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核苷酸合成代谢学习中奇幻联想法的应用
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作者 贾长虹 常丽新 +2 位作者 刘海燕 李玥 杨永强 《河北理工大学学报(社会科学版)》 2010年第4期113-114,120,共3页
介绍了如何将一种有效的记忆方法-奇幻联想法应用到核苷酸合成代谢的学习中,通过教学实践证明,该方法具有高效性和常效性。
关键词 奇幻联想法 核苷酸合成 嘧啶 嘌呤
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多肽/核苷酸合成用固相载体材料纤维素小球的制备及其表征
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作者 季生象 保罗.尼利 贾凯凯 《化工管理》 2015年第35期148-149,共2页
本文通过对多肽/核苷酸合成用固相载体材料纤维素小球的制备及其表征进行研究分析,通过研究证明:在纤维素小球制备过程中,加入成孔剂淀粉可使纤维素小球,内部呈蜂窝状,空隙较多,为多孔结构。并且纤维素与DMAC/Li Cl配成溶液时浓度要适中... 本文通过对多肽/核苷酸合成用固相载体材料纤维素小球的制备及其表征进行研究分析,通过研究证明:在纤维素小球制备过程中,加入成孔剂淀粉可使纤维素小球,内部呈蜂窝状,空隙较多,为多孔结构。并且纤维素与DMAC/Li Cl配成溶液时浓度要适中,溶液浓度较低时,无法得到完整的纤维素小球。 展开更多
关键词 多肽/核苷酸合成 固相载体材料 纤维素小球 成孔剂 淀粉
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对虾白斑综合征病毒胸腺嘧啶核苷酸合成酶基因的系统进化分析 被引量:2
3
作者 李嵚 杨丰 +1 位作者 张景海 陈英杰 《沈阳药科大学学报》 CAS CSCD 2004年第2期145-149,155,共6页
目的为了对对虾白斑综合征病毒 (whitespotsyndromevirus,WSSV)中最为保守的胸腺嘧啶核苷酸合成酶 (WSV TS)基因 ,进行该病毒的系统发育学研究。方法通过GenBankTM 数据库和DNAMAN分析系统 ,对不同生物来源的胸腺嘧啶核苷酸合成酶进行... 目的为了对对虾白斑综合征病毒 (whitespotsyndromevirus,WSSV)中最为保守的胸腺嘧啶核苷酸合成酶 (WSV TS)基因 ,进行该病毒的系统发育学研究。方法通过GenBankTM 数据库和DNAMAN分析系统 ,对不同生物来源的胸腺嘧啶核苷酸合成酶进行同源性比较并构建了该基因的系统发育进化树。结果 :WSV TS的氨基酸序列与来自高等生物 ,特别是同哺乳动物有着很高的同源性 ,而与多种病毒的同源性较低。结论WSV ts基因是WSSV基因组中最为保守的基因 ,其进化树的构建对于理解WSSV的进化地位有重要的帮助。 展开更多
关键词 胸腺嘧啶核苷酸合成 对虾白斑综合征病毒 同源性分析 系统进化分析
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枯草芽孢杆菌嘌呤核苷酸合成途径基因修饰及效应 被引量:1
4
作者 刘露 夏苗苗 班睿 《南开大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期53-58,79,共7页
在核黄素操纵子过表达的枯草芽孢杆菌中,采用无标记基因敲除方法,分别敲除GMP还原酶基因(guaC)、腺苷琥珀酸合成酶基因(purA)、嘌呤操纵子(pur operon)阻遏蛋白编码基因簇(purR-yabJ),并且用cryⅢA mRNA稳定子替换嘌呤操纵子的mRNA前导... 在核黄素操纵子过表达的枯草芽孢杆菌中,采用无标记基因敲除方法,分别敲除GMP还原酶基因(guaC)、腺苷琥珀酸合成酶基因(purA)、嘌呤操纵子(pur operon)阻遏蛋白编码基因簇(purR-yabJ),并且用cryⅢA mRNA稳定子替换嘌呤操纵子的mRNA前导区,构建了菌株LX35.采用实时定量PCR方法,测定其胞内嘌呤操纵子mRNA的相对水平.摇瓶发酵,测定其发酵液中的核黄素含量.结果显示,菌株LX35嘌呤操纵子的mRNA水平相对提高了53.33倍,核黄素产量提高了126.6%.使用cryⅢA mRNA稳定子,能够有效提高嘌呤操纵子的表达水平,有助于核黄素过量合成. 展开更多
关键词 pur操纵子 核黄素 实时定量PCR 嘌呤核苷酸合成途径 枯草芽孢杆菌
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烟酰胺腺嘌呤二核苷酸合成相关酶有助于1,4-丁二醇转化为4-羟基丁酸 被引量:1
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作者 张鑫 陈国强 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第12期1749-1754,共6页
