用分离群体中的残余杂合系定位大豆C1连锁群的分枝数qBN-c1-1位点

【目的】大豆分枝数与大豆株型及产量关系密切,检测世代间可稳定遗传的大豆分枝数QTL,为大豆株型和产量育种的分子标记辅助选择奠定基础。【方法】根据科新3号×中黄20杂交组合F2群体构建的分子遗传图谱,对F2:4群体进行QTL定位,并利用定位QTL两侧的标记选择残余杂合个体,构建残余杂合系,对分枝数相关的QTL进行验证。【结果】在F2:4群体将分枝数QTL(qBN-c1-1)定位在C1连锁群区间Satt294-Satt399,贡献率为12.01%,来自于科新3号亲本的加性效应为-0.51;用F2:5选出残余杂合系,将控制大豆分枝数QTL定位在C1连锁群Satt399-Satt361区间,贡献率为11.16%,来自于科新3号的加性效应为-1.74,研究结果与F2:4群体一致。【结论】位于C1连锁群的与分枝数相关的QTL在该遗传背景下可稳定遗传。

基于残余杂合系的水稻显性矮秆基因的定位及KASP标记开发

株高是和水稻高产、稳产密切相关的重要农艺性状,发掘可育种利用的矮秆基因有重要的应用价值。本研究利用育种残余杂合系,鉴定了一个显性矮秆基因sd9,该基因能将株高降低18 cm。近等基因系F群体的遗传学分析显示矮秆植株与高秆植株的分离比为3:1,表明sd9为显性矮秆基因。构建了极高单株和极矮单株两个极端表型DNA混合池。利用靶向测序基因型检测(genotyping by target sequencing, GBTS)和40 k水稻SNP检测液相芯片相结合的方法进行了DNA混合池的基因型鉴定,将sd9基因定位于第9染色体14 976 197~14 993 586 bp区间。根据该区间的SNP开发了sd9连锁的KASP标记,验证了定位结果。分子标记的单因素方差分析显示:区间内的分子标记和株高极显著相关。单个标记QTL检测LOD值为57.50,解释表型效应66.50%。利用育种残余杂合系鉴定的sd9及其KASP标记的开发,可以为水稻株型的分子育种提供可直接利用的基因资源。