玉米ELM1基因的序列变异及与株型和穗部相关性状的关联分析

玉米elm1突变体使得光敏色素载色体合成受阻并导致光敏色素活性下降,从而使得突变体植株表现出对光的不敏感性。为研究玉米ELM1基因序列的多态性及其与主要农艺性状之间的关联,本研究对玉米ELM1基因在80个自交系中进行了目标序列重测序,并与株高和穗位高2个株型性状以及穗长、穗粗、轴粗、穗重、行粒数、穗行数和穗粒数7个穗部性状进行关联分析。ELM1基因在供试玉米自交系中共有85个变异,包括73个SNP和12个Indel。尽管该基因的编码区不含Indel,但15个SNP变异位点依然可以将编码区划分成7种单倍型,并编码6种ELM1蛋白质。关联分析发现,玉米ELM1基因中1个非同义突变位点与穗位高存在显著关联,另有2个非同义突变位点与行粒数存在显著关联。