基于EST-SSR标记的欧洲红皮柳遗传变异分析

利用25个柳树EST-SSR标记对欧洲红皮柳18个个体进行基因分型,并通过标记多态性来检验个体间的遗传变异情况。结果表明:25个标记共检测到100条等位片段,每个位点等位基因数从1—12个不等,平均4个。其中23个标记表现为多态性,其观测杂合度(Ho)变化范围为0.055 5到1.0,平均为0.627 2;期望杂合度(He)变化范围为0.055 5到0.852 3,平均为0.567 8;多态信息量(PIC)变化范围为0.812 5到0.052 5,平均值为0.494 1。聚类分析显示,在遗传相似度为0.52处,欧洲红皮柳18个个体分为2组。该研究为欧洲红皮柳核心种质的收集与利用提供了理论依据。

柳树株型调控CCO基因家族全基因组鉴定及表达模式

为研究柳树的株型调控机理,分析了欧洲红皮柳(Salix purpurea)类胡萝卜素裂解氧化酶(CCO)基因家族,对其进行全基因组鉴定和表达谱分析。在biolinux系统中,通过生物信息学方法,对其理化性质、基因结构、进化特性、染色体定位和启动子元件等进行了分析。结果表明:筛选得到15个红皮柳CCO基因家族成员,系统进化树分析将该基因家族中的15个成员分成5个亚家族,无NCED5、NCED9亚类。进化过程中有4对是由基因串联复制事件演化而来,其他5对是由于基因组的片段复制事件。分析了启动子区域相关的胁迫响应元件和激素响应元件,外源激素处理灌木柳发现CCD7表达受抑制,SpCCD8在茎段中与赤霉素处理表型呈正相关,为分枝调控基因。