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基于系统生物学整合技术挖掘结直肠癌形成中的核心通路和驱动基因 被引量:2
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作者 苗华 曹付傲 +4 位作者 赵权权 缪宗原 叶淳 徐小雯 王汉涛 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期619-626,共8页
目的探索结直肠癌(colorectal carcinoma,CRC)形成中的核心通路和关键基因。方法利用meta分析技术从以往5项CRC发生相关转录组学研究中筛选癌及癌旁差异表达基因。采用ComBat方法合并5项研究的癌组织基因表达谱数据,针对上述差异表达基... 目的探索结直肠癌(colorectal carcinoma,CRC)形成中的核心通路和关键基因。方法利用meta分析技术从以往5项CRC发生相关转录组学研究中筛选癌及癌旁差异表达基因。采用ComBat方法合并5项研究的癌组织基因表达谱数据,针对上述差异表达基因用PCIT软件进行共表达网络构建。利用CFinder软件揭示该共表达网络中存在的核心亚网络,并用Gather软件确定主要核心亚网络所富集的生物学功能。以重要核心亚网络(或通路)为重点,联合节点基因在CRC中的表达变化方向和相应染色体区域扩增或缺失的信息,发现亚网络功能形成中的候选驱动基因。结果 Meta分析转录组学研究共发现差异表达基因2 073个,其中在5项研究的癌组织中一致上调1 174个,一致下调899个,这些基因在CRC样本中形成的共表达网络包括798个基因节点和1 462条边,存在22个核心亚网络。最大的核心亚网络由77个基因和436条边组成,功能涉及细胞周期和增殖信号调控,UBE2C、MYBL2、FAM83 D、AURKA、TPX2等11个基因被预测为该信号功能的驱动基因。结论细胞周期和增殖信号通路是结直肠癌发生中的核心通路,UBE2C和AURKA等11个基因是该核心通路的驱动基因。 展开更多
关键词 结直肠肿瘤 核心通路 驱动基因 计算生物学
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血管通路核心护理团队的建设对连续血液净化治疗患者血管通路维护质量的影响
2
作者 林姗姗 《中华养生保健》 2023年第9期115-118,共4页
目的构建血液净化中心以血管通路护理为核心的护理团队,评价其在连续血液净化治疗患者中的应用效果。方法抽取2020年5月—2021年5月赤峰市医院收治的连续血液净化患者120例,按照随机数表法分为对照组和观察组,每组60例,对照组患者给予... 目的构建血液净化中心以血管通路护理为核心的护理团队,评价其在连续血液净化治疗患者中的应用效果。方法抽取2020年5月—2021年5月赤峰市医院收治的连续血液净化患者120例,按照随机数表法分为对照组和观察组,每组60例,对照组患者给予常规护理,观察组患者在对照组的基础上构建血管通路核心护理团队实施护理,观察比较血管通路一次穿刺成功率、并发症发生率、护理满意度以及连续血液净化充分性和生活质量。结果观察组一次穿刺成功率、护理满意度明显高于对照组,血管通路并发症发生率明显低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。护理干预前,两组患者尿素氮下降率(URR)、尿素清除指数(Kt/V)、β2-微球蛋白(β2-MG)水平及36项健康调查简表(SF-36)各维度评分比较,差异无统计学意义(P>0.05);护理干预后,两组URR、KT/V明显上升,β2-MG明显下降,SF-36各维度评分明显提高,观察组各指标变化幅度明显高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论对连续血液净化患者实施以血管通路核心护理团队为基础的护理干预,可有效提高一次穿刺成功率,降低血管通路并发症发生风险,改善连续血液净化充分性。 展开更多
关键词 血管通路核心护理团队 连续血液净化 血管通路维护
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葛根素基于内质网蛋白核心/信号分子/C/EBP同源蛋白通路对脂多糖诱导成骨细胞骨保护素及核因子-κB受体mRNA表达的影响 被引量:4
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作者 王海珍 王丽娟 贠云飞 《安徽医药》 CAS 2021年第2期227-232,F0002,共7页
目的探讨基于内质网蛋白核心/信号分子/C/EBP同源蛋白(GRP78/PERK/CHOP)通路研究葛根素对脂多糖(LPS)诱导成骨细胞骨保护素(OPG)和核因子-κB受体(RANKL)mRNA表达的影响。方法体外培养小鼠胚胎成骨细胞前体细胞MC3T3-E1,采用随机数字表... 目的探讨基于内质网蛋白核心/信号分子/C/EBP同源蛋白(GRP78/PERK/CHOP)通路研究葛根素对脂多糖(LPS)诱导成骨细胞骨保护素(OPG)和核因子-κB受体(RANKL)mRNA表达的影响。