流感病毒B/四川/379/99的核苷酸及氨基酸序列分析

目的 从分子水平研究四川省乙型流感病毒的变异规律 ,了解其变异特性和变异程度。方法 病毒分离及鉴定方法按照国家标准GB15 994-1995的方法 ;抗原分析用常量半加敏红细胞凝集抑制法 ;核苷酸序列测定采用逆转录双脱氧链终止法 ,DNA序列测定仪读序。结果 发现流感病毒B/四川 /379/99属于B/Yamagata/16 /88毒株系列 ,但与B/北京 /184/93相比抗原性发生了明显的变异 ,核苷酸序列也有 2 7处发生了点突变 ,异致氨基酸序列 12处发生突变 ,其中有 6处位于 70～ 90和 110～ 2 10这两个与抗原决定簇有关的部位。结论 流感病毒B/四川

遗传性痉挛性截瘫患者ERDA1和SEF2-1基因三核苷酸重复序列的研究

目的 对ERDA1基因CAG/CTG和SEF2 1基因CTG重复序列数目的遗传性痉挛性截瘫 (HSP)患者及正常人群中的分布和二者在逐代传递中的动态变化进行研究。方法 采用PCR扩增 ,聚丙烯酰胺凝胶电泳 ,GeneS can和Genotype软件分析的方法 ,对 7个有 2～ 3代样本的HSP家系中的 6 2名HSP患者和家系中 10 5名表型正常的患者亲属 ,2 2名散发患者和 31名散发患者的一级亲属 ,以及 116名无血缘关系的正常人检测ERDA1基因CAG/CTG和SEF2 1基因CTG重复序列的数目。结果 ERDA1基因CAG/CTG重复序列的数目在正常人中范围为 9～ 82 (平均2 6 35± 2 0 35 ) ,HSP患者为 9～ 85 (平均 2 8 35± 2 3 4 1) ,患者亲属为 9～ 87(平均 2 6 36± 2 2 0 6 )。SEF2 1基因CTG重复序列的数目在正常人中范围为 2 3～ 4 9(平均 30 90± 6 95 ) ,HSP患者为 2 4～ 5 7(平均 31 17± 7 99) ,患者亲属为 18～ 5 3(平均 30 37± 7 0 2 )。两种三核甘酸重复序列数目在HSP患者与患者亲属之间 ,以及患者与无关正常人群之间比较均无显著性差异。尽管在逐代传递中ERDA1基因CAG/CTG重复序列数目有一定的动态变化 ,但与发病年龄和疾病的严重程度无关。而SEF2 1基因CTG重复序列数目在各代间稳定传递。结论 ERDA1基因CAG/CTG和SEF2 1基因CTG重?

基因芯片检测结核分枝杆菌对利福平和异烟肼耐药性

目的研究基因芯片在检测结核分枝杆菌对利福平和异烟肼耐药性中的应用。方法根据与利福平和异烟肼耐药相关的4条基因上的11个位点和30种单核苷酸多态性设计制作芯片,用芯片检测结核分枝杆菌的基因突变,从而判断其耐药性。结果用基因芯片在110株异烟肼耐药株中检测出85侏(73.3%),在30株异烟肼敏感株中检测出22株(73.3%),在94株利福平耐药株中检测出77株(81.9%),在46株利福平敏感株中检测出40株(87.0%)。芯片检测结果与部分样本的测序结果完全相符。结论用DNA芯片检测结核分枝杆菌对利福平和异烟肼的耐药性具有较高的特异性和敏感性,该法快速、精确,可以应用于结核分枝杆菌耐药性的检测。

海带cbbX基因序列特征及在雌、雄配子体之间的差异表达

根据海带雄配子体抑制消减cDNA文库中筛选出的克隆18序列设计基因特异性引物,利用cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE),克隆了一条长2087bp的cDNA序列(GenBank登陆号:EF490312),其中开放阅读框1275bp,5′-非翻译区(untranslated region,UTR)长118bp,3′-UTR长694bp且具有明显的polyA尾巴。蛋白同源搜索显示,它编码的蛋白与Guillardiatheta这种隐藻核型体编码的CbbX蛋白(GenBank登录号:CAB65663)具有66%同源性。推测的海带配子体cbbX基因编码一个含有424个氨基酸的前体蛋白,前19个氨基酸为信号肽序列。酶切后的成熟蛋白由405个氨基酸组成,分子量为45.26ku,等电点为5.28。海带配子体cbbX基因被8个内含子隔离开,它们的剪切位点都遵循"GT-AG"规则。无论在cDNA或者DNA序列上,雌、雄配子体cbbX基因都没有差异。自编码蛋白的第184位Gly开始,具有一个典型的Walker ATP-结合motif。通过与其它物种共14个CbbX蛋白序列构建的neighbor-joining系统演化树可知,它与隐藻核型体及红藻核基因组编码的蛋白聚成一类,而区别于叶绿体编码蛋白。因此,推测该克隆的海带配子体,cbbX基因可能是由核基因组编码的。荧光定量PCR(Q-RT-PCR)结果证实,cbbX基因在海带雄配子体的表达量明显高于雌配子体的,且在雌、雄配子体之间存在不同的日转录图谱。实验为海带配子体cbbX这个差异表达基因的功能研究和亚细胞定位奠定了基础。

科技动态

日本三井东压化学公司的综合研究所,最近利用原生质体培养成功能结实的水稻,并计划在1986年春季将该稻谷播种到试验田进行品质鉴定。 该公司的作法是:以“笹锦”和“日本晴”两个品种为材料,首先从种子中取出一部分组织。

2型糖尿病大鼠骨骼肌基因表达谱研究

用基因芯片技术比较2型糖尿病大鼠和正常大鼠骨骼肌基因表达谱的差异。糖尿病大鼠有157种基因下调,100种基因上调,部分基因与胰岛素抵抗、糖脂代谢相关。

基因芯片在乳腺癌研究中的应用

基因芯片因能快速检测肿瘤组织和细胞中的基因表达情况而广泛应用于乳腺癌研究中。可以根据乳腺癌基因表达情况对乳腺癌进行分子分型、预测预后，且能够有效地检测内分泌治疗、化学治疗和分子靶向治疗的敏感性。基因芯片技术与乳腺癌临床研究结合将会提高乳腺癌临床治疗水平。