期刊文献+
共找到814篇文章
< 1 2 41 >
每页显示 20 50 100
基于注意力机制的蛋白质残基相互作用预测方法
1
作者 何如吉 权丽君 吕强 《计算机应用与软件》 北大核心 2024年第6期55-61,共7页
蛋白质残基相互作用预测对于构建蛋白质三级结构具有重要作用,许多基于深度学习的预测方法陆续提出。残基对的相互作用不仅由残基对本身属性决定,还受到所有其他残基对的影响,但多数深度模型采用的卷积神经网络更关注对局部特征的提取,... 蛋白质残基相互作用预测对于构建蛋白质三级结构具有重要作用,许多基于深度学习的预测方法陆续提出。残基对的相互作用不仅由残基对本身属性决定,还受到所有其他残基对的影响,但多数深度模型采用的卷积神经网络更关注对局部特征的提取,而忽略了残基对相互作用的全局因素。针对该问题,提出一种基于注意力机制的预测模型,能够兼顾残基对的局部属性以及全局属性。实验结果表明,该模型与其他方法相比具有一定优势。 展开更多
关键词 蛋白质 残基相互作用 注意力机制 深度学习
下载PDF
睾丸肾上腺残基瘤的超声图像特征
2
作者 曹喆 霍亚玲 王丹 《国际医药卫生导报》 2024年第6期1018-1020,共3页
目的分析睾丸肾上腺残基瘤(TART)的超声图像特征,以提高超声诊断价值。方法收集2018年1月至2022年8月在郑州大学附属儿童医院确诊为TART的10例男性患者的临床资料,年龄6~26岁,均有多年先天性肾上腺皮质增生症(CAH)病史,总结超声图像特... 目的分析睾丸肾上腺残基瘤(TART)的超声图像特征,以提高超声诊断价值。方法收集2018年1月至2022年8月在郑州大学附属儿童医院确诊为TART的10例男性患者的临床资料,年龄6~26岁,均有多年先天性肾上腺皮质增生症(CAH)病史,总结超声图像特点。结果10例患者均累及双侧睾丸,超声检查共发现病灶23个,均呈局灶性生长,其中16个位于睾丸门,7个位于睾丸纵隔旁;睾丸体积正常6例(60.0%),睾丸体积增大4例(40.0%);睾丸纵隔清晰显示9例(90.0%);23个(100.0%)病灶均边界清晰无包膜,其中低回声20个(87.0%),等回声3个(13.0%);病灶形态不规则16个(69.6%),病灶呈类圆形7个(30.4%);血供丰富14个(60.9%),血供稀少9个(39.1%)。结论TART以双侧睾丸受累为主,睾丸门或睾丸纵隔旁的低回声区为其特征性超声表现,结合CAH病史可做出确切诊断。 展开更多
关键词 睾丸肾上腺残基 超声表现 诊断价值
下载PDF
基于氨基酸关联的蛋白质—ATP配体结合残基的预测
3
作者 胡慧敏 胡秀珍 +2 位作者 郝四喜 杨彩芸 陈少华 《内蒙古工业大学学报(自然科学版)》 2023年第5期410-415,共6页
腺嘌呤核苷三磷酸(ATP)作为一种小分子配体与蛋白质结合对生物体内各种生命活动有重要影响,因此,准确预测蛋白质与ATP配体结合残基具有重要意义。我们在片段水平上对氨基酸的紧邻关联、9个残基对和中心模块进行了统计分析并给出了三种... 腺嘌呤核苷三磷酸(ATP)作为一种小分子配体与蛋白质结合对生物体内各种生命活动有重要影响,因此,准确预测蛋白质与ATP配体结合残基具有重要意义。我们在片段水平上对氨基酸的紧邻关联、9个残基对和中心模块进行了统计分析并给出了三种新的特征,分别添加这三种特征及其组合后应用支持向量机(SVM)算法预测蛋白质—ATP配体结合残基,预测结果都有提升,同时添加三种新特征时预测结果最好,5交叉检验下Sn、Sp、Acc值分别达到了79.67%、79.75%、79.71%,MCC和AUC值分别达到0.594和0.879,独立检验的Sn、Sp、Acc、MCC和AUC值分别为80.89%、79.7%、79.77%、0.254和0.887。 展开更多
关键词 结合残基 ATP配体 酸关联特征 支持向量机
下载PDF
精氨酸残基和赖氨酸残基对大鼠血红素加氧酶-1催化功能的影响 被引量:1
4
作者 王秀宏 赵炜明 +3 位作者 滕悦秋 王志刚 刘明 周虹 《中国地方病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期330-332,共3页
目的研究和探讨大鼠血红素加氧酶鄄1(RHO鄄1)中保守的碱性氨基酸精氨酸残基和赖氨酸残基对该酶催化功能的影响。方法应用定点诱变制备20种RHO鄄1的变异型酶质粒,其中RHO鄄1中保守的碱性氨基酸精氨酸和赖氨酸被置换成谷氨酸,将它们在大... 目的研究和探讨大鼠血红素加氧酶鄄1(RHO鄄1)中保守的碱性氨基酸精氨酸残基和赖氨酸残基对该酶催化功能的影响。方法应用定点诱变制备20种RHO鄄1的变异型酶质粒,其中RHO鄄1中保守的碱性氨基酸精氨酸和赖氨酸被置换成谷氨酸,将它们在大肠埃希菌中表达并纯化后,用光谱扫描方法在以NADPH-细胞色素P鄄450还原酶提供电子的模拟体内反应体系下测定变异型酶和野生型酶的活性,从而观察变异型酶的活性是否发生改变。结果变异型酶R35E、K39E、R44E、R136E、K148E、K149E、K153E、R185E和K196E对血红素的降解速度低于野生型酶。结论R35等9个精氨酸残基和赖氨酸残基在参与RHO鄄1催化血红素降解的反应中对该酶的催化功能有着重要影响。 展开更多
