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牛羊源土耳其斯坦东毕吸虫ITS和28S rDNA-LSU序列分析 被引量:1
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作者 仇建华 李利 +3 位作者 王春仁 陈佳 陈爱华 翟延庆 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期183-186,190,共5页
目的探讨牛羊源土耳其斯坦东毕吸虫(Orientobilharzia turkestanicum)核糖体内转录间隔区(ITS)和28S核糖体大亚基序列(rDNA-LSU)的差异。方法粪便检查、剖杀自然感染东毕吸虫的绒山羊、山羊、绵羊和黄牛,收集虫体,形态学鉴定为土耳其斯... 目的探讨牛羊源土耳其斯坦东毕吸虫(Orientobilharzia turkestanicum)核糖体内转录间隔区(ITS)和28S核糖体大亚基序列(rDNA-LSU)的差异。方法粪便检查、剖杀自然感染东毕吸虫的绒山羊、山羊、绵羊和黄牛,收集虫体,形态学鉴定为土耳其斯坦东毕吸虫。抽提成虫基因组DNA,扩增其ITS(包括ITS-1、5.8S rDNA和ITS-2)和28S rDNA-LSU序列,测序并分析以上序列,以及28S rDNA-LSU序列RNA二级结构。结果牛、羊源土耳其斯坦东毕吸虫的ITS-1、5.8S rDNA、ITS-2和28S rDNA-LSU序列分别长384、159、331和1304bp。牛源和羊源的ITS-1和5.8S rDNA序列完全相同;黄牛源、绵羊源和绒山羊源的ITS-2序列完全相同,与山羊源存在1个碱基的差异;绵羊源和绒山羊源的28S rDNA-LSU序列完全相同,与牛源和山羊源分别有2个碱基的差异。绵羊源和绒山羊源的28S rDNA-LSU序列RNA二级结构相同,与山羊源存在微小差异,但牛源与羊源存在较大差异。结论不同终末宿主源土耳其斯坦东毕吸虫的核糖体序列存在不同程度的差异,羊源28S rDNA-LSU序列的RNA二级结构相同或相似,但与牛源存在较大差异。 展开更多
关键词 土耳其斯坦东毕吸虫 核糖体内转录间隔区 5.8S核糖体dna 28S核糖体dna大亚基序列 序列分析
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Chromosomal localization of ribosomal DNA sequences in an apple rootstock using a digoxygenin detection system
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作者 ZHU JIMEI S E GARDINER (The Horticulture and Food Research Institute of New Zealand Limited) (Mt Albert Research Centre, Privatc Bag 92 169, Auck-land, New Zealand)(Batchelar Research Centre, Private Bag 11 030,Palmerston North, New Zealand) 《Cell Research》 SCIE CAS CSCD 1995年第1期1-7,共7页
A 6kb rDNA probe comprising the 18S coding plusspacer sequences has been hybridized to the metaphase chromosomes of apple rootstock cultivar MM106 demon-strating the localization of ribosomal gene arrays in the vicini... A 6kb rDNA probe comprising the 18S coding plusspacer sequences has been hybridized to the metaphase chromosomes of apple rootstock cultivar MM106 demon-strating the localization of ribosomal gene arrays in the vicinity of the telomeric regions of the short arms of chro-mosomes 6 and 14. The in situ results using digoxygenin labelling coupled to an alkaline phosphatase immunoassay were confirmed by silver staining for NORs and nucleoli. This study demonstrates the feasibility of molecular cyto-genetic analysis of very small chromosomes (1.0-2.7μm)of apple. 展开更多
关键词 根尖 苹果 核糖体dna序列 染色体定位 银染 核型分析 细胞杂交 无放射活性检测系统
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浙江无核柿炭疽病菌鉴定及附着胞形成过程中的核相变化 被引量:19
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作者 张敬泽 徐同 何黎平 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期446-456,共11页
浙江无核柿炭疽病近年来在浙江淳安地区严重发生,根据形态学特征病原菌鉴定为胶孢炭疽菌Colletotrichum gloeosporioides Penz.,在枝条病斑上的分生孢子盘通常不产生刚毛,分生孢子顶端顶部钝圆,基部平截,分生孢子盘中的孢子包埋在基质中... 浙江无核柿炭疽病近年来在浙江淳安地区严重发生,根据形态学特征病原菌鉴定为胶孢炭疽菌Colletotrichum gloeosporioides Penz.,在枝条病斑上的分生孢子盘通常不产生刚毛,分生孢子顶端顶部钝圆,基部平截,分生孢子盘中的孢子包埋在基质中,紧密结合在一起.分生孢子在自然寄主和人工培养条件下形态特征相似.6个柿树炭疽菌菌株的rDNA ITS序列联配显示,其序列是相同的.用UPGMA方法分析ITS1-ITS2序列构建的炭疽菌系统发育树把6个柿树炭疽菌菌株和其它寄主上的胶孢炭疽菌或其有性型围小丛壳菌菌系分入同一个组,与根据形态学的鉴定结果一致.在附着胞形成过程中,用DAPI荧光染色观察到核相发生两次有丝分裂变化.第一次有丝分裂发生在分生孢子固着聚苯乙烯塑料培养皿3-4 h后,随后,分生孢子中部形成一个隔膜,把它分成两个细胞;6~7 h后,分生孢子发生第二次有丝分裂.分裂后,一个核通过芽管移入附着胞中. 展开更多
关键词 形态学 核糖体dna序列 胶孢炭疽病菌
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基于DNA条形码技术的北柴胡种子分子鉴定 被引量:11
