目的应用DNA条形码技术对采集的天山棱子芹样本基原进行分子鉴定。方法提取样品总DNA并以ITS2扩增序列为主,psbA-trnH扩增序列为参考,对天山棱子芹样本DNA进行扩增,通过琼脂糖凝胶电泳检测总DNA及引物扩增结果,并进行测序。将两引物扩...目的应用DNA条形码技术对采集的天山棱子芹样本基原进行分子鉴定。方法提取样品总DNA并以ITS2扩增序列为主,psbA-trnH扩增序列为参考,对天山棱子芹样本DNA进行扩增,通过琼脂糖凝胶电泳检测总DNA及引物扩增结果,并进行测序。将两引物扩增成功并测序后的序列导入美国国立生物技术信息中心(national center of biotechnology information,NCBI)数据库比对,并对样本ITS2序列及其同科属植物序列进行NJ树聚类分析,再结合形态学特征推断天山棱子芹样本的基原。结果总DNA提取成功,ITS2引物及psbA-trnH引物均扩增成功。NCBI数据库比对结果显示,样本ITS2序列与伞形科棱子芹属天山棱子芹(Hymenidium nanum)的相似度(98.2%)高于ps⁃bA-trnH序列与瘤果芹属裂苞瘤果芹(Trachydium involucellatum)的相似度(93.92%);NJ树聚类分析结果显示,样本与天山棱子芹聚为一支,支持率为92%;形态学特征比对结果表明,样本与天山棱子芹形态特征吻合。结论综合传统的形态学与现代DNA条形码鉴定结果,最终确定样本的基原为天山棱子芹。展开更多
文摘目的应用DNA条形码技术对采集的天山棱子芹样本基原进行分子鉴定。方法提取样品总DNA并以ITS2扩增序列为主,psbA-trnH扩增序列为参考,对天山棱子芹样本DNA进行扩增,通过琼脂糖凝胶电泳检测总DNA及引物扩增结果,并进行测序。将两引物扩增成功并测序后的序列导入美国国立生物技术信息中心(national center of biotechnology information,NCBI)数据库比对,并对样本ITS2序列及其同科属植物序列进行NJ树聚类分析,再结合形态学特征推断天山棱子芹样本的基原。结果总DNA提取成功,ITS2引物及psbA-trnH引物均扩增成功。NCBI数据库比对结果显示,样本ITS2序列与伞形科棱子芹属天山棱子芹(Hymenidium nanum)的相似度(98.2%)高于ps⁃bA-trnH序列与瘤果芹属裂苞瘤果芹(Trachydium involucellatum)的相似度(93.92%);NJ树聚类分析结果显示,样本与天山棱子芹聚为一支,支持率为92%;形态学特征比对结果表明,样本与天山棱子芹形态特征吻合。结论综合传统的形态学与现代DNA条形码鉴定结果,最终确定样本的基原为天山棱子芹。