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益母草类中药原植物的核核糖体内转录间隔区序列分析 被引量:7
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作者 杨志业 晁志 +2 位作者 霍克克 吴炳义 潘胜利 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第11期1593-1595,共3页
目的分析益母草属4种植物nrDNAITS序列,探讨其在益母草药材DNA分子鉴别中的作用。方法对4种益母草属植物分别进行ITS序列的PCR扩增和测序,并运用CLUSTRALX和MEGA软件进行分析。结果测得4种植物的ITS序列,包括ITS1、5.8S和ITS2全长序列以... 目的分析益母草属4种植物nrDNAITS序列,探讨其在益母草药材DNA分子鉴别中的作用。方法对4种益母草属植物分别进行ITS序列的PCR扩增和测序,并运用CLUSTRALX和MEGA软件进行分析。结果测得4种植物的ITS序列,包括ITS1、5.8S和ITS2全长序列以及18S、26S部分序列;益母草及其易混淆的3种植物ITS1、ITS2序列的差异性分别为7.2%~18.8%和14.2%~27%。根据ITS序列特征所构建的系统树与传统分类有所不同。结论ITS序列特征可作为益母草种间鉴别的有效分子标记。 展开更多
关键词 益母草属 ITS 序列分析 核核糖体
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利用核核糖体DNA内转录间隔区(ITS)探讨广义羽藓科系统发育 被引量:5
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作者 张会 黄勤妮 +2 位作者 杜桂森 吴鹏程 刘霞 《云南植物研究》 CSCD 北大核心 2003年第4期491-496,共6页
利用核核糖体DNAITS序列 ,探讨了苔藓植物广义羽藓科的系统发育 ,摸索出适于扩增ITS片段的最适反应条件。实验共得到广义羽藓科 6个种的ITS序列 ,它们分别是 :Abieti nellaabietina (AJ4 174 94 ) ,Anomodonminor (AJ344 14 5 ) ,Claopo... 利用核核糖体DNAITS序列 ,探讨了苔藓植物广义羽藓科的系统发育 ,摸索出适于扩增ITS片段的最适反应条件。实验共得到广义羽藓科 6个种的ITS序列 ,它们分别是 :Abieti nellaabietina (AJ4 174 94 ) ,Anomodonminor (AJ344 14 5 ) ,Claopodiumaciculum (AJ315 96 8) ,Thuidiumpristocalyx (AJ4 16 443) ,Thuidiumassimile (AJ4 16 442 ) ,Herpetineurontoccoae(AJ315 96 7) ,其中后 5个种是国际上首次得到的。本文利用ITS序列构建羽藓科 7属、 11种植物的系统发育树 ,据Bootstrap严格一致树表明 :广义的羽藓科为并系发育 ,可分为两个主要的分支 ,牛舌藓属Anomodon ,羊角藓属Herpetineuron和多枝藓属Haplohymenium等为一支 ,而山羽藓属Abietinella ,羽藓属Thuidium ,沼羽藓属Helodium和麻羽藓属Claopodium等为另一主要分支 ,从分子水平上支持了据形态特征把原牛舌藓亚科的牛舌藓属 ,羊角藓属 ,多枝藓属提升为牛舌藓科的结论。 展开更多
关键词 核核糖体DNA 内转录间隔区 羽藓科 系统发育
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3种柔鱼线粒体基因与核核糖体基因片段序列比较分析 被引量:2
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作者 刘连为 陈新军 +2 位作者 许强华 王从军 余为 《广东海洋大学学报》 CAS 2013年第6期24-29,共6页
为准确检测柔鱼(Ommαstrephesbartram川、茎柔鱼( Dosidicus gigas)与阿根廷滑柔鱼( IIIex argentinus ) 的种间遗传差异,对线粒体16SrRNA、细胞色素b(Cytb)与编码核糖体大亚基的基因(28SrDNA)片段序列进 行测定。经比对获... 为准确检测柔鱼(Ommαstrephesbartram川、茎柔鱼( Dosidicus gigas)与阿根廷滑柔鱼( IIIex argentinus ) 的种间遗传差异,对线粒体16SrRNA、细胞色素b(Cytb)与编码核糖体大亚基的基因(28SrDNA)片段序列进 行测定。经比对获得同源片段序列的长度分别为444、430、464坤,其中16SrRNA与28SrDNA基因片段上分别存在3处和47处碱基插入/缺失。