4-羟基丁酸(4-HB)不仅具有医学应用价值,而且是合成生物材料P3HB4HB的重要前体。在烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD)参与情况下,大肠杆菌Escherichia coli S17-1(pZL-dhaT-aldD)可以把1,4-丁二醇(1,4-BD)转化为4HB。为提高4HB产率,通过过表达... 4-羟基丁酸(4-HB)不仅具有医学应用价值,而且是合成生物材料P3HB4HB的重要前体。在烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD)参与情况下,大肠杆菌Escherichia coli S17-1(pZL-dhaT-aldD)可以把1,4-丁二醇(1,4-BD)转化为4HB。为提高4HB产率,通过过表达烟酸磷酸核糖转移酶(PncB)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸合成酶(NadE)增加胞内NAD含量,从而加速1,4-BD转化反应的进行。结果表明,PncB-NadE的表达使1,4-BD转化率比对照组增加13.03%,由10 g/L的1,4-BD得到4.87 g/L的4HB,单位细胞的4HB产量由1.32 g/g提高40.91%至1.86 g/g。因此PncB和NadE可用于促进1,4-BD转化为4HB。 展开更多
关键词 4-羟基丁 1 4-丁二醇 烟酰胺腺嘌呤二核苷(NAD) 核糖转移酶 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸合成
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华裔科学家陈志坚发现感知DNA免疫监控的cGAS-STING信号通路——2024年拉斯克奖基础医学研究奖
6
作者 周妍 吴巍 《首都医科大学学报》 CAS 北大核心 2024年第5期923-927,共5页
北京时间2024年9月19日,生物医学领域重要奖项拉斯克奖(The Lasker Award)揭晓,华人学者陈志坚博士(德克萨斯大学西南医学中心)因发现感知自身及外源DNA的环鸟嘌呤-腺嘌呤核苷酸合成酶[cyclic guanosine monophosphate(GMP)-adenosine m... 北京时间2024年9月19日,生物医学领域重要奖项拉斯克奖(The Lasker Award)揭晓,华人学者陈志坚博士(德克萨斯大学西南医学中心)因发现感知自身及外源DNA的环鸟嘌呤-腺嘌呤核苷酸合成酶[cyclic guanosine monophosphate(GMP)-adenosine monophosphate(AMP)synthase,cGAS],阐明了DNA如何刺激免疫和炎症反应的分子机制荣获基础医学研究奖。 展开更多
关键词 拉斯克奖 环鸟嘌呤-腺嘌呤核苷酸合成 环鸟苷-腺苷 免疫疗法 DNA感受器
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家蚕微孢子虫核糖-5-磷酸异构酶A基因的克隆及表达特征分析
7
作者 尚瑞沙 齐静茹 +3 位作者 陈红丽 张志林 张轶岭 沈中元 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期61-66,共6页
核糖-5-磷酸异构酶A(ribose 5-phosphate isomerase A,RpiA)是多种生物中普遍存在的一种高度保守的蛋白酶,在磷酸戊糖途径(PPP)中起着核心作用,参与原核生物与真核生物核糖-5-磷酸(R5P)与核酮糖-5-磷酸(Ru5P)之间的可逆异构化反应及植... 核糖-5-磷酸异构酶A(ribose 5-phosphate isomerase A,RpiA)是多种生物中普遍存在的一种高度保守的蛋白酶,在磷酸戊糖途径(PPP)中起着核心作用,参与原核生物与真核生物核糖-5-磷酸(R5P)与核酮糖-5-磷酸(Ru5P)之间的可逆异构化反应及植物二氧化碳固定的卡尔文循环。为探索RpiA在家蚕微孢子虫侵染家蚕后能量代谢与物质合成过程中所发挥的作用,通过PCR扩增得到NbRpiA基因的编码区。该开放阅读框全长345 bp,编码114个氨基酸,预测蛋白质的分子质量约为13.145 kD,等电点为7.72,未发现明显已知功能结构域。实时荧光定量PCR检测发现,NbRpiA基因在家蚕微孢子虫感染家蚕后7 d内均有表达:从感染后2 h起,NbRpiA基因的表达水平呈缓慢上升的趋势,第2天达到最高,随后表达水平逐渐降低,从第4天开始表达水平大幅降低,至第7天降至最低。初步推测NbRpiA可能在家蚕微孢子虫孢子发芽及增殖阶段发挥作用。研究结果为了解NbRpiA在家蚕微孢子虫能量代谢与物质合成中的作用提供了初步线索。 展开更多
关键词 家蚕微孢子虫 核糖-5-磷异构酶A 戊糖途径 核苷酸合成 实时荧光定量PCR
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CLOCK氧化还原修饰介导内源性H_(2)O_(2)对小鼠细胞呼吸的调节作用
8
作者 常薇薇 李勋凯 +2 位作者 张祝琴 陈厚早 刘德培 《基础医学与临床》 2023年第5期745-750,共6页
目的探究生物钟核心转录因子昼夜节律运动输出周期蛋白(CLOCK)介导内源性过氧化氢(H_(2)O_(2))对细胞呼吸的调节作用和机制。方法利用Seahorse细胞能量代谢分析仪检测Clock^(C195S)小鼠胚胎成纤维细胞(MEFs)和成体成纤维细胞(MAFs)细胞... 目的探究生物钟核心转录因子昼夜节律运动输出周期蛋白(CLOCK)介导内源性过氧化氢(H_(2)O_(2))对细胞呼吸的调节作用和机制。方法利用Seahorse细胞能量代谢分析仪检测Clock^(C195S)小鼠胚胎成纤维细胞(MEFs)和成体成纤维细胞(MAFs)细胞氧耗能力和糖酵解能力;通过q-PCR检测细胞呼吸关键代谢酶基因表达水平;MEFs进行抗氧化剂Trolox处理后,用Amplex■ Red试剂盒检测内源性H_(2)O_(2)的含量,并通过生物素碘乙酰胺(BIAM)探针标记检测CLOCK蛋白氧化还原修饰的改变,进一步检测处理后的细胞氧耗能力和细胞呼吸关键代谢酶基因表达水平。结果Clock^(C195S)细胞氧耗能力和糖酵解能力下降,烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD)合成关键酶烟酰胺单核苷酸腺苷转移酶(NMNAT2)表达降低(P<0.05),NAD含量下降;Trolox处理导致细胞内源性H_(2)O_(2)含量降低,Clock wt MEFs氧耗能力降低而Clock^(C195S) MEFs变化无统计学意义。结论CLOCK蛋白可以通过195位点半胱氨酸氧化还原修饰介导内源性H_(2)O_(2)对细胞呼吸的调节作用。 展开更多
