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基于mtDNA控制区部分序列探讨东北狍与西伯利亚狍、欧洲狍的遗传分化
被引量:
1
1
作者
杨宝田
刘忠军
白秀娟
《吉林农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第2期214-220,共7页
对来自中国东北12个狍样本线粒体控制区序列进行了测定,初步探讨了东北狍种群的遗传结构及其与西伯利亚狍、欧洲狍的遗传分化问题。结果在562 bp的线粒体DNA控制区序列中共发现40个变异位点,其中转换38个,颠换2个(Ti/Tv=19∶1),多态位...
对来自中国东北12个狍样本线粒体控制区序列进行了测定,初步探讨了东北狍种群的遗传结构及其与西伯利亚狍、欧洲狍的遗传分化问题。结果在562 bp的线粒体DNA控制区序列中共发现40个变异位点,其中转换38个,颠换2个(Ti/Tv=19∶1),多态位点的比例为7.12%。共检测到12种线粒体DNA单倍型,单倍型间的序列差异平均为2.00%。结合GenBank上西伯利亚狍和欧洲狍同源序列进行分析,确定27个单倍型,种群内及种群间无共享单倍型。AMOVA分析结果表明,遗传变异主要发生在种群间(67.28%)。东北狍与西伯利亚狍无明显遗传分化(Fst=0.112 25,P>0.05),二种群间基因流程度最大(2.03)。而东北狍与欧洲狍(Fst=0.718 28,P<0.001)、西伯利亚狍与欧洲狍(Fst=0.791 84,P<0.001)、西伯利亚狍—东北狍组合与欧洲狍(Fst=0.694 50,P<0.001)均具有显著的遗传分化。系统发生树和单倍型网络关系图均将27个单倍型分成2个进化枝:欧洲狍进化枝和西伯利亚狍—东北狍进化枝。
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关键词
东北
狍
西伯利亚
狍
欧洲狍
线粒体DNA
控制区
遗传分化
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职称材料
题名
基于mtDNA控制区部分序列探讨东北狍与西伯利亚狍、欧洲狍的遗传分化
被引量:
1
1
作者
杨宝田
刘忠军
白秀娟
机构
阳师范大学化学与生命科学学院
东北农业大学动物科学技术学院
吉林农业大学中药材学院
出处
《吉林农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第2期214-220,共7页
基金
沈阳师范大学博士启动基金项目
文摘
对来自中国东北12个狍样本线粒体控制区序列进行了测定,初步探讨了东北狍种群的遗传结构及其与西伯利亚狍、欧洲狍的遗传分化问题。结果在562 bp的线粒体DNA控制区序列中共发现40个变异位点,其中转换38个,颠换2个(Ti/Tv=19∶1),多态位点的比例为7.12%。共检测到12种线粒体DNA单倍型,单倍型间的序列差异平均为2.00%。结合GenBank上西伯利亚狍和欧洲狍同源序列进行分析,确定27个单倍型,种群内及种群间无共享单倍型。AMOVA分析结果表明,遗传变异主要发生在种群间(67.28%)。东北狍与西伯利亚狍无明显遗传分化(Fst=0.112 25,P>0.05),二种群间基因流程度最大(2.03)。而东北狍与欧洲狍(Fst=0.718 28,P<0.001)、西伯利亚狍与欧洲狍(Fst=0.791 84,P<0.001)、西伯利亚狍—东北狍组合与欧洲狍(Fst=0.694 50,P<0.001)均具有显著的遗传分化。系统发生树和单倍型网络关系图均将27个单倍型分成2个进化枝:欧洲狍进化枝和西伯利亚狍—东北狍进化枝。
关键词
东北
狍
西伯利亚
狍
欧洲狍
线粒体DNA
控制区
遗传分化
Keywords
Northeastern China roe deer
Siberian roe deer
European roe deer
mitochondrial DNA
control region
genetic differentiation
分类号
S865.4 [农业科学—野生动物驯养]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于mtDNA控制区部分序列探讨东北狍与西伯利亚狍、欧洲狍的遗传分化
杨宝田
刘忠军
白秀娟
《吉林农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
1
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职称材料
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