核昔酸组成分析表明;3种柔鱼在3个基因片段上的核音酸组成差异不显著, 在线粒体2个基因片段上的A+T含量(16SrRNA;69.90%、72.01%、74.66%; Cytb; 63.61%、68.91%、71.65% ) 均明显高于C+C含量(16SrRNA;30.10%、27.99%、25.34%; Cytb; 36.39%、31.09%、28.35% ),而在28SrDNA 基因片段上的A+T含量(37.16%、36.74%、38.29% )明显低于C+C含量(62.84%、63.26%、61.71 %)0 3种柔鱼 在28SrDNA基因片段上检测到的核昔酸替代率最低,为6.68%,而蛋白质编码基因Cytb核昔酸替代率最高,为 20.93%,核营酸替代均发生在密码子第3位点上,而且未引起氨基酸替代。基于邻接法、最大简约法与最大似然 法重建的系统树显示,柔鱼与茎柔鱼的亲缘关系较近。根据C严b基因片段序列分析,柔鱼与茎柔鱼和阿根廷滑柔鱼的分歧时间分别为653-790万a和765 - 925万a,种间分化事件发生在中新世至上新世间。 展开更多
关键词 柔鱼 线粒体基因 核核糖体基因 序列分析 分歧时间
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绵枣儿核核糖体DNA ITS序列扩增的研究 被引量:2
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作者 尚彩玲 丁开宇 《山西中医学院学报》 2009年第4期52-54,共3页
采用通用引物扩增绵枣儿核核糖体DNA ITS序列,未得到目的条带。根据引物设计原则自行设计12个引物,其中只有使用引物对PA3、D(ITS3),PA4、D(ITS3),PA4、DO2扩增得到绵枣儿核核糖体DNA ITS序列。
关键词 核核糖体 ITS序列 引物设计
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植物核基因组核糖体基因间隔区序列的结构特点及其在系统发育研究中的应用 被引量:12
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作者 王川易 郭宝林 《武汉植物学研究》 CSCD 北大核心 2008年第4期417-423,共7页
目前,在植物系统发育研究中应用较多的核基因组的核糖体DNA基因间隔区序列主要有5S rDNA基因间隔区、内转录间隔区ITS和基因间间隔区IGS。虽然这些间隔区序列在长度、结构等方面各不相同,但都具有进化速率较快的特点,在植物属及属下分... 目前,在植物系统发育研究中应用较多的核基因组的核糖体DNA基因间隔区序列主要有5S rDNA基因间隔区、内转录间隔区ITS和基因间间隔区IGS。虽然这些间隔区序列在长度、结构等方面各不相同,但都具有进化速率较快的特点,在植物属及属下分类水平的系统发育关系研究中非常有用。本文重点就核基因组的5S rDNA基因间隔区以及IGS在植物中的特点以及各自在植物系统发育研究中的应用进行了综述。 展开更多
关键词 基因组核糖体DNA 5S rDNA基因间隔区 IGS 系统发育
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应用ROC曲线评价P53抗体及核内小核糖体蛋白U1-A抗体对非小细胞肺癌的诊断价值 被引量:2
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作者 潘辉 蔡曦光 +1 位作者 刘华 杨文平 《国际呼吸杂志》 2012年第10期764-768,共5页
目的评价P53抗体和U1AsnRNP(核内小核糖体蛋白U1-A)抗体检测对非小细胞肺癌的诊断价值和临床意义。方法采用酶联免疫吸附法检测了46例非小细胞肺癌患者血清中的P53抗体及U1-AsnRNP抗体,并以43名健康人血清作对照。结果非小细胞肺癌... 目的评价P53抗体和U1AsnRNP(核内小核糖体蛋白U1-A)抗体检测对非小细胞肺癌的诊断价值和临床意义。方法采用酶联免疫吸附法检测了46例非小细胞肺癌患者血清中的P53抗体及U1-AsnRNP抗体,并以43名健康人血清作对照。结果非小细胞肺癌组血清P53抗体浓度的中位数(四分位数间距)E25.38μg/L(65.69pg/L)]明显高于对照组血清P53抗体浓度的中位数(四分位数间距)[10.45fig/L(10.44μg/L)],两组间比较差异有统计学意义(P=0.000);非小细胞肺癌组血清U1-AsnRNP抗体浓度的中位数(四分位数间距)和对照组血清U1-AsnRNP抗体浓度的中位数(四分位数间距)分别为165.57U/L(104.51U/L)、170.05U/L(74.12U/L),两组间比较差异无统计学意义(P=0.715);应用ROC曲线对P53抗体和U1-AsnRNP抗体对非小细胞肺癌的诊断价值进行了评价,ROC曲线下面积分别0.717、0.478,P53抗体诊断非小细胞肺癌的敏感性和特异性分别为62.2%、79.1%。结论P53抗体对tP4,细胞肺癌的诊断有较好的敏感性和特异性,血清P53抗体检测对非小细胞肺癌诊断有一定的临床意义;U1-AsnRNP抗体对非小细胞肺癌的诊断价值欠佳。 展开更多
关键词 蛋白P53 内小核糖体蛋白U1-A 抗体 非小细胞肺癌 诊断 ROC曲线