关键词 细胞呼吸 烟酰胺腺嘌呤二核苷(NAD)合成 CLOCK氧化还原修饰
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多聚(ADP-核糖)聚合酶与细胞损伤 被引量:8
9
作者 朱铁年 赵瑞景 凌亦凌 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期104-107,共4页
Poly(ADP-ribose) polymerase(PARP) is a protein-modifying and nucleotide-polymerizing enzyme. As a critical element in DNA repair, PARP can be activated by DNA strand breaks. Excessive activation of PARP, however, can ... Poly(ADP-ribose) polymerase(PARP) is a protein-modifying and nucleotide-polymerizing enzyme. As a critical element in DNA repair, PARP can be activated by DNA strand breaks. Excessive activation of PARP, however, can deplete NAD + and ATP, leads to cell death. Cleavage of PARP by activated caspase-3 play an important role in cell apoptosis. 展开更多
关键词 细胞凋亡 核苷酸合成酶类 细胞损伤 细胞坏死 炎症
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TS、Ki-67及P53在结直肠癌原发灶及转移淋巴结中的表达及与5-FU化疗敏感性的关系 被引量:7
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作者 任建林 祝明洁 +1 位作者 陈峰 姚晓虹 《中国组织化学与细胞化学杂志》 CAS CSCD 2020年第4期328-332,共5页
目的探讨结直肠癌原发灶及转移淋巴结中胸腺嘧啶核苷酸合成酶(thymidylate synthase,TS)、Ki-67和p53表达差异性,并探究其对预测5-氟尿嘧啶(5-fluorouracil,5-FU)敏感性的价值。方法选取有淋巴结转移的结直肠腺癌患者33例,采用免疫组织... 目的探讨结直肠癌原发灶及转移淋巴结中胸腺嘧啶核苷酸合成酶(thymidylate synthase,TS)、Ki-67和p53表达差异性,并探究其对预测5-氟尿嘧啶(5-fluorouracil,5-FU)敏感性的价值。方法选取有淋巴结转移的结直肠腺癌患者33例,采用免疫组织化学方法检测结直肠癌淋巴结转移灶及原发灶中TS、Ki-67和P53的表达情况。结果TS高表达、p53和Ki-67在转移淋巴结的表达率显著高于原发灶;较好预后的即对5-FU化疗敏感的病例共7例,其中在转移淋巴结及原发癌中TS均为低表达率,p53、Ki-67为阴性表达。结论转移淋巴结中的p53、TS、Ki-67的表达情况同原发灶相比有异质性变化,转移淋巴结TS表达情况可以预测结直肠癌患者对5-FU化疗敏感性,p53的表达情况或许可预测结直肠癌患者对5-FU的化疗敏感性,Ki-67表达与5-FU化疗敏感性的关系仍需要进一步研究。 展开更多
关键词 结直肠癌 淋巴结转移 化疗药敏性 5-氟尿嘧啶 胸腺嘧啶核苷酸合成 KI-67 P53
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沉默GCN5或SOX9基因对Thy-1肾炎大鼠肾组织中TGF-β1生成的影响 被引量:1
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作者 吴志皎 张志伟 +7 位作者 刘龙飞 夏露 谢梦晓 罗灿 邱文 张婧 赵聃 王迎伟 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期360-366,共7页
