雏鹅新型病毒性肠炎病毒的提纯和核酸链型及结构蛋白分析

本文报道雏鹅新型病毒性肠炎病毒 (NGVEV)的提纯方法、核酸类型及结构蛋白分析的研究结果。采用氯仿处理 -饱和硫酸铵沉淀 -透析清除NH+ 4 、SO2 -4-柱层析分离的技术程序可获得纯净的NGVEV病毒粒子。于电镜下可观察到NGVEV具有典型的腺病毒特征。经吖啶橙染色和S1核酸酶消化鉴定NEVEV的核酸类型为双链DNA。经SDS -PAGE分析 ,病毒结构蛋白由 15种多肽组成 ,即VP1(116KD)、VP2 (10 4KD)、VP3 (88KD)、VP4(6 8KD)、VP5(6 0 7KD)、VP6(5 4KD)、VP7(40 1KD)、VP8(36KD)、VP9(34 5KD)、VP10 (2 4 2KD)、VP11(2 2KD)、VP12 (2 0KD)、VP13 (18KD)、VP14 (14 2KD)和VP15(13 4KD)。其中VP4、VP7、VP8、VP9、VP14 为主要结构多肽 ,占蛋白总量的 90 2 6 2 2 %。

类猪圆环病毒因子P1核酸链型和极性的研究

研究报道类猪圆环病毒因子P1的核酸链型和极性的研究结果。采用氯化铯平衡密度梯度离心获得较为纯净的病毒粒子后,提取病毒DNA,经S1核酸酶消化、特异性单引物第一轮PCR扩增结合常规第二轮PCR扩增等研究,结果表明,类猪圆环病毒因子P1为单股、负链基因组。

术前血清V-set和免疫球蛋白结构域4以及长链非编码核糖核酸SBF2反义RNA1与肾结石患者经皮肾镜取石术后急性肾损伤的关系

目的探讨术前血清V-set和免疫球蛋白结构域4(VSIG4)以及长链非编码核糖核酸(LncRNA)SBF2反义RNA1(SBF2-AS1)与肾结石患者经皮肾镜取石术后急性肾损伤(AKI)的关系。方法选择2020年1月—2022年12月本院收治的109例肾结石患者为研究对象。术前检测患者血清VSIG4水平以及LncRNA SBF2-AS1表达,术后记录AKI发生情况。采用多因素Logistic回归模型分析肾结石患者经皮肾镜取石术后发生AKI的影响因素;采用受试者工作特征(ROC)曲线分析VSIG4、LncRNA SBF2-AS1预测肾结石患者经皮肾镜取石术后发生AKI的价值。结果本研究中,术后发生AKI者16例。AKI组血清VSIG4水平低于非AKI组,LncRNA SBF2-AS1表达高于非AKI组,差异均有统计学意义(P<0.05)。多因素Logistic回归分析显示,术前高尿酸水平、术前高LncRNA SBF2-AS1表达、较长的手术时间、术中低血压是肾结石患者经皮肾镜取石术后发生AKI的危险因素(P<0.05),术前高VSIG4水平是保护因素(P<0.05)。术前血清VSIG4、LncRNA SBF2-AS1水平预测肾结石患者经皮肾镜术后发生AKI的曲线下面积分别为0.854、0.705,二者联合预测的曲线下面积为0.948,大于各指标单独预测(Z=1.995、2.958,P<0.05)。结论肾结石患者术前血清VSIG4水平降低、LncRNA SBF2-AS1表达增高与经皮肾镜取石术后AKI的发生有关,联合检测术前VSIG4、LncRNA SBF2-AS1可预测术后AKI的发生风险。

三链核酸稳定性和生物学功能的研究进展

近１０年来三链核酸的研究发展迅猛，已经成为分子生物学和基因工程的一个前沿领域．综述了最近在三链核酸稳定性和生物学功能方面的研究进展．较为详细地讨论了影响三链稳定性的各种内源和外源因素如：寡聚脱氧核苷酸（ＯＤＮ）的长短、序列、碱基修饰、骨架结构以及温度、酸度、离子强度、配基等，同时对三链核酸的生物学功能进行了初步的总结，这些功能包括：控制基因转录，保护靶序列防止酶切，充当分子剪刀进行特定位点切割等．

