植物miRNA在植物生长发育中的作用研究

对植物miRNA的特点、生物合成过程、作用机制和发育调控进行了综述。

植物miRNA及其在植物发育进程和环境胁迫响应中的潜在功能

文章介绍植物miRNA的产生、作用和miRNA的靶基因发掘以及miRNA在植物发育进程和环境胁迫响应中的潜在功能研究进展。

植物miRNA抗胁迫机理研究进展

植物microRNA(miRNA)是一类约有21个核苷酸组成的小RNA分子,属于非编码单链RNA家族。miRNA与靶mRNA互补配对结合,以抑制基因表达或切割mRNA的方式,实现基因的负调控。miRNA对植物基因表达、生长发育和抵抗胁迫等有十分重要的影响。综述了植物miRNA特点以及miRNA抗胁迫机理的最新研究进展。

植物miRNA研究进展

miRNA是一类长度为 2 0～ 2 5nt,能调节mRNA表达的非编码RNA基因产物 .自 1993年首次在线虫中发现以来 ,miRNA的研究一直局限于动物中 .2 0 0 2年 ,miRNA被证实也存在于植物中 ,随后植物中越来越多的miRNA相继被报道 ,有关植物miRNA的形成、特征、作用机制以及它与植物生长发育的关系也日益引起人们的兴趣 .本文就植物中miRNA的研究现状做一综述 .

植物miRNA靶基因验证研究进展

植物microRNA(miRNA)可以利用碱基互补配对原则对靶基因进行识别并介导靶基因(mRNA)的切割或翻译抑制,以此机制来调控靶基因的表达。主要从作用方式及实验体系两大方面入手,综述了植物miRNA与其靶基因的作用机制,以及植物miRNA靶基因验证方法的研究进展,旨在更深入的探究miRNA与其靶基因的作用关系。

基于高通量数据的人体外源性植物miRNA跨界调控建模

以基于人体血清的高通量测序数据为研究对象,采用生物计算方法对数据进行分析,以目前已知的人类和植物的RNA数据作为参照集,从中筛选出可能的人体外源植物miRNA;基于miRNA的调控机制原理,获得可能的植物miRNA干扰人类mRNA的靶基因;构建植物miRNA-人类mRNA调控网络模型,分析可能的跨界调控作用。本文通过构建植物-人体跨界调控模型,共挖掘出9个核心模块。研究结果表明,外源性植物miRNA参与调控人体胺代谢、酒精代谢以及脂肪酸代谢等生物过程。

植物抗逆相关miRNA的研究及其在木薯中的应用

MicroRNA(miRNA)是一类广泛存在于真核生物中,不编码蛋白质的短序列RNA,长度为20～24nt,它通过与靶mRNA特异性的碱基配对引起靶mRNA的降解或者抑制其翻译,从而实现对靶基因的转录后表达的调控。介绍miRNA的特点、在植物中的分布,着重阐述植物microRNA在响应营养胁迫、病毒侵害、低温、干旱和盐害等逆境过程中的生物学功能;并介绍木薯miRNA的研究进展,展望其在木薯遗传改良中的应用前景。

植物miRNA的研究方法概述

microRNA(miRNA)是动植物中广泛存在的内源性非编码小RNA分子,通过与靶基因mRNA的特定位点结合,在转录后水平负调控靶标基因的表达。植物miRNA几乎调控所有的生物学和代谢过程,包括生长发育、细胞维持和分化、信号转导以及对逆境胁迫的响应。随着第二代深度测序技术和生物信息学的快速发展,miRNA的相关研究已从模式植物扩展到非模式植物,发现了大量新的miRNA,并确定了小部分miRNA的生物学功能。由于miRNA序列短小,与靶标基因作用的不确定以及调控网络的复杂性,研究难度较大。本文从研究方法的角度对miRNA的鉴定、靶基因的验证和miRNA功能研究等方面所涉及的方法进行总结,试图为植物miRNA的研究提供一些思路和启发。

植物抗逆和开花相关miRNA研究进展及在丝瓜上的应用

miRNA是生物体内的一种非编码小RNA,长度为20~22个核苷酸,通过与靶mRNA互补配对,在转录后水平上对基因表达进行负调控,可导致mRNA降解或翻译抑制,主要对植物形态建成、生长发育及对外界环境胁迫因素的应答等产生影响。介绍miRNA的形成,重点阐述植物miRNA在响应低温、干旱、盐害等逆境胁迫和开花调控中的生物学功能,并介绍丝瓜及葫芦科miRNA的近期研究情况。

