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用核糖体扫描模型预测翻译起始位点
1
作者
刘利
李前忠
《内蒙古大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第2期173-180,共8页
真核生物翻译起始位点(TIS,translation initiation site)的正确预测对于基因的正确注释有着重大的意义.在真核生物中,翻译并不都是起始于第一个AUG密码子,还取决于AUG前后序列的信息.结合位置权重矩阵(PWM,position weight matrix)和...
真核生物翻译起始位点(TIS,translation initiation site)的正确预测对于基因的正确注释有着重大的意义.在真核生物中,翻译并不都是起始于第一个AUG密码子,还取决于AUG前后序列的信息.结合位置权重矩阵(PWM,position weight matrix)和开放阅读框架(ORF,open reading frame)的长度分布特征建立了简单的方法识别翻译起始位点,此方法能很好地区分上游AUG和TIS.对于脊椎动物以及人类的mRNA序列,运用核糖体扫描模型预测其翻译起始位点得到了很好的预测率.
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关键词
翻译起始位点
核糖体扫描
模型
位置权重矩阵
开放阅读框架
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职称材料
同义密码子使用模式对多肽链共翻译折叠的影响研究进展
2
作者
汪梦竹
胡欣妍
+2 位作者
杨宣叶
高明阳
周建华
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第7期3146-3158,共13页
同义密码子使用模式作为核苷酸与氨基酸的纽带,其多样性介导了核糖体扫描速率,同时扩充了基因的遗传信息存储量。随着新型技术的应用,发现特异性密码子和密码子结合力可调节核糖体扫描速率并影响蛋白质构象。同义密码子使用模式通过多...
同义密码子使用模式作为核苷酸与氨基酸的纽带,其多样性介导了核糖体扫描速率,同时扩充了基因的遗传信息存储量。随着新型技术的应用,发现特异性密码子和密码子结合力可调节核糖体扫描速率并影响蛋白质构象。同义密码子使用模式通过多种方式在不同环节影响着核糖体扫描速率,同时还影响着自身mRNA的稳定性。本文简述了密码子使用模式如何在核糖体扫描翻译mRNA的过程中实现对多肽链翻译延伸的调控,为今后生物工程学领域如何优化蛋白高效表达提供可参考的思路与理念。
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关键词
同义密码子使用模式
遗传信息
基因表达
核糖体扫描
TRNA
原文传递
题名
用核糖体扫描模型预测翻译起始位点
1
作者
刘利
李前忠
机构
内蒙古大学理工学院物理系
出处
《内蒙古大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第2期173-180,共8页
基金
国家自然科学基金资助项目(30560039)
文摘
真核生物翻译起始位点(TIS,translation initiation site)的正确预测对于基因的正确注释有着重大的意义.在真核生物中,翻译并不都是起始于第一个AUG密码子,还取决于AUG前后序列的信息.结合位置权重矩阵(PWM,position weight matrix)和开放阅读框架(ORF,open reading frame)的长度分布特征建立了简单的方法识别翻译起始位点,此方法能很好地区分上游AUG和TIS.对于脊椎动物以及人类的mRNA序列,运用核糖体扫描模型预测其翻译起始位点得到了很好的预测率.
关键词
翻译起始位点
核糖体扫描
模型
位置权重矩阵
开放阅读框架
Keywords
translation initiation site
ribosome scanning model
position weight matrix
open reading frame
分类号
Q61 [生物学—生物物理学]
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职称材料
题名
同义密码子使用模式对多肽链共翻译折叠的影响研究进展
2
作者
汪梦竹
胡欣妍
杨宣叶
高明阳
周建华
机构
西北民族大学生物医学研究中心生物工程与技术国家民委重点实验室
西北民族大学生物医学研究中心甘肃省动物细胞技术创新中心
西北民族大学生命科学与工程学院
中国农业科学院兰州兽医研究所
出处
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第7期3146-3158,共13页
基金
西北民族大学引进人才科研项目(xbmuyjrc202225)
中央高校基本科研业务费专项资金(31920220069)
国家自然科学基金(31302100)。
文摘
同义密码子使用模式作为核苷酸与氨基酸的纽带,其多样性介导了核糖体扫描速率,同时扩充了基因的遗传信息存储量。随着新型技术的应用,发现特异性密码子和密码子结合力可调节核糖体扫描速率并影响蛋白质构象。同义密码子使用模式通过多种方式在不同环节影响着核糖体扫描速率,同时还影响着自身mRNA的稳定性。本文简述了密码子使用模式如何在核糖体扫描翻译mRNA的过程中实现对多肽链翻译延伸的调控,为今后生物工程学领域如何优化蛋白高效表达提供可参考的思路与理念。
关键词
同义密码子使用模式
遗传信息
基因表达
核糖体扫描
TRNA
Keywords
synonymous codon usage pattern
genetic information
gene expression
ribosome scanning
tRNA
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
用核糖体扫描模型预测翻译起始位点
刘利
李前忠
《内蒙古大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2007
0
下载PDF
职称材料
2
同义密码子使用模式对多肽链共翻译折叠的影响研究进展
汪梦竹
胡欣妍
杨宣叶
高明阳
周建华
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
原文传递
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