基于三链核酸的DNA计算

一种研究DNA计算的新模型——三链DNA计算模型在本文中提出。此模型是在近年三链核酸的研究成果的基础上建立的。并应用于求解可满足性问题(SAT),这是一个困难的NP-完全问题。不同于以往的DNA计算方法,基于三链核酸的分子算法通过寡聚脱氧核苷酸(ODN)在RecA蛋白的介导下与同源的双链DNA匹配成三链DNA进行基本的运算,这样可以有效减少计算中的错误。依据分子生物学的实验方法,该算法切实可行并且有效。

长链非编码核糖核酸在心脏发育及心血管疾病中的作用研究进展

长链非编码核糖核酸(long noncoding RNA,lncRNA)是一类长度大于200个核苷酸的非编码RNA。研究表明lncRNA能以RNA的形式在多种层面上(表观遗传、转录及转录后水平)调控基因的表达,参与了细胞凋亡、增殖,发育等重要生物学过程。近年来,lncRNA在心血管疾病中的作用获得关注。现将lncRNA在心脏发育及心血管疾病中的作用作一综述。

急性心肌梗死患者外周血长链非编码核糖核酸NEAT1表达水平与病情及预后的相关性分析

目的:研究急性心肌梗死(AMI)患者外周血长链非编码核糖核酸(lncRNA) NEAT1表达水平与病情及预后的相关。方法:选择2017年6月至2018年6月期间,在我院接受经皮冠状动脉介入术(PCI)的104例AMI患者,同期在我院体检且一般资料与AMI患者匹配的70例志愿者作为对照组,检测外周血lncRNA NEAT1的表达水平,收集AMI患者的临床资料、随访AMI患者PCI后主要不良心血管事件(MACE),分析不同lncRNA NEAT表达水平AMI患者临床特征及MACE累积发生率的差异。结果:AMI组患者外周血中lncRNA NEAT1的表达水平明显高于对照组(P<0.05);AMI组中lncRNA NEAT1表达水平≥中位数患者的CK-MB峰值、肌钙蛋白T(c Tn T)峰值、Gensini评分、SYNTAX II评分、左心室舒张末期容积(LVEDV)、MACE累积发生率均高于lncRNA NEAT1表达水平<中位数患者,LVEF、E/A均低于lncRNA NEAT1表达水平<中位数患者(P<0.05);AMI组中lncRNA NEAT1表达水平≥中位数和<中位数患者的性别比、年龄、BMI、合并高血压、合并糖尿病、合并高脂血症和血运重建等,差异无统计学意义(P>0.05)。外周血lncRNA NEAT1表达水平对AMI患者PCI后发生MACE具有预测价值。结论:AMI患者外周血lncRNA NEAT1表达上调与病情加重、预后恶化有关。

银染法用于EMSA分析检测三链核酸形成

目的 探讨银染法在三链形成的电泳迁移率改变分析 (EMSA)中的可行性 ,从而为三链核酸研究提供有效的非同位素检测方法。 方法 三链形成反应后进行 EMSA分析 ,然后用银染显示电泳形成的 DNA区带。 结果 银染法显示出三链的 EMSA滞后带 ,并揭示三链形成的平台效应。 结论 本文首次表明银染法可用于三链形成的 EMSA分析快速检测 ,且 SOX9基因内含子

三链核酸poly(U)·poly(A)·poly(U)主链的振动位移

基于三链核酸 poly(U)· poly(A)·poly(U)的螺旋对称性 ,利用晶格动力学方法 ,计算了三链核酸分子 poly(U)·poly(A)·poly(U)主链振动的本征矢 ,探讨了振动位移矢量和线二色光谱的关系。结果表明 ,对应着磷酸双氧的反对称振动谱线可以用于直接确定磷酸根的取向 ,精度大约为 1°。其他谱线必须通过对分子的简正分析来帮助确定分子的结构。

