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网络药理学联合GEO数据挖掘与分子对接探究桔梗-鱼腥草治疗非小细胞肺癌的作用机制 被引量:2
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作者 李永顺 谢嘉嘉 +3 位作者 周继红 张立 陈树超 欧阳子琛 《新中医》 CAS 2023年第15期138-145,共8页
目的:通过网络药理学联合GEO数据挖掘以及分子对接技术探究桔梗-鱼腥草药对治疗非小细胞肺癌(NSCLC)的作用机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库搜集桔梗-鱼腥草活性成分及其作用靶点,在Gencards、OMIM和GEO数据... 目的:通过网络药理学联合GEO数据挖掘以及分子对接技术探究桔梗-鱼腥草药对治疗非小细胞肺癌(NSCLC)的作用机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库搜集桔梗-鱼腥草活性成分及其作用靶点,在Gencards、OMIM和GEO数据库获取疾病相关靶点,将二者靶点取交集获取桔梗-鱼腥草与NSCLC的共同靶点,并使用Cytoscape3.9.0软件进行药物-活性成分-靶点互作网络构建获取核心成分。通过String网站对药物-疾病共同靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用分析得到核心靶点。使用Metascape平台对共同靶点进行GO及KEGG富集分析。最后运用AutoDock和PyMol软件对核心成分和核心靶点进行分子对接和可视化处理。结果:共获得药物活性成分7个,药物-疾病共同靶点139个。其中核心活性成分3个:槲皮素、木犀草素、山奈酚;核心靶点5个:TP53、AKT1、JUN、TNF、EGFR。GO分析得到2281个相关条目。KEGG分析得到326条信号通路。分子对接显示槲皮素、木犀草素、山奈酚与TP53、AKT1、JUN、TNF、EGFR之间均具有较强亲和力。结论:桔梗-鱼腥草药对可能通过TP53、AKT1、JUN、TNF、EGFR等靶点和癌症通路、PI3K-AKT信号通路等途径发挥抗NSCLC的作用。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 桔梗-鱼腥草 网络药理学 GEO数据挖掘 分子对接
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