目的:研究沉默大鼠肾组织中通用控制核苷酸合成5(general control nonderepressible 5,GCN5)基因、性别决定区Y框蛋白9(SRY related HMG box-9,SOX9)基因对Thy-1肾炎(Thy-1 nephritis,Thy-1N)大鼠肾组织内转化生长因子-β1(transforming... 目的:研究沉默大鼠肾组织中通用控制核苷酸合成5(general control nonderepressible 5,GCN5)基因、性别决定区Y框蛋白9(SRY related HMG box-9,SOX9)基因对Thy-1肾炎(Thy-1 nephritis,Thy-1N)大鼠肾组织内转化生长因子-β1(transforming growth factor-β1,TGF-β1)生成的影响。方法:分别用慢病毒(lentivirus,LV)包装GCN5和SOX9发夹状小干扰RNA(shRNA),即制备LV-shGCN5和LV-shSOX9重组病毒。然后行大鼠肾动脉灌注术将LV-shGCN5和LV-shSOX9分别导入大鼠肾脏,再经尾静脉注射兔抗大鼠胸腺细胞抗血清(anti-thymocyte serum,ATS)复制Thy-1N模型。在注射ATS后3 h,取大鼠肾组织,用RTPCR和Western blot检查各组大鼠肾组织中GCN5和SOX9的mRNA及蛋白表达水平,以验证干扰效果及GCN5、SOX9对TGF-β1产生的影响。结果:利用肾动脉灌注术将LV-shGCN5或LV-shSOX9重组病毒导入大鼠肾组织后,不仅能有效沉默相应的靶基因,而且还能下调TGF-β1的表达。结论:沉默大鼠肾组织中GCN5或SOX9基因后能显著抑制Thy-1N大鼠肾内TGF-β1的生成。 展开更多
关键词 Thy-1肾炎(Thy-1N) 通用控制核苷酸合成5(GCN5) 性别决定区Y框蛋白9(SOX9) 转化生长因子-β1(TGF-β1) 基因沉默
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Assembly fabrication of linkers on glass surface and their effect on DNA synthesis and hybridization
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作者 沈佳尧 肖鹏峰 +3 位作者 侯鹏 祭美菊 孙啸 何农跃 《Journal of Southeast University(English Edition)》 EI CAS 2003年第2期149-154,共6页
Linkers were assembled on a glass surface based on the hydrolysis and condensation of 3-glycidoxy ̄propyltrimethoxysilane (GPS). After the assembly of GPS, four approaches were tried to open the ending epoxide group o... Linkers were assembled on a glass surface based on the hydrolysis and condensation of 3-glycidoxy ̄propyltrimethoxysilane (GPS). After the assembly of GPS, four approaches were tried to open the ending epoxide group of GPS or to further elongate the linkers. The effect of these approaches on DNA in situ synthesis and hybridization was investigated. For the spacing of the synthesis initiation sites, the wettability of the support and the length of the linking group that attaches the initiation site to the surface have direct influences on the yield of coupling reactions and the subsequent hybridization events. X-ray photoelectron spectroscopy (XPS) and mean contact angles of deionized water of the above slides were measured to assess the linker's characteristics in each procedure. It was proved that the glass slides were successfully modified and became excellent supports for the oligonucleotides synthesis. In addition, it proved best for the in situ oligonucleotides synthesis that a glass slide was in turn treated with ethylenediamine, glutaradehyde, ethanolamine and sodium borohydride solution at ambient temperature after silanized with GPS. 展开更多
关键词 LINKER assembly fabrication in situ oligonucleotide synthesis HYBRIDIZATION
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晚期非小细胞肺癌肿瘤组织和外周血淋巴细胞中RRM1和ERCC1基因表达的研究 被引量:2