长链非编码核糖核酸GAS8-AS1在甲状腺乳头状癌组织中的表达

目的比较长链非编码核糖核酸(lncRNA)GAS8-AS1在甲状腺乳头状癌患者术前和术后的表达水平,探讨lncRNA GAS8-AS1作为生物标志物用于甲状腺乳头状癌临床诊断的可行性。方法入组81例甲状腺乳头状癌患者作为试验组,66例结节性甲状腺肿患者作为对照组;采集术前和术后1 a的血液样本并收集术中的肿瘤组织,运用荧光定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)检测血液、肿瘤组织中lncRNA GAS8-AS1表达水平,比较术前和术后1 a血液、肿瘤组织中lncRNA GAS8-AS1表达的差异。结果术前,试验组患者血液中lncRNA GAS8-AS1相对表达量较对照组明显减少(P<0.05)。术前,试验组患者肿瘤组织中lncRNA GAS8-AS1相对表达量与其血液中的相对表达量相近(P>0.05),且较对照组血液中的相对表达量明显降低(P<0.05)。术后1 a,试验组患者血液中lncRNA GAS8-AS1的相对表达量较术前明显升高(P<0.05),且与对照组血液中的相对表达量相近(P>0.05)。结论lncRNA GAS8-AS1可以作为生物标志物在甲状腺乳头状癌的临床诊断和术后监测过程中起到关键作用。

长链非编码核糖核酸与冠心病的研究进展——从发病机制到诊断与治疗

心血管疾病患病率高,死亡率亦居高不下,是目前世界范围内重大的公共卫生问题之一,其中冠心病心肌梗死仍是导致死亡的主要原因之一。随着微阵列及高通量测序技术的飞速发展,长链非编码核糖核酸(lncRNA)在心血管疾病发生发展中的作用被逐渐揭示。lncRNA通过表观遗传等作用形式在转录及转录后水平对基因表达进行调控。已有大量研究表明,lncRNA在动脉粥样硬化、急性心肌梗死等疾病中发挥重要调节作用。本文将对lncRNA的生物学作用模式,及其在冠心病发病、诊断及治疗等领域的研究进展做一综述。

长链非编码核糖核酸与心血管疾病

长链非编码核糖核酸(lnc RNA)是一类长度大于200 nt的非编码核糖核酸(RNA),它参与多种细胞生命活动和疾病的进展。由于科学技术的飞速发展,高通量测序以及微阵列技术的成熟,lnc RNA在心血管领域的研究中具有极大潜力。目前,lnc RNA在心肌梗死、心肌缺血再灌注损伤、心力衰竭、高血压等疾病中均有涉及和研究报道。lnc RNA也是一类重要的生物标志物,对于心血管疾病的诊断、治疗及远期预后的评估发挥重要作用。lnc RNA的出现,为心血管疾病的诊疗带来希望。关于lnc RNA参与心血管疾病的深入机制,还有待进一步研究。

