基于网络药理学和分子对接探讨健脾益肾方治疗慢性肾脏病的作用机制

目的:利用网络药理学技术和分子对接研究健脾益肾方治疗慢性肾脏病的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)及中医药整合药理学研究平台(Integrative Pharmacology-based Research Platform of Traditional Chinese Medicine,TCMIP)v2.0收集健脾益肾方中八味中药的主要活性成分,通过TCMSP及Swiss Target Prediction数据库查询活性成分的靶点信息;从人类基因数据库(GeneCards)、《人类孟德尔遗传》数据库(OMIM)、Drugbank、疗效药靶数据库(TTD)中获取慢性肾脏病的相关靶标;取活性成分靶标与疾病靶标的交集,根据拓扑特征值筛选健脾益肾方治疗慢性肾脏病的关键靶标;将关键靶标进行GO功能分析和KEGG信号通路分析,并采用Cytoscape 3.7.0构建“中药-关键活性成分-核心靶标-信号通路”,并筛选其核心网络。结果:健脾益肾方中槲皮素、山柰酚、木犀草素等为其发挥作用的核心活性成分,雌激素受体1(ESR1)、雄激素受体(AR)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)、前列腺素-内过氧化物合酶1(PTGS1)、核受体共激活剂2(NCOA2)等为其关键靶标,可能通过调控对药物的反应、凋亡过程的负调控、老化等生物学过程,作用于胞质溶胶、质膜、核质等细胞组分,影响酶结合、碳酸盐脱水酶活性、药物结合等分子功能,通过改善组织局部血供,促进血管生成,改善氧化应激状态,调节慢性炎症,改善甲状腺激素水平,改善慢性肾脏病的胰岛素抵抗,抑制慢性肾脏病细胞凋亡等信号通路发挥治疗慢性肾脏病的作用。分子对接结果显示,核心活性成分与核心靶标之间结合作用良好。结论:该研究基于网络药理学和分子对接的方法筛选健脾益肾方治疗慢性肾脏病的核心活性成分及其调控的关键靶标、信号通路,揭示了健脾益肾方通过多成分、多靶点、多通路改善慢性肾脏病的作用,为后续研究提供了丰富的信息和理论依据。

抗支糖浆治疗咳嗽变异性哮喘作用机制网络药理学分析

目的基于网络药理学探讨抗支糖浆治疗咳嗽变异性哮喘(CVA)的靶点和作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取抗支糖浆中主要活性成分及其相关靶点,通过在线人类孟德尔遗传数据系统(OMIM)、Gene Cards数据库获取CVA相关靶点,采用Venny 2.1绘制抗支糖浆靶点与CVA疾病靶点的韦恩图,采用Cytoscape 3.6.1软件构建中药靶点网络,并应用STRING平台构建蛋白相互作用网络,应用R语言软件对关键靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。结果共获得136个活性成分,160个药物与CVA相关靶点,主要活性成分为豆甾醇、β-谷固醇、槲皮素、儿茶素、木犀草素、山奈酚等。PPI网络中核心基因为蛋白激酶B(AKT1)、白细胞介素(IL)-6、半胱氨酸蛋白酶3(CASP3)、IL-1β、JUN等;GO功能富集后富集数目较多的有受体-配体活性、细胞因子受体结合、细胞因子活性、血红素结合等;KEGG富集通路分析显示抗支糖浆治疗CVA主要通路有脂质与动脉粥样硬化、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路以及IL-17信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等为主;KEGG通路与基因之间的网络图中关联数量较多的基因主要有IL-1β、NFKBIA、IL-6、CHUK、CXCL8、JUN、CASP3等。结论初步验证了抗支糖浆的药效基础,主要成分及靶点均显示具有较好的结合性能,可为抗支糖浆治疗CVA提供理论基础。