一株栖稻假单胞菌海南变种的发现与鉴定

目的:鉴定从肺结核患者血液中分离出的病原菌的生物学性状并鉴定至种。方法:按常规鉴定方法进行细菌表型特征的鉴定;提取细菌基因组DNA,使用16SrDNA通用引物,做16SrDNAPCR扩增及序列测定。结果:所分离的病原菌的表型特征基本符合栖稻假单胞菌鉴定标准,但也有诸多不同之处,故称为栖稻假单胞菌海南变种;经16SrDNA扩增及测序结果在NCBI上比对结果为栖稻假单胞菌。结论:海南省首次发现栖稻假单胞菌海南变种引起的菌血症,应引起医务人员及有关部门的重视,变异的核苷酸序列定位,有待进一步研究。

一株栖稻假单胞菌NYCS1-5的鉴定及其对玉米的耐盐促生功能

本试验针对实验室前期保藏的菌株NYCS1-5进行了细胞和菌落形态鉴定、生理生化分析、耐盐促生功能研究、16S rDNA系统发育树分析,鉴定此菌株为栖稻假单胞菌(Pseudomonas oryzihabitans)。经研究,栖稻假单胞菌NYCS1-5同时具备较强的解磷和溶磷能力,也具有一定的解钾能力和产IAA的功能,该菌耐盐范围可达7%。通过玉米营养液培养实验也研究了菌株NYCS1-5对玉米在有盐(100 mmol/L Na Cl)、无盐条件下的促生功能,记录玉米在生长第4、10和12 d的株高和根长生长状况。在有盐条件下,玉米生长10 d时,菌株NYCS1-5处理组的玉米生理株高和根长分别提高了21.36%和16.64%,均达到显著性差异,菌株NYCS1-5表现出对玉米的耐盐促生功能。在无盐条件下,菌株NYCS1-5对玉米生理株高及根长也表现出了一定的促进作用;玉米生长12 d时,菌株NYCS1-5处理组的玉米生理株高增加了17.38%,达到显著差异。因此,此栖稻假单胞菌NYCS1-5对玉米等作物有耐盐促生应用价值。

由核桃疫病果实上分离的一株栖稻假单胞菌YKW14

【目的】对一株来自云南昆明核桃疫病幼果上的细菌YKW14进行生理生化特性和分子鉴定。【方法】通过传统的细菌显微形态观察,不同培养基生长状况比较,生理生化特性测定,抗药性及冰核活性测试,结合16S-rDNA和gyrB基因序列比对分析,用MEGA7.0构建进化发育树对菌株进行鉴定。【结果】菌株YKW14在LB培养基平板生长良好,在含2%氯化钠的培养基上不能生长,致死温度为55℃。该菌株对石硫合剂、稻瘟灵和戊唑醇有抗性,对壮观霉素、卡那霉素和氨苄青霉素钠也表现出抗性,而对头孢无抗性。菌株的16S-rDNA和gyrB基因序列与NCBI中的栖稻假单胞菌同源性和相似性为100%。结合形态、生理生化特性和基因序列,将菌株YKW14鉴定为栖稻假单胞菌Pseudomonas oryzihabitans。【结论】栖稻假单胞菌为首次在核桃疫病幼果上分离报道。该菌可能为核桃果实疫病的复合侵染病原菌之一,其致病性或在疫病发生中的作用有待进一步验证。

多器官功能衰竭患者检出栖稻假单胞菌1例

栖稻假单胞菌(Pseudomonas oryzihabitans,P.oryzihabitans)作为条件致病菌和院内感染菌,多见于免疫力低下合并基础疾病患者,其抗感染预后良好,甚少出现多器官功能衰竭病例。本例患者无明显诱因出现双下肢水肿半月余,后全身乏力、气短、尿少3d,继而出现多器官功能衰竭。患者的血培养中检出1株革兰氏阴性杆菌,经生化鉴定、全自动快速微生物质谱检测(MALDI-TOF MS)和16SrRNA测序,鉴定为P.oryzihabitans;运用Mega 7.0软件构建系统发育树,发现其与耐冷假单胞菌(Pseudomonas psychrotolerans,P.psychrotolerans)亲缘关系十分密切;采用纸片扩散法(Kirby-Bauer method,K-B method)进行药物敏感试验(antimicrobial susceptibility test,AST),显示该菌对头孢他啶、庆大霉素、亚胺培南、左氧氟沙星等敏感,对氨曲南、氨苄西林、头孢唑啉等耐药。采用亚胺培南西司他丁联合莫西沙星对患者进行抗感染治疗,但因患者家属要求出院,无法追踪后续治疗结果。本例报告提示,临床微生物工作者应关注栖稻假单胞菌病例报道和相关研究,以获取更多资料为该病的临床诊治提供依据。

不同地理种群栖稻假单胞菌株的16S rRNA基因序列分析

目的分析栖稻假单胞菌不同地理种群株16S rRNA基因序列,构建系统发育树。方法将1株栖稻假单胞菌海南临床分离株的16S rRNA基因进行PCR扩增并测序,并与从GenBank中挑选出的其他29株不同来源的栖稻假单胞菌的16S rRNA基因序列进行对比分析,并绘制系统发育树。结果系统发育分析表明大部分菌株可根据地理区域的不同分为3个簇,序列分析显示某些可变区可能存在区分不同区域菌株的关键序列。结论栖稻假单胞菌基因型及表现型具有多样性;大部分栖稻假单胞菌可根据16S rRNA基因序列鉴别不同地理种群株。

南繁玉米叶片条斑病病原菌的分离及抗病品种的筛选

本研究分离了2021年3月海南南繁基地玉米叶片条斑病病原菌并对抗病玉米品种进行了筛选。依据柯赫氏法则,利用植物病原菌分离、纯化和回接实验,以及16S rDNA序列测定,细菌形态学观察和生化鉴定方法,对病原菌进行了分离、鉴定。结果证实分离株HNTB02为玉米条斑病病原菌并将该病原菌鉴定为栖稻假单胞菌(Pseudomonas oryzihabitans),进一步筛选出杂交种‘金博士723’和其父本对玉米条斑病表现高度抗病性。综上所述,本研究是对玉米条斑病田间诊断的一个补充,为栖稻假单胞菌引发的玉米条斑病抗病育种提供了遗传材料。