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作者 张国兵 陈建 +4 位作者 王临润 李菌 李敏伟 徐农 申屠建中 《浙江大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期540-546,共7页
目的:探讨晚期非小细胞肺癌(NSCLC)肿瘤组织和外周血淋巴细胞中RRM1、ERCC1基因表达水平及其临床意义。方法:应用实时荧光定量PCR技术检测49例晚期NSCLC肿瘤组织和外周血淋巴细胞中RRM1、ERCC1 mRNA表达水平,对照分析其与患者临床特征... 目的:探讨晚期非小细胞肺癌(NSCLC)肿瘤组织和外周血淋巴细胞中RRM1、ERCC1基因表达水平及其临床意义。方法:应用实时荧光定量PCR技术检测49例晚期NSCLC肿瘤组织和外周血淋巴细胞中RRM1、ERCC1 mRNA表达水平,对照分析其与患者临床特征、吉西他滨/卡铂方案的化疗反应以及预后的关系。结果:肿瘤组织和外周血淋巴细胞中RRM1表达水平呈正相关(rs=0.332,P<0.05),而ERCC1无相关(rs=0.258,P>0.05);肿瘤组织或外周血淋巴细胞中RRM1和ERCC1表达几乎同步(rs=0.634、0.351,P<0.05),但基因表达与患者的性别、年龄、吸烟状态、体力状况PS评分,以及肿瘤临床分期和组织学类型均无显著相关性(P均>0.05)。肿瘤组织中RRM1、ERCC1或外周血RRM1低表达者化疗有效率、中位生存期及1年生存率均高于高表达者,两者比较差异均有统计学意义(P<0.05),特别是肿瘤组织ERCC1低表达者有较高的2年生存率(P<0.05);而外周血ERCC1表达水平与化疗疗效以及预后均无相关性(P均>0.05)。结论:肿瘤组织中RRM1、ERCC1和外周血淋巴细胞中RRM1基因表达水平可能与晚期NSCLC患者吉西他滨/卡铂化疗的疗效以及预后密切相关。 展开更多
关键词 非小细胞肺/病理学 肺肿瘤/病理学 聚合酶链反应 核苷还原酶类/生物合成 DNA结合蛋白质类/生物合成 脱氧胞苷/治疗应用 脱氧胞苷/类似物和衍生物 卡铂/治疗应用 基因表达
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西尼罗河病毒遗传学易感性的确定
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作者 朱音 《国外医学情报》 2003年第5期17-17,共1页
西尼罗河病毒的神秘之处就在于因它所产生的严重症状只在相对较小比例的人群(即被感染人群)中出现,也就是说,仅有20%的患者可出现发热症状。目前,法国一个研究小组提出可利用遗传学特性来确定西尼罗河病毒的易感性。
关键词 西尼罗河病毒 黄热病病毒 遗传易感性 29-59-寡嘌呤核苷酸合成
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HPV感染宫颈病变危险因素及cGAS/STING/TBK1信号通路基因表达水平 被引量:1
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作者 刘洁 罗春艳 +2 位作者 王小兵 郭艳琴 刘丽珍 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期1076-1080,共5页
目的探讨环鸟嘌呤核苷酸腺嘌呤核苷酸合成酶/干扰素激活蛋白/TANK结合激酶1(cGAS/STING/TBK1)信号通路基因在HPV感染宫颈病变患者中的表达及其易感因素。方法回顾性分析2019年3月-2023年3月吉安市中心人民医院收治的151例人乳头瘤病毒(H... 目的探讨环鸟嘌呤核苷酸腺嘌呤核苷酸合成酶/干扰素激活蛋白/TANK结合激酶1(cGAS/STING/TBK1)信号通路基因在HPV感染宫颈病变患者中的表达及其易感因素。方法回顾性分析2019年3月-2023年3月吉安市中心人民医院收治的151例人乳头瘤病毒(HPV)感染宫颈病变患者的临床资料,并作为研究组,151例同期无HPV感染的宫颈病变患者的临床资料作为对照组。比较两组临床资料,采用单因素及多因素分析法分析宫颈病变患者HPV感染的易感因素;采用实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)检测cGAS、STING、TBK1mRNA表达水平;比较研究组和对照组cGAS、STING、TBK1mRNA表达水平;采用受试者工作特征(ROC)曲线分析cGAS、STING、TBK1单独及联合检测对宫颈病变患者HPV感染的诊断价值。结果多因素Logistic回归分析结果显示,年龄大、既往宫颈炎病史、性生活频率高、未使用避孕套、性生活前后无外阴清洗、初次性生活年龄≤20岁、有宫颈癌家族史、初中及以下文化、性伴侣个数≥2个均是宫颈病变患者HPV感染的易感因素(P<0.05);研究组cGAS、STING、TBK1 mRNA表达水平均高于对照组(P<0.05);cGAS、STING、TBK1水平联合检测诊断宫颈病变患者HPV感染的曲线下面积(AUC)为0.902,高于各项单独检测(P<0.05),且联合检测的敏感度和特异度为82.80%和82.10%,诊断价值均较高。结论宫颈病变患者HPV感染后cGAS/STING/TBK1信号通路被激活;联合检测cGAS、STING、TBK1有助于诊断宫颈病变患者HPV感染;宫颈病变患者HPV感染与患者年龄、宫颈炎病史、性生活频率等多种因素有关。 展开更多
关键词 宫颈病变 人乳头瘤病毒 危险因素 环鸟嘌呤核苷腺嘌呤核苷酸合成 干扰素激活蛋白 TANK结合激酶1 诊断价值 受试者工作特征曲线
