鼠李糖乳杆菌HN001菌株水平快速定量方法的建立及应用

目的应用实时荧光定量聚合酶链式反应(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,qPCR),建立鼠李糖乳杆菌HN001菌株水平的快速定量检测方法。方法通过比对鼠李糖乳杆菌HN001的近缘菌株的基因组,筛选出鼠李糖乳杆菌HN001菌株水平的特异基因,以菌株水平的特异基因为靶标设计引物及探针,优化反应体系和条件,建立鼠李糖乳杆菌HN001株水平的qPCR检测方法。对方法的特异性、灵敏度、检出限进行验证,并采用已建立的qPCR方法进行模拟添加样品和实际样品的检测。结果所建立的方法特异性强,与近缘菌株无交叉反应,鼠李糖乳杆菌HN001纯培养液检出限为10^(2)CFU/mL,灵敏度可达到650 copies/μL,可在2 h内完成样品检测。对模拟添加样品以及实际样品检测中qPCR和平板计数法结果的对数值进行显著性分析检验,两种方法的测定值结果均无显著性差异(P>0.05)。结论本研究建立的qPCR检测方法可有效应用于益生菌产品中鼠李糖乳杆菌HN001菌株水平定量检测,具有快速、灵敏、准确的特点。

慈竹构件和分株水平的可溶性糖含量研究

采用蒽酮比色法 ,测定了克隆植物慈竹构件和分株水平的可溶性糖含量 ,以探讨其对环境的生理适应性 .结果表明 ,在构件水平 ,可溶性糖含量以慈竹叶最大 ,枝条次之 ,秆最小 .不同构件的可溶性糖含量对分株年龄和分株部位的反应格局不同 ,1龄分株枝和秆的可溶性糖含量较高 ,而分株年龄对叶的可溶性糖含量影响不显著 ;分株下层叶和秆的可溶性糖含量大于上中层 .高光条件下 1龄分株叶的可溶性糖含量显著高于弱光条件下的 1龄分株 .叶可溶性糖含量受季节影响显著 ,1月最低 ,4月最高 ,但 2龄和 3龄分株间差异不显著 .母分株和子分株上、中两层叶可溶性糖含量呈显著正相关 ,而下层相关性不显著 .在分株水平 ,慈竹 5个龄级间的可溶性糖含量无显著差异 .总之 ,慈竹可溶性糖含量受生物和非生物因子的影响显著 ,且分株和构件层次存在差异 .

不同类型抗盐植物整株水平游离脯氨酸的分配

采用田间试验及盆栽试验,对3种不同类型(拒盐、泌盐和稀盐)的抗盐植物植株水平游离脯氨酸的分配特性进行了研究。结果表明,不同类型的植物游离脯氨酸有如下的规律:稀盐植物整株中的游离脯氨酸的含量很低;泌盐植物整株中的游离脯氨酸的含量介于稀盐植物和拒盐植物之间;拒盐植物整株中的游离脯氨酸含量明显高于前2类植物。3种类型的抗盐植物植株中游离脯氨酸分配的共同特点是游离脯氨酸多集中于代谢旺盛的光合器官和生殖器官,在盐逆境下植物优先保护其光合器官和生殖器官。

烯效唑(S3307)对湖南稷子整株水平Na^+、K^+选择性和游离脯氨酸分配的影响

采用盆栽试验,观察测定了烯效唑(S3307)对湖南稷子抗盐性及整株水平Na+、K+选择性和游离脯氨酸分配的影响。结果表明,喷施S3307能显著提高湖南稷子根系的Na+、K+选择性吸收能力;由叶鞘向叶片、特别是由根系向叶鞘的选择性运输能力大大提高,因而进入植物体内的Na+减少、K+增多,尤以重要光合器官表现突出。但S3307处理后,湖南稷子重要光合器官中游离脯氨酸含量并未升高。

