核糖体模型研究进展

随着低温电子显微镜、X射线晶体衍射等技术的发展以及有关核糖体各组分结构数据的增多 ,高分辨率的E .coli核糖体模型已经被建立 .对该模型作了概要介绍 ,包括了对mRNA通道 ,A、P位点tRNA ,肽基转位酶 ,肽通道等在核糖体中的定位以及它们与核糖体的相互作用 .有助于提高对核糖体结构、功能、及翻译过程的理解 .

用核糖体扫描模型预测翻译起始位点

真核生物翻译起始位点(TIS,translation initiation site)的正确预测对于基因的正确注释有着重大的意义.在真核生物中,翻译并不都是起始于第一个AUG密码子,还取决于AUG前后序列的信息.结合位置权重矩阵(PWM,position weight matrix)和开放阅读框架(ORF,open reading frame)的长度分布特征建立了简单的方法识别翻译起始位点,此方法能很好地区分上游AUG和TIS.对于脊椎动物以及人类的mRNA序列,运用核糖体扫描模型预测其翻译起始位点得到了很好的预测率.

核糖体三维结构模型的制作与使用

核糖体三维结构模型的制作与使用柴晓青，印莉萍，李丹（首都师范大学生物学系１０００３７）为帮助学生理解核糖体的三维立体结构和某些功能结构定位，我们制作了核糖体结构的简易模型。１核糖体的立体结构每一个核糖体包括有大小亚基两个单位（见图１、Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ）...