lBM Pc机上的核酸顺序数据库及其检索方法

我们在微型电脑IBM PC机上开发了一个核酸顺序数据库及其管理和分析系统。该库数据丰富且能更新,管理和分析软件系统功能强,结构设计合理、灵活,检索和管理比较方便。本文介绍了该库的作用及其各种检索方法。分析程序系统NASA(Nucleic Acid Sequence Analysis)将另文发表。

核酸顺序的计算机辅助分析系统

本文介绍了一个在微机(IBM PC)上实现的、用于核酸顺序分析的计算机程序系统.该系统由三个层次和18个功能块构成,菜单及人机对话使得用户能较快地掌握和使用它.在编程中,采用了树结构、先进后出栈和稀疏矩阵等数据结构技巧,运用了Bayes法等统计分析方法,Kruskal算法和Floyd算法等一系列图论方法也被得到应用,这个软件系统的推出对于分子生物学研究具有一定的积极作用.

乙型肝炎的遗传学研究进展

业已表明,在乙型肝炎(HB)的发生、发展中可有许多遗传学变化,因此,从遗传学角度研究HB,为探讨HB的发病机制、传播、预防和治疗提供了一条新的研究途径。本文对HB的遗传学进展加以综述。

新肝炎病毒TTV在各类高危人群中分子流行病学研究

为观察新肝炎病毒TTV在各类高危人群中的感染状况和基因分型 ,在日本株TTVORF1保守区合成了特异性引物 ,采用巢式聚合酶链反应 (nPCR)两次扩增血清TTVDNA ,对各类人群中TTVDNA分别进行了分子克隆和部分基因测序 ,并与日本报道的TTVDNA基因序列比较。结果显示 :从非甲 戊型和非庚型肝炎病人、血清HBsAg阳性的肝炎病人、正常献血员、静脉内吸毒者和女性性乱者中 ,分别获得的 6份TTVDNA克隆 ,其基因序列与日本株TTVORF1部分基因核苷酸序列同源性为 97%～ 99% ,均属于TTVla型。提示 :我国各类高危人群感染TTV以la型为主 ;TTV基因型与疾病发生和传播方式关系不大。

胃肠癌中FHIT基因的异常表达

目的 :探讨FHIT基因与胃肠肿瘤的关系。方法 :采用RT PCR及PCR产物直接测序法 ,检测了 2 6例胃癌组织和 30例大肠癌组织及其配对正常组织的FHIT基因。结果 :7例 (2 6 9% )胃癌组织和 8例 (2 6 7% )大肠癌组织存在异常FHIT转录本 ,而配对正常组织均无异常FHIT转录本 ;测序证实异常转录本缺失 1～ 3个FHIT外显子。结论 :异常FHIT转录本的表达是胃肠肿瘤发生中常见的和特有的改变 ;FHIT基因异常与胃肠肿瘤的发生和发展有关。