方法体外培养小鼠胚胎成骨细胞前体细胞MC3T3-E1,采用随机数字表法分为对照组、模型组、4-苯基丁酸钠盐(内质网应激抑制剂,4-PBA)组、葛根素组、葛根素+4-PBA组,除对照组,其余各组以LPS处理MC3T3-E1细胞建立成骨细胞炎症模型,以茜素红染色、碱性磷酸酶(ALP)试剂盒分别检测各组细胞矿化结节相对比例、ALP活性,判定细胞成骨分化情况;以酶联免疫吸附(ELISA)试剂盒检测各组细胞培养基上清液中肿瘤坏死因子α(TNF-α)、白细胞介素-6(IL-6)水平;以实时荧光定量(qRT-PCR)检测各组细胞成骨相关基因(Runx2)、骨桥蛋白(OPN)、骨钙素(OCN)mRNA水平及OPG、RANKL mRNA水平;以免疫印迹检测细胞GRP78、PERK、CHOP蛋白表达。结果与对照组相比,模型组MC3T3-E1细胞矿化结节相对比例[(8.23±1.18)%比(100.00±0.00)%]、ALP活性[(0.49±0.12)U/mgprot比(1.57±0.35)U/mgprot]、细胞Runx2[(0.41±0.05)比(1.01±0.13)]、OPN[(0.39±0.04)比(1.02±0.15)]、OCN[(0.40±0.03)比(0.99±0.14)]及OPG mRNA[(0.41±0.11)比(1.03±0.17)]水平明显降低(P<0.05),细胞培养基上清液中TNF-α[(602.43±20.01)pg/mL比(381.86±18.16)pg/mL]及IL-6水平[(483.63±16.61)pg/mL比(280.15±11.18)pg/mL]、细胞RANKL mRNA[(3.03±0.62)比(0.99±0.13)]水平及GRP78[(1.31±0.24)比(0.19±0.05)]、PERK[(1.23±0.27)比(0.33±0.08)]、CHOP蛋白[(1.21±0.28)比(0.31±0.07)]表达明显升高(P<0.05)。与模型组相比,4-PBA组、葛根素组、葛根素+4-PBA组MC3T3-E1细胞矿化结节相对比例、ALP活性、细胞Runx2、OPN、OCN及OPG mRNA水平均升高(P<0.05),细胞培养基上清液中TNF-α及IL-6水平、细胞RANKL mRNA水平及GRP78、PERK、CHOP蛋白表达均降低(P<0.05)。与4-PBA组、葛根素组分别相比,葛根素+4-PBA组MC3T3-E1细胞矿化结节相对比例、ALP活性、细胞Runx2、OPN、OCN及OPG mRNA水平均升高(P<0.05),细胞培养基上清液中TNF-α及IL-6水平、细胞RANKL mRNA水平及GRP78、PERK、CHOP蛋白表达均降低(P<0.05),4-PBA组与葛根素组上述各项指标比较均差异无统计学意义(P>0.05)。结论葛根素可上调OPG mRNA水平,下调RANKL mRNA水平,降低LPS诱导的成骨细胞炎症反应,拮抗LPS对成骨细胞成骨分化的抑制作用,可能是通过下调GRP78/PERK/CHOP通路实现的。 展开更多
关键词 异黄酮类 植物提取物 内质网蛋白核心/信号分子/C/EBP同源蛋白通路 葛根素 脂多糖 成骨细胞 OPG RANKL mRNA表达
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血管通路核心护理团队的建设对维持性血液透析病人血管通路维护质量的影响 被引量:5
4
作者 韦红 《全科护理》 2021年第35期4989-4992,共4页
目的:探究血管通路核心护理团队的建设对维持性血液透析病人血管通路维护质量的影响。方法:选取2018年9月—2020年3月在医院接受维持性血液透析治疗的142例病人为研究对象,将病人随机分为对照组及观察组,对对照组病人行常规干预,对观察... 目的:探究血管通路核心护理团队的建设对维持性血液透析病人血管通路维护质量的影响。方法:选取2018年9月—2020年3月在医院接受维持性血液透析治疗的142例病人为研究对象,将病人随机分为对照组及观察组,对对照组病人行常规干预,对观察组病人行血管通路核心护理团队护理,比较两组病人透析充分性、治疗期间并发症发生率及干预前后生活质量。结果:透析后观察组病人尿素氮下降率(URR)及尿素清除指数(Kt/V)水平分别为(95.72±4.09)%及(91.53±4.28)%,均高于对照组(P<0.01),且β_(2)-微球蛋白(β_(2)-MG)水平为(36.98±1.76)mg/L,低于对照组(P<0.01),且观察组病人并发症总发生率为8.45%,低于对照组的22.54%(P<0.05),干预后观察组病人生活质量评分为(68.43±4.42)分,高于对照组的(57.34±4.21)分(P<0.01)。结论:对维持性血液透析病人实施以血管通路核心护理团队为基础的护理干预,能有效提高病人透析充分性,且能降低病人并发症发生率,改善病人生活质量。 展开更多
关键词 血管通路核心护理团队 维持性血液透析 血管通路维护质量
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血管通路核心护理团队的构建及在血液净化患者中的应用 被引量:9
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作者 王丽娟 田素革 顾玥 《中华现代护理杂志》 2022年第10期1324-1328,共5页