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睡莲类植物ITS nrDNA序列的分子系统发育分析 被引量:11
7
作者 唐先华 张晓艳 +2 位作者 施苏华 钟扬 赖旭龙 《地球科学(中国地质大学学报)》 EI CAS CSCD 北大核心 2003年第1期97-101,共5页
睡莲类植物是目前植物分子系统学与进化研究的一个重要类群 .核基因组的ITS区是核核糖体 (nrDNA)转录单位的一部分 .测定和分析了 5个属的 7种睡莲类植物的核核糖体ITS序列 ,并与GenBank中提取的相关序列进行了组合分析 ,初步获得了睡... 睡莲类植物是目前植物分子系统学与进化研究的一个重要类群 .核基因组的ITS区是核核糖体 (nrDNA)转录单位的一部分 .测定和分析了 5个属的 7种睡莲类植物的核核糖体ITS序列 ,并与GenBank中提取的相关序列进行了组合分析 ,初步获得了睡莲类植物的 2个ITS系统树 ,结果也支持现有分子系统学研究中有关金鱼藻处于较原始位置的观点 . 展开更多
关键词 睡莲类植物 ITS序列 分子系统树 DNA分子 金鱼藻 古生物 核核糖体
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海南橡胶藻18S rDNA与16S rDNA二级结构构建及分析 被引量:1
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作者 常凯军 谭德冠 +2 位作者 李定琴 孙雪飘 张家明 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第27期12965-12967,共3页
[目的]对海南橡胶藻的新属、新种地位进行确认。[方法]对海南橡胶藻这一重要生物资源的18S核编码核糖体RNA序列和16S叶绿体编码核糖体RNA序列进行分析,对18S核编码核糖体RNA进行近缘物种间的序列比对及2个I类内含子二级结构模型的构建。... [目的]对海南橡胶藻的新属、新种地位进行确认。[方法]对海南橡胶藻这一重要生物资源的18S核编码核糖体RNA序列和16S叶绿体编码核糖体RNA序列进行分析,对18S核编码核糖体RNA进行近缘物种间的序列比对及2个I类内含子二级结构模型的构建。[结果]橡胶藻16S rRNA在639位点(E.coli序列编号)有一个46 bp的插入片段,该片段能形成一个完美的双发夹结构,对16SrRNA的正常折叠不会产生影响。[结论]这一双发夹结构在其他物种的叶绿体rDNA中还未见报道过。 展开更多
关键词 18S编码核糖体RNA 16S叶绿体编码核糖体RNA I类内含子 双发夹结构
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NDV感染促进hnRNPA1进入细胞质帮助病毒增殖
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作者 姜维雨 丁铲 廖瑛 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2021年第5期7-12,共6页
新城疫病毒(NDV)属于单股负链病毒目(Mononegavirales)副粘病毒科(Paramyxoviridae)禽副粘病毒属(Avulavirus)。核不均一核糖体蛋白A1(hnRNPA1)在细胞核结合并影响前体mRNA的剪切和成熟mRNA的转运。为研究hnRNPA1是否调控NDV感染,本研... 新城疫病毒(NDV)属于单股负链病毒目(Mononegavirales)副粘病毒科(Paramyxoviridae)禽副粘病毒属(Avulavirus)。核不均一核糖体蛋白A1(hnRNPA1)在细胞核结合并影响前体mRNA的剪切和成熟mRNA的转运。为研究hnRNPA1是否调控NDV感染,本研究通过间接免疫荧光实验检测了hnRNAP1在病毒感染过程中的亚细胞定位。结果显示,NDV感染促进hnRNPA1蛋白出核,并与病毒核衣壳蛋白NP共定位;免疫共沉淀实验证实,hnRNPA1分别与病毒核衣壳蛋白NP和病毒膜蛋白M相互作用;以siRNA干扰hnRNPA1的表达,NDV增殖受到抑制,过表达hnRNPA1则促进NDV增殖。上述结果表明,NDV感染促进部分hnRNPA1进入细胞质,与病毒NP蛋白相互作用并促进病毒增殖。该研究结果为hnRNPA1参与副粘病毒复制的研究奠定了理论基础。 展开更多
关键词 新城疫病毒 不均一核糖体蛋白A1 输出 M蛋白 NP蛋白
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致癌突变新类型的发现提示可能的治疗方案
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作者 悦悦 《中华医学信息导报》 2002年第14期10-11,共2页
关键词 致癌基因 RNA剪接 核糖体蛋白 管状髓磷脂
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