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Synthesis of Isonucleoside-Incorporated Oligonucleotides and Their Binding Abilities with Complementary Sequences
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作者 史继峰 王占黎 +1 位作者 张亮仁 张礼和 《Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences》 CAS 2004年第1期4-9,共6页
Aim To synthesize isonucleoside-incorporated oligonucleotides and investigatetheir binding abilities with complementary sequences. Methods The synthesis was performed on DNAsynthesizer, and the binding behavior was in... Aim To synthesize isonucleoside-incorporated oligonucleotides and investigatetheir binding abilities with complementary sequences. Methods The synthesis was performed on DNAsynthesizer, and the binding behavior was investigated by thermal denaturation studies. Results Fourkinds of single isonucleoside containing oligonucleotides were synthesized. The results of thermaldenaturation showed that the existence of isonucleoside decreased the stability of duplex, and theeffect was more obvious when the isonucleoside was in the middle of the sequence. No obviousdifference was observed when 6'-OH of isonucleoside was free or was protected by allyl group.Conclusions The existence of isonucleoside in oli-gonucleotide makes chain twist and decreased thestability of duplex. 展开更多
关键词 isonucleoside NUCLEOTIDES HYBRIDIZATION thermal denaturation
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Total Chemical Synthesis, Assembly of Human Torque Teno Virus Genome 被引量:4
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作者 Zheng Hou Gengfu Xiao 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2011年第3期181-189,共9页
Torque teno virus(TTV) is a nonenveloped virus containing a single-stranded,circular DNA genome of approximately 3.8kb.We completely synthesized the 3 808 nucleotides of the TTV(SANBAN isolate) genome,which contains a... Torque teno virus(TTV) is a nonenveloped virus containing a single-stranded,circular DNA genome of approximately 3.8kb.We completely synthesized the 3 808 nucleotides of the TTV(SANBAN isolate) genome,which contains a hairpin structure and a GC-rich region.More than 100 overlapping oligonucleotides were chemically synthesized and assembled by polymerase chain assembly reaction(PCA),and the synthesis was completed with splicing by overlap extension(SOEing).This study establishes the methodological basis of the chemical synthesis of a viral genome for use as a live attenuated vaccine or gene therapy vector. 展开更多
