儿预后,否则预后大多不良,因此胆道闭锁的早期诊断尤为重要。术中胆道造影是诊断BA的金标准,但是创伤性较大,目前仍然需要非损伤性的、特异性和敏感性高的指标来筛查诊断BA。本文将从血液、尿液来源的实验室标记物、粪便比色卡和超声检查进行综述。

基因实验可以改善乳腺癌治疗

一项国际性研究表明,与乳腺癌有关的70个基因表达检查可以帮助医生确定患者乳腺癌复发或死亡的危险。研究涉及了307例高危险组和低危险组的乳腺癌患者,分组是基于患者70个基因标记实验和制定危险评估标准的软件程序所取得的评分,研究人员对这些患者随访了13.6年。研究人员发现,这项基因标记实验比那套软件程序能更准确地预测癌的复发和死亡。这项研究也推断出基因实验可以涵盖更多的预测信息提供给传统的癌风险分类。阿姆斯特丹荷兰癌症研究所的科学家报告显示。

NCI资助17个中心进行生物标记发现

美国国家癌症研究所(NCI)颁发980万美元给属于早期检测研究网络(EDRN)的17个生物标记开发实验室，作为他们第一年的经费资助。新资助实验室的任务是发现与主要癌症相关的新生物标记，以及鉴定什么样的生物标记的制品能最好的检测癌症的存在或风险。EDRN的其他部门包括生物标记验证实验室、临床和流行病学中心及数据管理和综合中心。鉴于癌症是一种日益威胁人类生命安全和健康的危险疾病，

^(13)C代谢通量估计的量子粒子群优化算法

^(13)C标记实验的代谢通量分析(^(13)CMFA)是探索代谢网络的重要途径。^(13)C通量估计是以碳富集度平衡为条件的全局优化问题,带有众多约束条件和存在多个局部极小点等特点,如何高效地求解是^(13)C MFA中的难点,也是实现通量精确估计的关键。量子粒子群优化算法显著特点是控制参数少,设置简单,具有较好的全局搜索能力,适应于通量估计。本文提出量子粒子群优化算法结合最小二乘计算求解噪音环境下的环磷酸戊糖代谢网络的通量,以带约束的最小化问题为目标优化函数,仿真实验验证了量子粒子群优化算法是1种有效的通量估计分析算法。

姜黄素对人过氧化物酶体增殖物激活受体γ_1激活作用的研究

目的测定姜黄素(CUR)与人过氧化物酶体增殖物激活受体γ_1(h PPARγ_1)的亲和力和内在活性,确定CUR是否为h PPARγ_1的天然配体。方法通过放射性标记配基竞争结合实验和反式激活报告基因分别检测CUR与h PPARγ_1的结合活性和功能活性。结果 CUR与h PPARγ_1结合的半数抑制浓度(IC_(50))为(8.82±0.74)μmol/L,抑制常数(Ki)为0.72μmol/L;CUR对h PPARγ_1的半数有效浓度(EC_(50))为7.3μmol/L,最大活性倍数(E_(max))为43.3。结论 CUR不仅能与h PPARγ_1受体结合,而且能激活h PPARγ_1,可能是h PPARγ_1的天然配体。