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作者 赵晴 谢红波 +4 位作者 央拉 魏妙洁 石林春 刘金欣 赵春颖 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第14期182-189,共8页
目的:建立基于核糖体DNA内转录间隔区(ITS)序列的北柴胡种子分子鉴定方法,保障北柴胡栽培种子的物种准确。方法:收集北柴胡及主要栽培柴胡属物种种子、市售北柴胡种子样品共59份,探究不同取样量和不同水浴条件对种子DNA提取质量的影响,... 目的:建立基于核糖体DNA内转录间隔区(ITS)序列的北柴胡种子分子鉴定方法,保障北柴胡栽培种子的物种准确。方法:收集北柴胡及主要栽培柴胡属物种种子、市售北柴胡种子样品共59份,探究不同取样量和不同水浴条件对种子DNA提取质量的影响,建立柴胡属种子DNA提取方法;通过聚合酶链式反应(PCR)和双向测序得ITS条形码序列。从GenBank下载34条北柴胡、红柴胡、黑柴胡等主要栽培柴胡属物种ITS序列,丰富北柴胡种子鉴定数据库;利用MEGA-X10.0.5进行变异位点分析并构建邻接(NJ)系统发育树,考察ITS序列对北柴胡种子的物种鉴定能力;基于BLAST方法和NJ系统发育树法对市售北柴胡种子进行DNA条形码鉴定。结果:共获得59条北柴胡、红柴胡、三岛柴胡及市售北柴胡种子的ITS序列,北柴胡ITS序列可分为6个单倍型,包含7个变异位点,NJ系统发育树表明北柴胡所有单倍型可形成独立的枝,与所收集样品中其他柴胡属栽培物种可相互区分,具备北柴胡种子物种鉴定能力。基于ITS条形码序列鉴定发现19份市售北柴胡种子中有3份为三岛柴胡,伪品率15.8%。结论:基于ITS序列的DNA条形码技术可以准确可靠地鉴定北柴胡种子及其易混品,可为我国中药材种子规范化建设提供参考。 展开更多
关键词 北柴胡 种子 dna条形码 核糖体dna内转录间隔区(ITS)序列 分子鉴定 混伪品 三岛柴胡
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广东省柑橘炭疽病病原菌的形态与分子鉴定 被引量:34
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作者 王震 杨媚 +2 位作者 杨迎青 彭正凯 周而勋 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期488-493,共6页
炭疽病是柑橘的主要真菌性病害之一。2007年春,广东省德庆县名优柑橘品种贡柑炭疽病暴发流行。为了明确该县及广东省其他地区柑橘炭疽病菌的种类,为防治提供依据,对采集自广东省6个地区柑橘属10个栽培品种上的炭疽病样本进行病原菌分离... 炭疽病是柑橘的主要真菌性病害之一。2007年春,广东省德庆县名优柑橘品种贡柑炭疽病暴发流行。为了明确该县及广东省其他地区柑橘炭疽病菌的种类,为防治提供依据,对采集自广东省6个地区柑橘属10个栽培品种上的炭疽病样本进行病原菌分离,共获得柑橘炭疽病菌单孢菌株75株,对其中10株代表性的菌株进行了种类鉴定。通过培养性状和形态学特征观测、核糖体DNA(rDNA)内转录间区(ITS)序列分析、ITS区特异性引物PCR检测和系统发育关系比较等方面的研究,结果表明:10个柑橘炭疽病菌菌株均为盘长孢状刺盘孢Colletotrichum gloeosporioides,未发现国际上其他国家报道的严重危害柑橘花器和幼果部位的柑橘花后落果病病原菌——尖刺盘孢C.acutatum。 展开更多
关键词 盘长孢状刺盘孢 形态学特征 核糖体dna内转录间区序列分析
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Four new species of the genus Hymenoscyphus (fungi) based on morphology and molecular data 被引量:8
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作者 ZHENG HuanDi ZHUANG WenYing 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 2013年第1期90-100,共11页
Four new species of Hymenoscyphus (H. brevicellulus, H. hyaloexcipulus, H. microcaudatus, and H. subsymmetricus) and a new Chinese record (H. subpallescens) are described. These five species share common characteristi... Four new species of Hymenoscyphus (H. brevicellulus, H. hyaloexcipulus, H. microcaudatus, and H. subsymmetricus) and a new Chinese record (H. subpallescens) are described. These five species share common characteristics: small apothecia (<3mm in diameter); hymenium whitish, pale yellow, to yellow in color; ectal excipulum of textura prismatica; asci arising from simple septa; ascospores scutuloid and guttulate; saprophytic nutrition; and leaf habitats, except for H. subsymmetricus, which grows on herbaceous stems. Phylogenetic analyses of internal transcribed spacer nuclear ribosomal DNA sequences, the universal DNA barcode for fungi, for 16 species in the genus indicated that these taxa were closely related to H. microserotinus, in accordance with their morphological features, but represented independent species. The distinguishing features of each new species from its relatives are discussed, and their phylogenetic relationships explored. 展开更多
关键词 分子数据 真菌 种属 核糖体dna序列 形态学 内转录间隔区 系统发育分析 系统发育关系
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