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基于遗传算法的启动子序列多粒度结构分*析
1
作者
吴彦
王立宏
赵宪佳
《青岛大学学报(自然科学版)》
CAS
2009年第2期11-14,共4页
采用遗传算法对启动子序列数据集抽取不同长度的最优模糊子序列模式,以此分析启动子的结构。实验发现:适当调整子序列模式与样本序列的匹配程度阈值,可以发现局部频繁模式,除较长的TATA盒外还发现了其他一些模式,而在阈值较低时算法得到...
采用遗传算法对启动子序列数据集抽取不同长度的最优模糊子序列模式,以此分析启动子的结构。实验发现:适当调整子序列模式与样本序列的匹配程度阈值,可以发现局部频繁模式,除较长的TATA盒外还发现了其他一些模式,而在阈值较低时算法得到CpG岛。
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关键词
遗传算法
启动
子
模糊子序列模式
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职称材料
题名
基于遗传算法的启动子序列多粒度结构分*析
1
作者
吴彦
王立宏
赵宪佳
机构
青岛大学数学科学学院
烟台大学计算机学院
青岛大学国际学院
出处
《青岛大学学报(自然科学版)》
CAS
2009年第2期11-14,共4页
基金
山东省自然科学基金(No.Y2008G08)
文摘
采用遗传算法对启动子序列数据集抽取不同长度的最优模糊子序列模式,以此分析启动子的结构。实验发现:适当调整子序列模式与样本序列的匹配程度阈值,可以发现局部频繁模式,除较长的TATA盒外还发现了其他一些模式,而在阈值较低时算法得到CpG岛。
关键词
遗传算法
启动
子
模糊子序列模式
Keywords
genetic algorithm
promoter
fuzzy sub-sequence pattern
分类号
TP391.4 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于遗传算法的启动子序列多粒度结构分*析
吴彦
王立宏
赵宪佳
《青岛大学学报(自然科学版)》
CAS
2009
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