关键词 Torque teno virus(TTV) Synthetic biology Polymerase chain assembly reaction(PCA) Gene splicing by overlap extension(SOEing)
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PNPLA3,the triacylglycerol synthesis/hydrolysis/storage dilemma,and nonalcoholic fatty liver disease 被引量:8
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作者 Silvia Sookoian Carlos J Pirola 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2012年第42期6018-6026,共9页
Genome-wide and candidate gene association studies have identified several variants that predispose indi- viduals to developing nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD). However, the gene that has been consis- tentl... Genome-wide and candidate gene association studies have identified several variants that predispose indi- viduals to developing nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD). However, the gene that has been consis- tently involved in the genetic susceptibility of NAFLD in humans is patatin-like phospholipase domain contain- ing 3 (PNPLA3, also known as adiponutrin). A nonsyn- onymous single nucleotide polymorphism in PNPLA3 (rs738409 C/G, a coding variant that encodes an amino acid substitution I148M) is significantly associated with fatty liver and histological disease severity, not only in adults but also in children. Nevertheless, how PNPLA3 influences the biology of fatty liver disease is still an open question. A recent article describes new aspects about PNPLA3 gene/protein function and suggests that the I148M variant promotes hepatic lipid synthesis due to a gain of function. We revise here the published data about the role of the I148M variant in lipogen- esis/lipolysis, and suggest putative areas of future research. For instance we explored in silico whether the rs738409 C or G alleles have the ability to modify miRNA binding sites and miRNA gene regulation, and we found that prediction of PNPLA3 target miRNAs shows two miRNAs potentially interacting in the 3' UTR region (hsa-miR-769-3p and hsa-miR-516a-3p). In addition, interesting unanswered questions remain to be explored. For example, PNPLA3 lies between two CCCTC-binding factor-bound sites that could be tested for insulator activity, and an intronic histone 3 lysine 4 trimethylation peak predicts an enhancer element, cor- roborated by the DNase I hypersensitivity site peak. Finally, an interaction between PNPLA3 and glycerol- 3-phosphate acyltransferase 2 is suggested by data miming. 展开更多