慈竹构件和分株水平总黄酮含量的变化

黄酮类化合物是植物体内重要的次生代谢物质之一。本文采用AlCl3 比色法测定了慈竹构件和分株水平总黄酮含量的变化 ,以探讨其生理生态适应性。结果表明 ,在地上 3个构件中 ,叶的总黄酮含量显著大于枝和秆 ;1龄分株叶的总黄酮含量显著大于其它 4个龄级 ,而枝和秆的含量在 5个年龄间无显著差异 ;分株上层叶和枝条的总黄酮含量显著多于中下两层的相应构件。叶龄对慈竹叶总黄酮含量有显著的影响 ,1龄、 7龄和 9龄叶片的总黄酮含量明显高于其它 6个龄级 ,但是叶龄和总黄酮含量之间无显著线性相关。同时 ,叶总黄酮含量对季节的变化敏感 ,2、 4和 12月含量最高 ,5月和 8月含量最低。在分株水平 ,1龄分株的总黄酮含量显著大于其它 4个龄级。这些结果说明慈竹的总黄酮含量对环境变化具有可塑性 ,分株水平与叶构件水平总黄酮含量对分株年龄的反应格恐相同。

动物双歧杆菌乳亚种i797菌株特异性量化分析方法研究

动物双歧杆菌乳亚种i797(Bifidobacterium animalis subsp.lactis i797)是一株具有改善小儿腹泻和消化不良功能的潜在益生菌。通过与其它22株动物双歧杆菌乳亚种菌株进行全基因组测序-单核苷酸多态性(Whole Genome Sequencing-Single Nucleotide Polymorphism,WGS-SNP)分析,确定了i797菌株位于K1717_01615基因上的一个特异性位点。根据该位点设计引物及探针,基于荧光定量PCR建立了i797菌株的量化分析方法。结果表明,所选位点可以有效区分i797与其它18株双歧杆菌,且在传代40次过程中表现出较强的稳定性。该检测方法对于i797菌株DNA浓度和菌液浓度的灵敏度分别为1.5 pg和10^(4)CFU/mL,重复性和重现性检测结果的相对标准偏差分别小于2%和6%,并且对于高浓度同亚种菌株ATCC 27673的抗干扰能力较强。利用该方法可以实现复合益生菌产品中i797菌株的准确量化分析,为益生菌产品的质量控制和合规性评估提供了有效的解决方案。

NaCl处理对盐地碱蓬整株及细胞水平的生长、溶质积累的影响

本文比较了不同 Na Cl浓度处理下 ,盐地碱蓬细胞水平及整株水平的生长及溶质积累的异同。结果表明 :细胞水平的最适生长浓度是 50 mmol/ L Na Cl,而整株水平是 2 0 0 mmol/ LNa Cl;二者在最适生长浓度时 ,含水量也最大 ;二者的 Na+、Cl- 含量都随 Na Cl浓度的增大而增大 ,但在数值及增大幅度上不同 ;细胞水平的 K+含量随 Na Cl浓度的增大而增大 ,Ca2 +含量在 50 mmol/ L Na Cl下达到最大值 ,而整株的 K+、Ca2 +随 Na Cl浓度的增大而降低 ;随着Na Cl浓度的增大 ,细胞水平的可溶性组分逐渐增大 ,而整株水平的可溶性糖、脯氨酸含量逐渐增大 ,有机酸含量变化不大 。

基于宏基因组测序的细菌株水平研究进展

宏基因组指样本中全部生物遗传物质的集合。目前,细菌的宏基因组学研究主要包含群落组成结构、遗传多样性以及重要功能基因谱等内容,相关分析通常基于细菌的属或种水平开展。随着高通量测序技术和生物信息学分析技术的发展,宏基因组研究已初步达到细菌株水平解析度,为推断细菌生态和进化规律等提供了新的工具和科学认识。本研究从遗传多样性、疫情暴发溯源研究以及重要功能基因谱3个方面,对基于宏基因组测序的细菌株水平研究进展进行了总结,以期为该技术的发展应用提供参考。