目的探讨与分析血管通路核心护理团队的构建及在血液净化患者中的应用。方法采用便利抽样法,选取于2018年5月—2020年5月河南省人民医院肾内科收治的接受血液净化治疗的120例患者为研究对象,采取随机数字表法将患者分为对照组与观察组,... 目的探讨与分析血管通路核心护理团队的构建及在血液净化患者中的应用。方法采用便利抽样法,选取于2018年5月—2020年5月河南省人民医院肾内科收治的接受血液净化治疗的120例患者为研究对象,采取随机数字表法将患者分为对照组与观察组,各60例。对照组给予常规护理,观察组在对照组基础上构建血管通路核心护理团队实施专科护理,对比两组患者血管通路构成、一次穿刺成功率、并发症发生率、干预前后营养指标。结果观察组与对照组相比,血管通路为中心静脉导管率较低,一次穿刺成功率较高,差异均有统计学意义(P<0.05)。观察组与对照组相比,并发症发生率较低,差异有统计学意义(P<0.05)。护理后,观察组与对照组相比,白蛋白、血红蛋白、前白蛋白水平均较高,差异有统计学意义(P<0.05)。结论通过构建血管通路核心护理团队实施专科护理并将其应用于血液净化患者中能够有效降低相关并发症的发生率,改善患者营养状况,总体护理效果较好,值得临床推广。 展开更多
关键词 血管通路核心护理团队 血液净化 并发症 营养状况
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胰腺癌癌前病变基因研究进展 被引量:1
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作者 祝鹏 王伟军 《肿瘤防治研究》 CAS CSCD 北大核心 2014年第10期1134-1138,共5页
现已证实,基因研究有助于阐明能够促进胰腺癌(pancreatic cancer,PC)发生、发展的一些关键基因和分子通路。早期研究发现,在胰腺上皮内瘤样变(PanINs)进展过程中,随着组织异型程度的增加,相应的发生KRAS基因激活,CDKN2A基因、TP53基因及... 现已证实,基因研究有助于阐明能够促进胰腺癌(pancreatic cancer,PC)发生、发展的一些关键基因和分子通路。早期研究发现,在胰腺上皮内瘤样变(PanINs)进展过程中,随着组织异型程度的增加,相应的发生KRAS基因激活,CDKN2A基因、TP53基因及SMAD4基因失活,并可导致多个重要的细胞过程和信号转导通路发生改变。而在导管内乳头状黏液性瘤(IPMNs)和黏液性囊性瘤(MCNs)进展过程中,也发生了相应的基因突变。最近,全基因组外显子测序技术揭示了由癌前病变进展而来的胰腺癌基因图谱,这些研究对发展形成新的个体化治疗方法有所帮助。本文从胰腺三种癌前病变形态学变化、各自的基因突变事件以及胰腺癌前病变中部分信号通路和调控过程与基因突变的关系等方面作一综述。 展开更多
关键词 胰腺 癌前病变 基因突变 核心信号通路
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Recombinant adeno-associated virus serotype 9 with p65 ribozyme protects H9c2 cells from oxidative stress through inhibiting NF-κB signaling pathway 被引量:5
7
作者 Zhan SUN Yi-Tong MA +1 位作者 Bang-Dang CHEN Fen LIU 《Journal of Geriatric Cardiology》 SCIE CAS CSCD 2014年第4期311-315,共5页
Background Oxidative stress is a major mechanism underlying the pathogenesis of cardiovascular disease. It can trigger inflammatory cascades which are primarily mediated via nuclear factor-κB (NF-κB). The NF-κB t... Background Oxidative stress is a major mechanism underlying the pathogenesis of cardiovascular disease. It can trigger inflammatory cascades which are primarily mediated via nuclear factor-κB (NF-κB). The NF-κB transcription factor family includes several subunits (p50, p52, p65, c-Rel, and Rel B) that respond to myocardial ischemia. It has been proved that persistent myocyte NF-κB p65 activation in heart failure exacerbates cardiac remodeling. Mechods A recombinant adeno-associated virus serotype 9 carrying enhanced green fluorescent protein and anti-NF-κB p65 ribozyme (AAV9-R65-CMV-eGFP) was constructed. The cells were assessed by MTT assay, Annexin V–propidium iodide dual staining to study apoptosis. The expression of P65 and P50 were assessed by Western blot to investigate the under-lying molecular mechanisms. Results After stimulation with H2O2 