关键词 Adiponutrin Nonalcoholic fatty liver disease miRNA Glycerol-3-phosphate acyltransferase 2 Sys-tems biology Rs738409 EPIGENETICS
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Chemical synthesis, spectroscopic properties and biochemical evaluation of an adenine nucleotide derivative 2-aminoadenosine 5'-triphosphate
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作者 WU Chun-hui CHEN Chang-bao ZHOU Jie 《Journal of Chemistry and Chemical Engineering》 2009年第4期1-7,17,共8页
An adenine nucleotide derivative 2-aminoadenosine 5'-triphosphate was chemically synthesized through four steps and was characterized with 1H NMR, 31p NMR, 13C NMR, EA and FT-IR. Its ultraviolet and fluorescence prop... An adenine nucleotide derivative 2-aminoadenosine 5'-triphosphate was chemically synthesized through four steps and was characterized with 1H NMR, 31p NMR, 13C NMR, EA and FT-IR. Its ultraviolet and fluorescence properties at various pH values were studied. Two pKa values for the compound were determined by the curves of UV absorption dependency on pH, Which were 0.68 and 4.83, respectively. The values were consistent with those calculated from ACD/Labs software. In addition, hydrolysis of the adenine nucleotide derivative in the catalysis of potato apyrase was studied. The competition of the ATP analogue with ATP for potato apyrase' active site was proved to be a sequential reaction mechanism. 展开更多
关键词 2-aminoadenosine 5'-triphosphate chemical synthesis spectroscopic property biochemical evaluation
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高危型HPV感染宫颈病变患者外周血cGAS/ STING/TBK1信号通路基因表达
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作者 王媛媛 王亚莉 +3 位作者 黄颖 汪晶 王燕 宋成文 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期110-114,共5页
目的 探究高危型人乳头瘤病毒(HPV)感染宫颈病变患者外周血环鸟嘌呤核苷酸腺嘌呤核苷酸合成酶/干扰素激活蛋白/TANK结合激酶1(cGAS/STING/TBK1)信号通路基因相对表达量。方法 选取2015年4月-2021年4月中部战区总医院妇产科收治的高危型... 目的 探究高危型人乳头瘤病毒(HPV)感染宫颈病变患者外周血环鸟嘌呤核苷酸腺嘌呤核苷酸合成酶/干扰素激活蛋白/TANK结合激酶1(cGAS/STING/TBK1)信号通路基因相对表达量。方法 选取2015年4月-2021年4月中部战区总医院妇产科收治的高危型HPV感染宫颈病变患者89例为研究组,同期无HPV感染的宫颈病变患者89例为对照组,采用第2代杂交捕获实验检测高危型HPV DNA载量,荧光定量聚合酶链反应(PCR)检测外周血cGAS、STING和TBK1 mRNA表达水平。结果 研究组外周血单个核细胞中cGAS、STING和TBK1 mRNA水平高于对照组(P<0.05);不同高危型HPV DNA载量患者外周血cGAS/STING/TBK1信号通路基因表达的比较差异有统计学意义(P<0.05),其中高载量组cGAS、STING和TBK1 mRNA水平最高,低载量组最低(P<0.05);不同高危型HPV感染类型患者外周血cGAS/STING/TBK1信号通路基因表达的比较差异无统计学意义。结论 高危型HPV感染对宫颈病变患者外周血cGAS/STING/TBK1信号通路基因表达影响较大,高危型HPV DNA载量与其表达水平密切相关。 展开更多
关键词 人乳头瘤病毒 高危型 病毒载量 宫颈病变 环鸟嘌呤核苷腺嘌呤核苷酸合成 干扰素激活蛋白 TANK结合激酶1
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