三种自然变异构树的转录组学分析初探

构树在我国分布广泛,变异度高,野生构树在各地由于气候地理条件的差异在树皮类型上发生变化,优良性状亟待挖掘,其分子和遗传学研究较少。研究中,使用第2代测序和全长转录组测序来发现白树皮、红树皮和条纹树皮构树之间的差异。共鉴定了9172个全长转录本,94.86%的全场转录组序列从至少一个数据库中成功注释。共检测到43475个基因,进行了3次比较,上调的差异基因与蛋白激酶信号通路-植物和植物病原体的相互作用有关,下调的差异基因参与光合作用、抗坏血酸和阿糖代谢。部分序列的表达水平通过定量实时PCR法得到进一步验证。这些发现初步阐明了白皮、红皮和条纹皮构树在转录水平上的差异,为构树新品种育种奠定了基础。