长链非编码RNA DLEU2通过miR-30a-5p/CD61对人结肠癌SW1116细胞生长和增殖的影响

目的探讨长链非编码核糖核酸淋巴细胞白血病缺失基因2(LncRNA DLEU2)通过靶向微小核糖核酸(miR)-30a-5p/整合素β3(CD61)对人结肠癌SW1116细胞生长和增殖的影响。方法取人结肠癌细胞株SW1116培养并随机分为si-NC组、si-LncRNA DLEU2组、模拟物阴性对照(miR-NC)组、miR-30a-5p mimics组、miR-30a-5p抑制剂阴性对照(NC inhibitor)+si-LncRNA DLEU2组及miR-30a-5p inhibitor+si-LncRNA DLEU2组,同时设置未转染细胞为空白组;转染48 h后,采用荧光显微镜检测细胞转染效率,四甲基噻唑蓝(MTT)法检测细胞增殖活性,实时定量聚合酶链反应(RT-qPCR)和蛋白质免疫印迹法(Western blot)分别检测细胞LncRNA DLEU2和miR-30a-5p表达、CD61、细胞周期蛋白D1(CyclinD1)、c-Myc mRNA和蛋白表达,双荧光素酶报告基因实验和RT-qPCR检测LncRNA DLEU2与miR-30a-5p的靶向关系、miR-30a-5p与CD61的靶向关系;制作雄性胸腺BALB/c裸鼠异种移植瘤模型评估LncRNA DLEU2对肿瘤生长的影响。结果si-NC组、si-LncRNA DLEU2组、miR-NC组、miR-30a-5p mimics组、NC inhibitor+si-LncRNA DLEU2组、miR-30a-5p inhibitor+si-LncRNA DLEU2组转染效率均>85%;与空白组及si-NC组比较,si-LncRNA DLEU2组、NC inhibitor+si-LncRNA DLEU2组增殖抑制率上升(P<0.05),DLEU2表达下降(P<0.05),miR-30a-5p表达增加(P<0.05),CD61、CyclinD1、c-Myc mRNA和蛋白表达减少(P<0.05);与NC inhibitor+si-LncRNA DLEU2组比较,miR-30a-5p inhibitor+si-LncRNA DLEU2组细胞增殖抑制率下降(P<0.05),miR-30a-5p表达下降,CD61、CyclinD1、c-Myc mRNA和蛋白表达上升(P<0.05);与miR-NC组比较,miR-30a-5p mimics组miR-30a-5p表达、增殖抑制率增加(P<0.05),CD61、CyclinD1、c-Myc mRNA和蛋白表达下降(P<0.05);LncRNA DLEU2可直接靶向调控miR-30a-5p、miR-30a-5p可直接靶向调控CD61,抑制LncRNA DLEU2表达可降低BALB/c裸鼠移植瘤生长(P<0.05)。结论沉默LncRNA DLEU2可抑制人结肠癌细胞株SW1116生长和增殖,其机制可能与靶向miR-30a-5p抑制CD61表达,抑制CyclinD1、c-Myc表达相关。

三链核酸在食品安全检测中的研究进展

文章综述了三链核酸的结构与稳定性,重点介绍了基于三链核酸的荧光、电化学、比色分析法在食源性有害物检测中的研究进展,并探讨了三链核酸在食品安全检测领域中面临的挑战和发展前景。

基于N6-甲基腺苷相关长链非编码核糖核酸表达的喉鳞状细胞癌预后分析

目的 探索N6-甲基腺苷(m6A)相关长链非编码核糖核酸(lncRNA)与喉鳞状细胞癌(LSCC)的预后关系及其临床意义。方法 获取癌症基因组图谱(TCGA)数据库LSCC的转录组数据和临床数据,共表达分析筛选m6A基因相关的lncRNA,单变量Cox分析m6A相关lncRNA与LSCC预后关系、套索回归及交叉验证法迭代分析构建LSCC预后模型。采用实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)验证构建预后模型的lncRNA在LSCC中的转录水平。通过预后模型计算风险评分,将LSCC区分为高、低风险患者,高、低风险患者之间进行基因集富集分析(GSEA)。风险评分与浸润LSCC的免疫细胞进行免疫相关性分析。结果 m6A相关基因与lncRNA的共表达分析筛选出169个与m6A基因相关的lncRNA(相关系数>0.4,P<0.001),通过单变量Cox分析确定了LSCC预后相关lncRNA:ALOX12-AS1(P<0.05)、LINC00528(P<0.05)、STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB(P<0.05)、MNX1-AS1(P<0.01)和LINC02043(P<0.05)。套索回归、交叉验证迭代分析结果:变量为4时模型的均方根误差最小,即5个预后相关lncRNA仅有ALOX12-AS1、LINC00528、STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB与MNX1-AS1可作为模型变量。预后模型:风险评分=(0.176723096228585×MNX1-AS1表达量)+(-0.614916717648596×ALOX12-AS1表达量)+(-0.814201385798827×LINC00528表达量)+(-0.436537752110547×STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB表达量)。qPCR结果ALOX12-AS1(P<0.0001)、LINC00528(P<0.01)、STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB(P<0.0001)、MNX1-AS1(P<0.0001)较于癌旁组织,在LSCC组织表达水平上调。GSEA分析结果:高风险患者在细胞-基质粘附(KEGG_FOCAL_ADHESION)(P<0.05)与细胞外基质受体相互作用(KEGG_ECM_RECEPTOR_INTERACTION)(P<0.05)的通路下调,低风险患者在碱基切除修复(KEGG_SPLICEOSOME)(P<0.05)、剪接体(KEGG_SPLICEOSOME)(P<0.05)通路上调。风险评分与免疫浸润细胞相关性分析,风险评分与效应B细胞(R=-0.24,P=0.017)、细胞毒性T细胞(R=-0.26,P=0.0091)和T滤泡辅助细胞(R=-0.22,P=0.028)呈负相关。结论 基于m6A相关LncRNA表达量构建的LSCC预后模型可作为预测LSCC患者预后的有效工具。