外源植物miRNAs和病毒miRNAs对哺乳动物及人体细胞的作用

microRNAs简称miRNAs,在真核生物和一些哺乳动物病毒中,miRNAs是一类不编码任何蛋白的大约22个核苷酸左右的细胞内小RNA。miRNAs广泛参与生物体内的各项生理功能,例如调控动物体细胞的增殖、分化、免疫、应激、肿瘤的发生等,而在植物中miRNAs负责调节生长发育、营养物质代谢及激素分泌等。在miRNAs家族中,一些植物miRNAs和病毒miRNAs也可以进入动物体内并对动物细胞的生命活动进行调节。

miRNA在调节植物抗逆等生理功能中的作用

植物microRNA（miRNA）是一类约21-24个核苷酸组成的小分子RNA。在细胞核中将非编码的茎环结构的单链RNA前体（pri-miRNA）加工成miRNA/miRNA＊双链,然后运到细胞质中解开双链。成熟的miRNA通过形成miRNA诱导的沉默复合物（miRNA-induced silencing complex,miRISC）与靶标mRNA互补配对结合,并对其进行剪切或抑制翻译,实现对靶标基因的负调控。miRNA在抗逆反应、植物发育、信号转导等方面起着重要作用。

血液循环和植物来源miRNA的研究进展

miRNA是一类19～25个核苷酸大小的非编码RNA,参与了基因的转录与翻译的调节,广泛参与了哺乳动物体内肿瘤和心脑血管疾病等的发生、发展过程。最近研究表明,外周血液中存在miRNA,具有良好的稳定性。循环中某些miRNA水平变化与某些疾病的发生、发展和预后密切相关,可能是一种新的疾病生物标记物。植物来源的miRNA可以稳定地存在于动物的血液,并参与了机体多种靶蛋白的调控。检测血液中植物源性miRNA水平的变化,对于评估中药的疗效和阐明其作用机制具有重要意义。

植物源miRNA跨界调控动物机体健康研究进展

食物中的营养素普遍被认为是有关动物营养调控基因表达的重要物质,近年来发现,食物中植物源miRNA作为一类单链非编码小RNA可能是一种新的食物功能性成分在动物机体发挥调控作用。过去10年出现的证据表明,植物源miRNAs可以通过采食进入动物机体参与基因的表达调控,在动物生理过程和疾病发生发展中产生影响。目前,对食物中植物源miRNA如何进入动物机体并在机体内转运发挥调节功能的一系列活动仍未有系统全面总结。因此,本文从植物源miRNA跨物种的稳定性、转运方式、吸收规律、作用机制和代谢等方面的进展进行总结分析,为探究食物中植物源miRNA与动物健康和生长的关系提供新的视角,并对植物源miRNA跨界调控动物健康和在畜牧生产中的应用前景进行展望,为植物源miRNA的开发利用提供参考。

植物源miR156a-5p对五指山断奶仔猪肠道菌群和上皮屏障的影响

本试验旨在探究植物源miR156a-5p对五指山断奶仔猪肠道菌群和上皮屏障的影响。选取初始体重为(5.82±0.13)kg的35日五指山龄断奶仔猪12头,随机分为2组,每组6个重复,每个重复1头。对照组饲喂无意义单链核酸,试验组饲喂合成的植物源miR156a-5p(每天600 pmol/kg)。试验期7 d。结果表明:与对照组相比,1)试验组的终末体重和平均日增重均无显著差异(P>0.05),肺脏指数显著增加(P<0.05);2)试验组的血清白蛋白和高密度脂蛋白胆固醇含量显著或极显著提高(P<0.05);3)试验组十二指肠Chao1指数和Observed_otus指数显著提高(P<0.05),空肠Simpson指数显著降低(P<0.05),盲肠Shanon指数和Simpson指数显著或极显著提高(P<0.05或P<0.01),结肠Simpson指数显著提高(P<0.05);4)试验组十二指肠拟杆菌目(Bacteroidales)、拟杆菌纲(Bacteroidia)和拟杆菌属(Bacteroides)的富集显著增加(P<0.05),十二指肠纤毛菌属(Leptotrichia)、颤螺旋菌属(Oscillibacter)、UCG-010、螺杆菌属(Helicobacter)、脱硫弧菌属(Desulfovibrio)、Clostridia_vadinBB60_group、副萨特氏菌属(Parasutterella)和理研菌属(Rikenella)等的富集显著增加(P<0.05);5)试验组十二指肠pH和隐窝深度极显著提高(P<0.01);6)试验组十二指肠载脂蛋白A1(APOA1)和尾型同源盒转录因子2(CDX2)mRNA相对表达量极显著上调(P<0.01),十二指肠黏糖蛋白2(MUC2)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)和β防御素1(DEFB1)mRNA相对表达量显著上调(P<0.05)。综上所述,植物源miR156a-5p可调节断奶五指山仔猪十二指肠、空肠、盲肠和结肠菌群α多样性,增加十二指肠pH及拟杆菌纲、目和属水平的富集,改善十二指肠上皮分化、化学屏障和黏膜免疫屏障功能。