不同扦插方式对“商薯19”产量影响研究

为挖掘“商薯19”的增产潜力,以商洛市农户常用的竖插法为对照,采用单株水平扦插法、双株水平扦插法栽培“商薯19”。结果发现双株水平扦插法总产量最高(3037.81 kg/667 m^(2)),与竖插法产量(1838.7 kg/667 m^(2))差异显著(P<0.05)。进一步统计不同扦插方式的大、中薯数量、产量及大、中薯率发现,双株水平扦插法主要通过增加大薯产量和中薯数量来达到增产效果。双株水平扦插法能够同时适应生产淀粉和鲜食的需求,有必要进一步试验、示范和推广。

臭冷杉生物量分配格局及异速生长模型

臭冷杉是长白山阔叶红松林中重要针叶树种,采用整株收获法分析21株臭冷杉地上地下生物量分配格局。在枝条水平上采用样枝直径(BD)、样枝长度(BL)、样枝所在轮生枝位置(WP)建立活枝、针叶生物量异速生长模型,在植株水平上采用胸径(DBH)、树高(H)、年龄(Age)、树冠长度(CL)、树冠比率(CR)、南北向冠幅(CW1)、东西向冠幅(CW2)等变量建立树干木质、树皮、活枝、针叶、粗根及整株生物量模型。并利用逐步线性回归法获得不同器官生物量最优模型。结果表明:(1)活枝生物量主要集中在树冠中下层,针叶生物量集中在树冠中层。树冠中层和下层枝叶生物量无显著差异(P>0.05);(2)21株臭冷杉地上生物量和地下生物量变动范围分别为1.026—506.047 kg/株和0.241—112.000 kg/株。粗根、活枝、针叶、树干木质、树皮及枯枝生物量占整株生物量的相对比例分别为18.68%、18.39%、12.02%、39.29%、8.70%和2.92%;(3)地上生物量与地下生物量呈显著线性相关(P<0.001),拟合线性方程斜率为0.23;(4)枝条水平上,活枝生物量模型解释量超过95%,平均预测误差小于30%。与单变量(BD)活枝生物量模型相比,2变量(BD、BL)和3变量(BD、BL、WP)模型解释量分别提高1.2%和2.0%,平均预测误差分别下降6.26%和9.27%。针叶生物量相对较难预测,模型解释量仅为82.7%,平均预测误差接近50%,模型中增加BL和WP变量并未提高针叶生物量的预测精度。活枝生物量与BD、BL、WP正相关,针叶生物量与BD正相关,与BL、WP负相关;(5)植株水平上,基于胸径的单变量模型可解释量大于90%,增加树高变量未能显著提高生物量模型的预测精度。年龄决定了臭冷杉的树干生物量,忽视年龄变量将会产生生物量预测误差。树冠特征是影响枝叶生物量预测精度的重要变量。综合考虑模型的可解释量及回归系数显著性可知,胸径是预测臭冷杉不同器官生物量的可靠变量。

6-苄氨基嘌呤(BA)和脱落酸(ABA)对湖南稷子Na^+、K^+选择性和游离脯氨酸分配的调节

以盆栽的C4植物-湖南稷子 Echinochloafrumentacea 为材料,用6-苄氨基嘌呤 BA 和脱落酸 ABA 定位涂抹湖南稷子的穗、上位和下位叶片,分析了植物体激素平衡的局部改变对整株水平上Na+、K+和游离脯氨酸分配的调节.实验结果表明,ABA和具有细胞分裂素活性的BA是调控Na+、K+及游离脯氨酸在不同层位叶中分配的重要因素.ABA涂抹湖南稷子的上位叶片,上位叶片中的Na+比其下位叶片高35.0%;用ABA涂抹湖南稷子的下位叶片,下位叶片中的K+比其上位叶片高31.4%,下位叶鞘中的K+比其上位叶鞘高53.7%.用BA涂抹湖南稷子的下位叶片,下位叶片中的K+和脯氨酸分别比其上位叶片高16.5%和31.7%;用BA或ABA定位涂抹植物地上不同部位,引起植物整株水平上Na+、K+向光合作用强的部位,特别是向活跃期的穗中选择性运输的能力增强,游离脯氨酸也多集中于代谢旺盛的光合器官和生殖器官.