基于密度泛函理论的核酸断裂位点分析

基于密度泛函理论,采用Gaussian 09软件分析计算核酸的断裂位点,得到如下结论:1)核酸断裂位点仅由单核苷对A-T或碱基A和T构成,其断裂概率与核酸断裂位点长度成正比,且位点中心的断裂概率大于位点两端;2)核酸相对稳定位点仅由单核苷对C-G或碱基C和G构成,其相对稳定性与核酸相对稳定位点长度成正比;3)对于相同长度的核酸断裂位点,其断裂概率随碱基排列分布规律性增强而变大,反之亦然;4)对于相同长度的核酸相对稳定位点,其相对稳定性随碱基排列分布规律性增强而变大,反之亦然。在PCR扩增区间的选择、引物序列的设计、cfDNA等降解规律的研究等方面具有一定的应用价值。