for 6 h, H9c2 cells viability decreased significantly, a large fraction of cells underwent apoptosis. We observed a rescue of H9c2 cells from H2O2-induced apoptosis in pretreatment with AAV9-R65-CMV-eGFP. Moreover, AAV9-R65-CMV-eGFP decreased H2O2-induced P65 expression. Conclusions AAV9-R65-CMV-eGFP protects H9c2 cells from oxidative stress induced apoptosis through down-regulation of P65 expression. These observations indicate that AAV9-R65-CMV-eGFP has the potential to exert cardioprotective effects against oxidative stress, which might be of great importance to clinical efficacy for cardiovascular disease. 展开更多
关键词 CARDIOMYOCYTES ADENOVIRUS R65 ribozyme Apoptosis NF-κB pathway
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Hub Genes of Astrocyte Involved in Glaucoma with Ocular Hypertension by Integrated Bioinformatics Analysis 被引量:1
8
作者 Yi-Jing YANG Yu XIANG +4 位作者 Ye TIAN Fei XIA Ya-Sha ZHOU Jun PENG Qing-Hua PENG 《Digital Chinese Medicine》 2018年第4期280-288,共9页
This study was conducted to elucidate the potential key candidate genes and pathways in role of astrocyte involved in glaucoma with ocular hypertension.Methods Expression profiles GSE2378 and GSE758 including 27 react... This study was conducted to elucidate the potential key candidate genes and pathways in role of astrocyte involved in glaucoma with ocular hypertension.Methods Expression profiles GSE2378 and GSE758 including 27 reactive optic nerve head astrocytes(ONHAs)by hypertensions and 26 normal controls,were integrated and deeply analyzed.Differentially expressed genes(DEGs)were sorted and candidate genes and pathways enrichment were analyzed.DEGs-associated protein-protein interaction network(PPI)was performed.Results A total of 119 consistently expressed genes were identified from 281 commonly changed DEGs,including 68 up-regulated genes and 51 down-regulated genes.PPI network complex filtered 75 DEGs(43 up-regulated and 32 down-regulated genes)of the 119 consistently altered DEGs and developed 117 edges,and 10 hub genes were identified.The most significant 3 modules were filtered from PPI,pathway enrichment analysis showed that module 1 was associated with extracellular exosome.Module 2 was mainly associated with antibody-dependent cellular cytotoxicity(ADCC)and module 3 was mainly associated with Hippo signaling pathway.Conclusion Taken above,using integrated bioinformatical analysis,we have identified DEGs candidate genes and pathways in role of astrocyte involved in glaucoma with ocular hypertension,which could improve our understanding of the cause and underlying molecular events,and these candidate genes and pathways could be therapeutic targets for glaucoma. 展开更多