长链非编码核糖核酸在神经系统疾病中的研究进展

长链非编码核糖核酸(lncRNA)是一类长度超过200个核苷酸的非编码核糖核酸。多项研究结果表明,lncRNA在神经系统发育、神经元分化、突触可塑性等生物过程中发挥重要作用,参与多种神经系统疾病的发生、发展过程。本文就lncRNA在神经系统疾病中的研究进展进行综述。

长链非编码核糖核酸H19通过抑制自噬促进人主动脉平滑肌细胞表型转化

目的:探讨长链非编码核糖核酸H19(IncRNA)对人主动脉平滑肌细胞(HA-VSMCs)自噬及表型转化的调控作用。方法:药物诱导HA-VSMCs发生表型转化,检测细胞内成骨相关蛋白RUNX2及平滑肌标志物α-SMA的表达水平,通过茜素红s染色及碱性磷酸酶ALP含量测定实验检测钙化水平,通过检测泛素化连接蛋白LC-3、P62观察自噬水平变化。结果:与正常组相比,钙化诱导HA-VSMCs组lncRNA H19表达量明显升高,成骨相关蛋白RUNX2表达水平增加,平滑肌标志物α-SMA表达下调,自噬被抑制。敲低lncRNA H19后,平滑肌细胞表型转化减缓,钙化程度减弱,自噬水平有所回升。结论:lncRNA H19可促进HA-VSMCs的表型转化及动脉钙化的发生,其机制可能与抑制HA-VSMCs的保护性自噬有关。

长链非编码核糖核酸及其介导的竞争内源性核糖核酸与卒中发病机制研究进展

长链非编码核糖核酸(long noncoding RNA,lncRNA)是长度大于200碱基的非编码RNA,为竞争内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)的关键组成分子,具有重要的生物学功能。近期研究表明,lncRNA及其介导的ceRNA与卒中的发病、炎症反应及血管生成密切相关,为卒中的诊治提供了新的方向。本文对lncRNA及其介导的ceRNA与卒中关系的研究进展进行综述。

三链核酸分子探针的稳定性及其生物传感应用

由于独特的可设计性和分子识别能力,核酸分子探针已被广泛应用于生物传感领域。DNA三链结构是继Watson和Crick等发现DNA双螺旋结构后发现的一种特殊结构。它是由第三条寡聚核酸链与DNA双螺旋结构通过Hoogsteen氢键杂交形成的三股螺旋DNA结构。由于第三条核酸链的引入,三链核酸分子探针在信号输出,信号放大和信号编码方面具有操控性,拓展了核酸分子探针在生物传感中的功能应用。该文讨论了影响三链核酸稳定性的主要因素,综述了三链核酸分子探针在生物传感领域的功能应用。

先天性心脏病非编码核糖核酸研究进展

先天性心脏病(congenital heart disease,CHD)由于先天性的心脏和大血管发育异常出现的解剖畸形,是新生儿最常见的先天性畸形之一,在中国,每1 000名新生儿就有9例患病[1]。随着外科手术技术的提高,大大改善的危重症CHD患者的预后;但是,CHD患者成年后不良健康事件,如癌症,心力衰竭,心律失常较于正常人明显增加[2]。CHD已成为影响儿童身心健康及人口生命质量的重大公共卫生问题,给社会和家庭造成严重的经济和精神方面的负担[3]。目前研究结果显示,先天性心脏病发病机制复杂、影响因素众多。