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29种桃金娘目物种psbA基因密码子偏好及聚类分析
1
作者
林琳
王杰
+2 位作者
尚林雪
洪思丹
顾翠花
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2024年第11期3514-3524,共11页
为探究桃金娘目(Myrtales)物种psbA基因密码子使用偏好性,本研究从NCBI数据库获取29个桃金娘目物种的psb A基因的编码区序列,运用CodonW、EMBOSS和DAMBE软件获得基因碱基组成和密码子使用偏性的相关参数。29种桃金娘目物种psbA基因的EN...
为探究桃金娘目(Myrtales)物种psbA基因密码子使用偏好性,本研究从NCBI数据库获取29个桃金娘目物种的psb A基因的编码区序列,运用CodonW、EMBOSS和DAMBE软件获得基因碱基组成和密码子使用偏性的相关参数。29种桃金娘目物种psbA基因的ENC范围在39.532~43.104,CAI均值是0.310,GC含量均小于50%。psbA基因密码子中有25个偏好性较强的密码子;ENC-plot、中性绘图分析、奇偶偏差分析显示,密码子偏好主要受自然选择的影响。基于RSCU值和CDS序列的聚类中,桃金娘科的11个物种存在差异。桃金娘目物种psbA基因编码区在选择碱基时倾向于AT,对A/T结尾的密码子使用偏好更强。密码子整体偏好性不强,基因表达量不高。自然选择是影响桃金娘目物种psbA基因密码子偏好性的主要因素。烟草是进行基因功能验证的较合适受体,大肠杆菌适宜作异源表达载体。
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关键词
桃金娘目
密码子偏好性
聚类分析
受体
原文传递
塞罕坝地区柳兰繁殖栽培技术
被引量:
4
2
作者
纪福利
《现代园艺》
2015年第9期78-78,共1页
1植物学特性和生长习性1.1植物学特性柳兰(Epilobium angustifolium Linn.)是桃金娘目柳叶菜科多年生草本植物,在河北围场塞罕坝地区分布较为广泛。高约1~1.3m。茎直立,通常不分枝。叶互生,披针形,近全缘。总状花序顶生、穗状,伸长,...
1植物学特性和生长习性1.1植物学特性柳兰(Epilobium angustifolium Linn.)是桃金娘目柳叶菜科多年生草本植物,在河北围场塞罕坝地区分布较为广泛。高约1~1.3m。茎直立,通常不分枝。叶互生,披针形,近全缘。总状花序顶生、穗状,伸长,花序轴被短柔毛,苞片线形,长1~2cm,花大,两性,红紫色。花期6~8月。花穗长,色鲜艳,是理想的夏季花卉、花境背景材料。根状茎或全草入药,有微毒,能调经活血、消肿止痛,主治月经不调、骨折、关节扭伤等。
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关键词
柳兰
塞罕坝
植物学特性
背景材料
桃金娘目
柳叶菜科
花序轴
调经活血
生长习性
关节扭伤
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职称材料
题名
29种桃金娘目物种psbA基因密码子偏好及聚类分析
1
作者
林琳
王杰
尚林雪
洪思丹
顾翠花
机构
浙江农林大学风景园林与建筑学院
出处
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2024年第11期3514-3524,共11页
基金
浙江省农业新品种选育专项(2021C02071-4)
浙江省自然科学基金项目(LY21C160001)
浙江省大学生科技活动计划暨新苗人才计划项目(2021R412051)共同资助。
文摘
为探究桃金娘目(Myrtales)物种psbA基因密码子使用偏好性,本研究从NCBI数据库获取29个桃金娘目物种的psb A基因的编码区序列,运用CodonW、EMBOSS和DAMBE软件获得基因碱基组成和密码子使用偏性的相关参数。29种桃金娘目物种psbA基因的ENC范围在39.532~43.104,CAI均值是0.310,GC含量均小于50%。psbA基因密码子中有25个偏好性较强的密码子;ENC-plot、中性绘图分析、奇偶偏差分析显示,密码子偏好主要受自然选择的影响。基于RSCU值和CDS序列的聚类中,桃金娘科的11个物种存在差异。桃金娘目物种psbA基因编码区在选择碱基时倾向于AT,对A/T结尾的密码子使用偏好更强。密码子整体偏好性不强,基因表达量不高。自然选择是影响桃金娘目物种psbA基因密码子偏好性的主要因素。烟草是进行基因功能验证的较合适受体,大肠杆菌适宜作异源表达载体。
关键词
桃金娘目
密码子偏好性
聚类分析
受体
Keywords
Myrtales
Codon usage bias
Clustering analysis
Receptor
分类号
TP3 [自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
原文传递
题名
塞罕坝地区柳兰繁殖栽培技术
被引量:
4
2
作者
纪福利
机构
河北省塞罕坝机械林场
出处
《现代园艺》
2015年第9期78-78,共1页
文摘
1植物学特性和生长习性1.1植物学特性柳兰(Epilobium angustifolium Linn.)是桃金娘目柳叶菜科多年生草本植物,在河北围场塞罕坝地区分布较为广泛。高约1~1.3m。茎直立,通常不分枝。叶互生,披针形,近全缘。总状花序顶生、穗状,伸长,花序轴被短柔毛,苞片线形,长1~2cm,花大,两性,红紫色。花期6~8月。花穗长,色鲜艳,是理想的夏季花卉、花境背景材料。根状茎或全草入药,有微毒,能调经活血、消肿止痛,主治月经不调、骨折、关节扭伤等。
关键词
柳兰
塞罕坝
植物学特性
背景材料
桃金娘目
柳叶菜科
花序轴
调经活血
生长习性
关节扭伤
分类号
S567.239 [农业科学—中草药栽培]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
29种桃金娘目物种psbA基因密码子偏好及聚类分析
林琳
王杰
尚林雪
洪思丹
顾翠花
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2024
0
原文传递
2
塞罕坝地区柳兰繁殖栽培技术
纪福利
《现代园艺》
2015
4
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