植物MicroRNA功能的研究进展

MicroRNA(miRNA)是真核生物基因表达的一类负调控因子,植物miRNA主要在转录水平上通过介导靶基因的甲基化、在转录后水平介导靶mRNA的切割或降低靶mRNA的翻译来调节基因的表达,从而调控植物器官的形态建成、生长发育、激素分泌与信号转导以及植物对逆境胁迫因素的应答能力。该文主要综述了近年来植物miRNA在植物生长发育、激素调节与信号转导以及逆境胁迫应答中的重要作用,并针对miRNA的网络调控特征提出了今后miRNA功能研究的方向。

植物MicroRNA

MicroRNA(miRNA)是一类长度约为22个核苷酸的内源单链非编码RNA,在结构上相当保守,因而可以借助生物信息学方法进行预测.从2002年证实miRNA在植物中的存在以来,关于植物miRNA的研究进展异常迅速,短短几年内就已发现200多种.植物miRNA主要通过切割靶mRNA,或抑制靶mRNA翻译,来调控植物个体生长发育并影响其生理过程,是一种新的基因调控方式.本文将就植物miRNA的形成、特征、作用机制、生物功能及其与siRNA的关系进行综述.

植物microRNA的生物信息学预测与分析

microRNA(miRNA)是一类广泛存在于真核生物中调控基因转录后表达的非编码小分子RNA。大量研究表明,miRNA在调节多种生物途径中起着重要的作用,采用生物信息学方法预测与分析miRNA是当前发现和鉴定植物miRNA的重要策略之一。本文总结了生物信息学预测植物miRNA及其靶基因的方法策略,阐述了生物信息学在植物miRNA研究中的重要作用,为今后的研究奠定了基础。

植物microRNA靶基因的预测与验证技术研究进展

MicroRNA(miRNA)是真核生物中具有重要调控功能的一类小分子RNA。植物miRNA通过碱基互补配对方式引导RNA沉默复合体识别靶基因并介导靶基因mRNA被剪切或蛋白质翻译被抑制,所以对植物miRNA靶基因的分析和验证是研究miRNA功能必不可少的一部分。植物miRNA靶基因可通过生物信息学方法预测,主要根据miRNA与mRNA的互补程度进行,然而理论上预测的靶基因尚有待于进一步的试验验证。简要介绍了植物miRNA产生过程的最新研究进展以及靶基因的预测方法,重点综述了植物miRNA靶基因的验证方法,包括RLM-5'RACE、降解组测序、瞬时共表达和转基因系统,为更深入地研究植物miRNA介导的调控机制提供参考。

植物microRNA及其在植物生长发育中作用的研究进展

microRNA(miRNA)是一类由内源基因编码的长度约21～25 nt的非编码小分子RNA。miRNA广泛分布于植物中,在植物生长发育的整个生活史中都有着重要的作用。文中主要介绍了植物miRNA的特点、生物合成、作用机制及其在植物发育中的作用。

基于MiRfilter系统的毛果杨miRNA预测

从参数训练、参数范围训练、候选成熟体打分等方面改进miRNA预测系统MiRfilter,使其适应拥有更长前体的植物miRNA的预测.预测毛果杨基因组上的miRNA,并对系统进行精度检验.利用MiRfilter系统共预测出3 860条候选miRNA;在110个正样本中,正确识别91条前体和80条成熟体,前体预测精度为82.73%,成熟体预测精度为72.73%;在毛果杨第4号染色体(LG_Ⅳ)上得到的1 968个负样本中,有12个数据可认为是miRNA,假阳性率为0.61%.