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铜死亡相关lncRNA预测三阴性乳腺癌患者预后及与肿瘤免疫微环境的关系
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作者 许春景 郭旭 +2 位作者 陈杰 马波 周娟娣 《浙江医学》 CAS 2023年第23期2468-2472,2508,共6页
目的 明确铜死亡相关长链非编码RNA(lncRNA)在三阴性乳腺癌(TNBC)中的预后价值及与肿瘤免疫微环境的关系。方法 收集肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中收录的TNBC患者临床信息和转录组测序数据,利用共表达分析筛选铜死亡相关lncRNA,通过Cox... 目的 明确铜死亡相关长链非编码RNA(lncRNA)在三阴性乳腺癌(TNBC)中的预后价值及与肿瘤免疫微环境的关系。方法 收集肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中收录的TNBC患者临床信息和转录组测序数据,利用共表达分析筛选铜死亡相关lncRNA,通过Cox回归分析构建预后模型。基于所构建的预后模型,将TNBC患者分为不同风险分组,利用功能富集、免疫浸润分析,评估不同分组患者的肿瘤免疫微环境状态。结果 TCGA中筛选到TNBC铜死亡相关lncRNA 111个,Cox回归分析建立由MELTF-AS1、APTR、DHRS4-AS1、LINC02188和URB1-AS1等5个铜死亡相关lncRNA组成的TNBC预后模型。低风险组患者生存时间明显长于高风险组(P<0.05)。高风险组患者肿瘤组织中免疫抑制性细胞浸润增加。结论 基于铜死亡相关lncRNA所建立的预后模型可有效预测TNBC患者预后及评估肿瘤免疫微环境。 展开更多
关键词 三阴性乳腺癌 死亡相关长非编码RNA 预后模型 肿瘤免疫微环境
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铁死亡相关lncRNA结肠癌预后风险模型的构建及临床应用 被引量:1
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作者 汪雨卿 张越 +1 位作者 徐稳 崔中奇 《检验医学》 CAS 2022年第8期720-728,共9页
目的 基于肿瘤基因图谱计划(TCGA)数据库筛选铁死亡相关长链非编码RNA(lncRNA),建立结肠癌预后风险模型,并探讨其临床应用价值。方法 选取行结肠癌根治术的患者48例,收集术中切除的癌组织及对应的癌旁组织(距离癌组织边缘2~3 cm)。从TCG... 目的 基于肿瘤基因图谱计划(TCGA)数据库筛选铁死亡相关长链非编码RNA(lncRNA),建立结肠癌预后风险模型,并探讨其临床应用价值。方法 选取行结肠癌根治术的患者48例,收集术中切除的癌组织及对应的癌旁组织(距离癌组织边缘2~3 cm)。从TCGA数据库中收集结肠癌的转录组数据(结肠癌组织428例、正常结肠组织41例)及对应患者的临床资料。筛选结肠癌组织与正常结肠组织差异表达的铁死亡相关基因,并进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组数据库(KEGG)通路分析。筛选与结肠癌预后相关的铁死亡lncRNA,采用共识聚类分析对结肠癌患者进行分组,并比较总体生存率。采用LASSO-Cox回归分析建立预后风险模型。建立用于预测结肠癌患者总体生存率的列线图。采用细胞学实验分析关键lncRNAITGB1-DT在结肠癌中的生物学功能。结果 从TCGA数据库中筛选出72个差异表达的铁死亡相关基因,其中表达上调47个、表达下调25个,GO和KEGG通路分析结果显示这72个基因广泛参与了铁代谢和脂肪酸氧化等生物学过程。共筛选出20个结肠癌组织与正常组织有差异的铁死亡lncRNA。根据共识聚类分析结果分组的2个结肠癌集群之间总体生存率差异有统计学意义(P<0.001)。根据LASSO-Cox回归分析结果筛选出10个lncRNA,并构建预后风险模型,将428例结肠癌患者按7∶3的比例随机分为训练组和验证组。在训练组、验证组和总体结肠癌患者中,高风险组的总体生存率均显著低于低风险组(P<0.001)。结肠癌组织ITGB1-DT相对表达量显著高于癌旁组织(P<0.001)。细胞实验结果显示,ITGB1-DT可促进结肠癌细胞的增殖并抑制其铁死亡。结论 成功构建了基于铁死亡相关lncRNA的结肠癌预后风险模型,并建立了可用于判断结肠癌患者总体生存率的列线图。ITGB1-DT或可促进结肠癌的发展。 展开更多
关键词 死亡相关长非编码RNA 结肠癌 肿瘤基因图谱计划数据库
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死因诊断错误分析 被引量:1
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作者 周建民 吴宇红 《地方病通报》 2008年第3期95-96,共2页
关键词 死因诊断 死亡链
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新兴产业发展的内生规律及其扶持政策 被引量:1
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作者 洪莹 唐守廉 李政 《学习与实践》 CSSCI 北大核心 2014年第12期21-26,共6页
新兴产业从技术创新到产业形成可以分解为技术和市场两条价值链的实现过程,但这两条价值链是如何进行有机连接的,现有的产业扶持政策并未有太多的关注。实际上,新兴产业发展从本质上来说可以视为主导设计的竞争和围绕主导设计的生产组... 新兴产业从技术创新到产业形成可以分解为技术和市场两条价值链的实现过程,但这两条价值链是如何进行有机连接的,现有的产业扶持政策并未有太多的关注。实际上,新兴产业发展从本质上来说可以视为主导设计的竞争和围绕主导设计的生产组织演化,其将技术和市场两条价值链有机整合,不仅能够很好的解释两次"死亡之谷"的超越,也能为系统化构建新兴产业扶持政策提供一个整体的思路构架。基于此,产业政策在扶持新兴产业时,可以从三大机制来入手,加大主导设计的扶持和产业网络的建设。 展开更多
关键词 新兴产业 主导设计 价值死亡之谷” 产业网络
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Matrix-Geometric Method Based Unified Delay Analysis for Wireless Relay Networks
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作者 Liu Juan Chen Wei +1 位作者 Zhang Yingjun(Angela) Cao Zhigang 《China Communications》 SCIE CSCD 2012年第9期61-67,共7页
A lot of work has been focused on desig-ning and analyzing various cooperative diversity pro-tocols for wireless relay networks. To provide a uni-fied queuing analytic framework, we fonmlate an em-bedded Markov chain,... A lot of work has been focused on desig-ning and analyzing various cooperative diversity pro-tocols for wireless relay networks. To provide a uni-fied queuing analytic framework, we fonmlate an em-bedded Markov chain, which rams out to be a Quasi-Birth-and-Death (QBD) process. Using the Matrix-Ce-ometric method, we can analyze the average delay in a unified way. Theoretical analysis is validated by simu-lation results. We show that the delay performances of Amplify-and-Forward or Decode-and-Forwaxd (AF/ DF) and incremental AF/DF schemes can be analyzed in the unified way. Thus, we can always choose the best cooperative diversity scheme in different scenari-os for delay minimization. 展开更多
