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梨Ⅲ型聚酮合成酶家族的比较基因组学研究及表达模式分析
被引量:
4
1
作者
李国辉
李亿红
+7 位作者
钱冉
苏雪强
程曦
赵宇
孙燕铭
金青
林毅
蔡永萍
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第6期1005-1017,共13页
植物Ⅲ型聚酮合成酶(PKS Ⅲ)在植物次生代谢产物生物合成中起着非常重要的作用。本研究从7种蔷薇科果树中共鉴定出57个PKS家族成员,随后进行种间比较基因组学分析。基因结构和保守基序分析表明,57个PKS多数由两个外显子和一个内含子组成...
植物Ⅲ型聚酮合成酶(PKS Ⅲ)在植物次生代谢产物生物合成中起着非常重要的作用。本研究从7种蔷薇科果树中共鉴定出57个PKS家族成员,随后进行种间比较基因组学分析。基因结构和保守基序分析表明,57个PKS多数由两个外显子和一个内含子组成,都具有PKS特有的保守结构域Chal-sti-synt-N和Chal-sti-synt-C。进化分析显示,57个PKS可明显分为4个亚家族,其中I亚家族成员数目最多。染色体定位及基因复制事件表明,PKS不均匀地分布在2~5条染色体上,且PKS家族进化过程主要受纯化选择作用。荧光定量分析发现,PbPKS4和PbPKS5表达模式与‘砀山酥梨’(Pyrus bretschneideri cv.‘Dangshan Su’)不同发育时期果实中木质素及石细胞含量变化趋势类似,因此推测这2个基因在梨果实木质素合成及石细胞发育过程中发挥一定作用。本研究为今后研究蔷薇科果树PKS家族建立了基础,也为从分子水平改善梨果实品质提供了理论依据。
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关键词
梨
植物ⅲ型聚酮合成酶
生物信息学
木质素
表达分析
原文传递
题名
梨Ⅲ型聚酮合成酶家族的比较基因组学研究及表达模式分析
被引量:
4
1
作者
李国辉
李亿红
钱冉
苏雪强
程曦
赵宇
孙燕铭
金青
林毅
蔡永萍
机构
安徽农业大学生命科学学院
出处
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第6期1005-1017,共13页
基金
国家自然科学基金(31640068)
安徽省大学生创新创业训练项目(201710364098)
安徽农业大学研究生创新基金(2018yjs-41)~~
文摘
植物Ⅲ型聚酮合成酶(PKS Ⅲ)在植物次生代谢产物生物合成中起着非常重要的作用。本研究从7种蔷薇科果树中共鉴定出57个PKS家族成员,随后进行种间比较基因组学分析。基因结构和保守基序分析表明,57个PKS多数由两个外显子和一个内含子组成,都具有PKS特有的保守结构域Chal-sti-synt-N和Chal-sti-synt-C。进化分析显示,57个PKS可明显分为4个亚家族,其中I亚家族成员数目最多。染色体定位及基因复制事件表明,PKS不均匀地分布在2~5条染色体上,且PKS家族进化过程主要受纯化选择作用。荧光定量分析发现,PbPKS4和PbPKS5表达模式与‘砀山酥梨’(Pyrus bretschneideri cv.‘Dangshan Su’)不同发育时期果实中木质素及石细胞含量变化趋势类似,因此推测这2个基因在梨果实木质素合成及石细胞发育过程中发挥一定作用。本研究为今后研究蔷薇科果树PKS家族建立了基础,也为从分子水平改善梨果实品质提供了理论依据。
关键词
梨
植物ⅲ型聚酮合成酶
生物信息学
木质素
表达分析
Keywords
pear
plant type
ⅲ
polyketide synthase
bioinformatics
lignin
expression analysis
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
S661.2 [农业科学—果树学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
梨Ⅲ型聚酮合成酶家族的比较基因组学研究及表达模式分析
李国辉
李亿红
钱冉
苏雪强
程曦
赵宇
孙燕铭
金青
林毅
蔡永萍
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
4
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