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志贺氏菌属鲍氏(S.boydii)亚群基因组组成与进化分析
被引量:
1
1
作者
张笑冰
王璟
+7 位作者
彭俊平
杨娥
宾文
杨剑
董杰
孙立连
徐星晔
金奇
《中国科学(C辑)》
CSCD
北大核心
2005年第4期359-364,共6页
利用比较基因组杂交法(comparativegenomichybridization,CGH)对志贺氏菌属鲍氏(S.boydii)亚群共18个血清型代表菌株的基因组结构组成进行比较分析,结果显示,该亚群基因组的“共有骨架”包含2552个与非致病性大肠杆菌K12同源的ORFs.比对...
利用比较基因组杂交法(comparativegenomichybridization,CGH)对志贺氏菌属鲍氏(S.boydii)亚群共18个血清型代表菌株的基因组结构组成进行比较分析,结果显示,该亚群基因组的“共有骨架”包含2552个与非致病性大肠杆菌K12同源的ORFs.比对K12基因组,该亚群所有菌株基因组共同缺失ORFs为199个,主要涉及外膜蛋白编码基因和O-抗原合成相关基因,而属于亚群特异性的ORFs主要以噬菌体基因和未知功能ORFs为主,一些参与铁离子代谢、运输和Ⅱ型分泌系统基因在大多数的鲍氏菌株中存在.以比较基因组杂交法得到的进化分析显示:鲍氏亚群18个血清型代表菌株可分为4组,其中13型与其他菌株有较大的差异.这种分组结果与某些代谢相关的基因分布情况存在对应关系.通过对该亚群“共有骨架”、缺失基因和株特异基因,以及进化分类等方面的分析,以期探索该亚群基因组的进化规律,并为志贺氏菌属鲍氏亚群的致病机理、疫苗研制和药物开发等方面的研究提供重要线索.
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关键词
志贺菌属鲍氏亚群
比较基因组杂交
株特异性orfs
进化
比较基因组
进化分析
志贺氏菌
结构组成
亚群
致病性大肠杆菌
原文传递
题名
志贺氏菌属鲍氏(S.boydii)亚群基因组组成与进化分析
被引量:
1
1
作者
张笑冰
王璟
彭俊平
杨娥
宾文
杨剑
董杰
孙立连
徐星晔
金奇
机构
病毒基因工程国家重点实验室
出处
《中国科学(C辑)》
CSCD
北大核心
2005年第4期359-364,共6页
基金
国家重大基础研究规划项目(批准号:G1999054103)
国家高技术研究发展计划项目(批准号:2001AA223011)
国际科技合作重点项目(批准号:2001AA223116)
文摘
利用比较基因组杂交法(comparativegenomichybridization,CGH)对志贺氏菌属鲍氏(S.boydii)亚群共18个血清型代表菌株的基因组结构组成进行比较分析,结果显示,该亚群基因组的“共有骨架”包含2552个与非致病性大肠杆菌K12同源的ORFs.比对K12基因组,该亚群所有菌株基因组共同缺失ORFs为199个,主要涉及外膜蛋白编码基因和O-抗原合成相关基因,而属于亚群特异性的ORFs主要以噬菌体基因和未知功能ORFs为主,一些参与铁离子代谢、运输和Ⅱ型分泌系统基因在大多数的鲍氏菌株中存在.以比较基因组杂交法得到的进化分析显示:鲍氏亚群18个血清型代表菌株可分为4组,其中13型与其他菌株有较大的差异.这种分组结果与某些代谢相关的基因分布情况存在对应关系.通过对该亚群“共有骨架”、缺失基因和株特异基因,以及进化分类等方面的分析,以期探索该亚群基因组的进化规律,并为志贺氏菌属鲍氏亚群的致病机理、疫苗研制和药物开发等方面的研究提供重要线索.
关键词
志贺菌属鲍氏亚群
比较基因组杂交
株特异性orfs
进化
比较基因组
进化分析
志贺氏菌
结构组成
亚群
致病性大肠杆菌
分类号
Q933 [生物学—微生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
志贺氏菌属鲍氏(S.boydii)亚群基因组组成与进化分析
张笑冰
王璟
彭俊平
杨娥
宾文
杨剑
董杰
孙立连
徐星晔
金奇
《中国科学(C辑)》
CSCD
北大核心
2005
1
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