关键词 GLAUCOMA Ocular hypertension Reactive optic nerve head astrocytes Hub gene Pathway enrichment
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血液净化中心血管通路核心护理团队的建设与管理
9
作者 林芝 王亚雯 鲁晓雅 《中文科技期刊数据库(全文版)医药卫生》 2021年第5期184-184,共1页
分析血液净化中心建设血管通路核心护理团队的管理效果。方法:由血液净化中心选择66例维持性血液透析患者,观察组行血管通路核心护理团队建设与管理,对照组采用常规动静脉内瘘护理,住院期间,护士应给予患者实施术前、术后健康宣教工作,... 分析血液净化中心建设血管通路核心护理团队的管理效果。方法:由血液净化中心选择66例维持性血液透析患者,观察组行血管通路核心护理团队建设与管理,对照组采用常规动静脉内瘘护理,住院期间,护士应给予患者实施术前、术后健康宣教工作,对患者疑难动静脉、新动静脉内瘘穿刺进行评估,护士长应确保当日合理将高年资护士分配,协助护士将穿刺工作顺利开展。每个班次,护士应将4~5例患者分管,护士在透析过程中应负责患者动静脉内瘘常规评估、告知血管通路护理注意事项等,若患者出现血管通路并发症,应及时与临床医师取得联系并协助临床医师对患者进行对症处理。结果:对比对照组,观察组明显改善了形成内瘘穿刺血肿几率、穿刺成功率、内瘘感染几率、内瘘闭塞率,P<0.05。结论:建设血液净化中心血管通路核心护理团队并将其应用于管理过程中,效果显著。 展开更多
关键词 血液净化中心 血管通路核心护理团队 建设 管理
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PCP通路调节平面细胞极性的建立 被引量:2
10
作者 张辉辉 赵金支 +1 位作者 罗瑛 吴晓明 《生命的化学》 CAS CSCD 2017年第2期200-206,共7页
平面细胞极性(planar cell polarity,PCP)的建立是胚胎发育过程中的一个关键环节。PCP通路在进化上高度保守,包括"核心"PCP通路和"Ds/Ft"PCP通路,两者共同调节平面细胞极性的建立,导致细胞发生汇聚延伸(convergent ... 平面细胞极性(planar cell polarity,PCP)的建立是胚胎发育过程中的一个关键环节。PCP通路在进化上高度保守,包括"核心"PCP通路和"Ds/Ft"PCP通路,两者共同调节平面细胞极性的建立,导致细胞发生汇聚延伸(convergent extension,CE)运动和定向的细胞分裂(oriented cell division,OCD)。PCP通路的正确激活以及正常的细胞结构需要PCP蛋白的不对称性分布,由Wnt蛋白和Ft-Ds-Fj系统提供极性信号,激活下游效应器而产生。本文综述了PCP通路在平面细胞极性建立过程中的作用及分子机制,旨在为胚胎发育相关疾病积累理论基础。 展开更多
关键词 平面细胞极性 核心”PCP通路 “Ds/Ft”PCP通路 汇聚延伸 定向分裂 疾病发生
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以血液净化护理辅修方向为例探讨通专结合护理人才培养模式的构建 被引量:4
11
作者 潘奕娴 《中医药管理杂志》 2021年第4期113-114,共2页
目的:以血液净化护理辅修方向为例,探究血管通路核心护理团队的构建对血液中心护理人才的培养效果。方法:血液净化中心自2019年建设血管通路核心护理团队,由护士长担任组长,并聘请1名血管通路专科医师和1名血管超声医师作为指导顾问,明... 目的:以血液净化护理辅修方向为例,探究血管通路核心护理团队的构建对血液中心护理人才的培养效果。方法:血液净化中心自2019年建设血管通路核心护理团队,由护士长担任组长,并聘请1名血管通路专科医师和1名血管超声医师作为指导顾问,明确团队职责及团队内各成员职责,设计血管通路核心护理团队的工作流程,做好质控管理工作,分别对2018年的243名维持性血液透析患者和2019年的256名维持性血液透析患者资料进行统计,比较不同时期患者的内瘘感染和内瘘闭塞发生率,并调查评估不同时期血管通路核心护理团队成员的核心护理能力水平。结果:2019年患者的内瘘感染率、内瘘闭塞率均显著低于2018年(P<0.05);与2018年相比,2019年血液净化中心护士的血管评估、方案拟定、风险防控、风险应对能力均显著提升(P<0.05)。结论:建立血管通路核心护理团队能够显著提升血液净化中心护士的核心护理能力,可有效降低内瘘感染、内瘘闭塞等不良事件的发生率,全面提升了血液净化中心的护理质量。 展开更多
关键词 血液净化中心 护理管理 血管通路核心护理团队 核心能力
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