关键词 wireless relaying tandem queue Mark-ov chain Matrix-Geon'etric method
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p53 and its isoforms in DNA double-stranded break repair 被引量:3
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作者 Yu-xi ZHANG Wen-ya PAN Jun CHEN 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE CAS CSCD 2019年第6期457-466,共10页
DNA double-stranded break(DSB)is one of the most catastrophic damages of genotoxic insult.Inappropriate repair of DNA DSBs results in the loss of genetic information,mutation,and the generation of harmful genomic rear... DNA double-stranded break(DSB)is one of the most catastrophic damages of genotoxic insult.Inappropriate repair of DNA DSBs results in the loss of genetic information,mutation,and the generation of harmful genomic rearrangements,which predisposes an organism to immunodeficiency,neurological damage,and cancer.The tumor repressor p53 plays a key role in DNA damage response,and has been found to be mutated in 50%of human cancer.p53,p63,and p73 are three members of the p53 gene family.Recent discoveries have shown that human p53 gene encodes at least 12 isoforms.Different p53 members and isoforms play various roles in orchestrating DNA damage response to maintain genomic integrity.This review briefly explores the functions of p53 and its isoforms in DNA DSB repair. 展开更多
关键词 P53 p53 isoform DNA double-stranded break repair Cell death
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Reasonable routing in delay/disruption tolerant networks
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作者 Haizheng YU Jianfeng MA Hong BIAN 《Frontiers of Materials Science》 SCIE CSCD 2011年第3期327-334,共8页
Delay/disruption tolerant networking (DTN) is an approach to networking where intermittent connectivity exists: it is often afforded by a store and forward technique. Depending on the capability of intermediary nod... Delay/disruption tolerant networking (DTN) is an approach to networking where intermittent connectivity exists: it is often afforded by a store and forward technique. Depending on the capability of intermediary nodes to carry and forward messages, messages can be eventually delivered to their destination by mobile nodes with an appropriate routing protocol. To have achieved a successful delivery, most DTN routing protocols use message duplication methods. Although messages are rapidly transferred to the destination, the redundancy in the number of message copies increases rapidly. This paper presents a new routing scheme based on a stochastic process for epidemic routing. Message redundancy is efficiently reduced and the number of message copies is controlled reasonably. During the contact process of nodes in the network, the number of message copies changes, and according to the variability in the number of copies, we construct a special Markov chain, birth and death process, on the number of message copies then calculate and obtain a stationary distribution of the birth and death process. Comparing the theoretical model with the simulation we have performed we see similar results. Our method improves on time-to-live (TTL) and antipacket methods, in both redundancy and delivery success efficiency. 展开更多
关键词 delay/disruption tolerant networks (DTN) routing algorithm Markov chain message redundancy
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