关键词 精氨酸残基 赖氨酸残基 大鼠 血红素加氧酶-1 催化功能 氧化应激 地方病
下载PDF
胆碱酯酶催化反应的量子化学研究 活性部位残基间氢键的形成及残基氧化的影响 被引量:1
5
作者 苏忠民 崔瑞海 王荣顺 《Chinese Journal of Catalysis》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1992年第2期138-142,共5页
采用量子化学的CNDO/2法,探讨了胆碱酯酶活性部位的组氨酸、丝氨酸等残基问氢键的形成和氢迁移问题,从理论上阐明了酸催化乙酸胆碱反应中何者作为亲核基团向底物进攻。考虑到氧化对酶生物活性的丧失有较大影响,对组氨酸残基氧化前后的... 采用量子化学的CNDO/2法,探讨了胆碱酯酶活性部位的组氨酸、丝氨酸等残基问氢键的形成和氢迁移问题,从理论上阐明了酸催化乙酸胆碱反应中何者作为亲核基团向底物进攻。考虑到氧化对酶生物活性的丧失有较大影响,对组氨酸残基氧化前后的氢键构成和催化机理进行了理论比较。为研究酶催化过程提供了有用的信息。 展开更多
关键词 胆碱酯酶 残基氢键 残基氧化
下载PDF
利用ABEEM/MM模型对气态丝氨酸和苏氨酸残基二肽分子构象的研究
6
作者 张霞 张强 杨忠志 《渤海大学学报(自然科学版)》 CAS 2006年第4期295-299,共5页
应用ABEEM/MM浮动电荷模型(原子-键电负性均衡方法融合进分子力场)对气态丝氨酸和苏氨酸残基二肽分子构象进行了初步的研究,与经典的力场模型相比,该方法中的静电势包含了分子内和分子间的静电极化作用,以及分子内电荷转移影响,同时加... 应用ABEEM/MM浮动电荷模型(原子-键电负性均衡方法融合进分子力场)对气态丝氨酸和苏氨酸残基二肽分子构象进行了初步的研究,与经典的力场模型相比,该方法中的静电势包含了分子内和分子间的静电极化作用,以及分子内电荷转移影响,同时加入了化学键等非原子中心电荷位点,合理的体现了分子中的电荷分布。相对其他极化力场模型,该模型具有计算量较小的特点。结果表明:我们模型计算的两种二肽分子的构象能和关键二面角结构与从头计算结果符合得很好,优于其他力场模型。 展开更多
关键词 丝氨酸残基二肽 苏氨酸残基二肽 原子-键电负性均衡方法融合进分子力场 (ABEEM/MM)构象 极化力场
下载PDF
人工蛹虫草固体培养残基中虫草素的提取分离研究 被引量:25
7
作者 钟艳梅 黄志全 温凯 《现代食品科技》 EI CAS 2007年第2期40-42,共3页
以人工蛹虫草固体培养残基为原料,采用索氏提取后,用离子交换层析进行分离研究。索氏提取结果表明水比乙醇更优于提取虫草素;离子交换层析分离提取固体培养残基中虫草素的正交实验表明洗脱流速、料水比为主要影响因子,最优条件为:料水比... 以人工蛹虫草固体培养残基为原料,采用索氏提取后,用离子交换层析进行分离研究。索氏提取结果表明水比乙醇更优于提取虫草素;离子交换层析分离提取固体培养残基中虫草素的正交实验表明洗脱流速、料水比为主要影响因子,最优条件为:料水比1:16,离子柱pH3.5;洗脱流速为1滴/2秒。 展开更多
关键词 蛹虫草 固体培养残基 虫草素 提取 分离
下载PDF
苦参凝集素的色氨酸残基修饰与荧光光谱研究 被引量:9
8
作者 刘一勇 周红 +2 位作者 汪新艳 孙敬儒 鲍锦库 《四川大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2001年第5期738-743,共6页
苦参凝集素 (SFL)经等电聚焦测得其等电点为 5 5 6 .用比色法测得每分子SFL含有 3个色氨酸残基 .经N 溴代丁二酰亚胺 (NBS)修饰表明其中 2个Trp残基位于分子表面 ,当这 2个Trp残基被修饰后 ,SFL的凝血活性完全丧失 ,糖保护试验表明SFL... 苦参凝集素 (SFL)经等电聚焦测得其等电点为 5 5 6 .用比色法测得每分子SFL含有 3个色氨酸残基 .经N 溴代丁二酰亚胺 (NBS)修饰表明其中 2个Trp残基位于分子表面 ,当这 2个Trp残基被修饰后 ,SFL的凝血活性完全丧失 ,糖保护试验表明SFL专一性抑制糖Man能够保护SFL ,阻断NBS对SFL的修饰作用 ,说明色氨酸不仅是SFL凝血活性所必需的 ,而且还参与其糖结合部位的组成 .SFL随着NBS的逐渐修饰 ,其内源荧光光谱亦相应发生变化 ,结果表明分子表面的 2个Trp残基可能位于分子的疏水袋中 ,而另一个Trp残基则埋藏于分子内部 .荧光淬灭研究表明 ,丙烯酰胺能淬灭 展开更多
关键词 苦参凝集素 色氨酸残基 化学修饰 荧光光谱 荧光淬灭 糖结合蛋白
下载PDF
同步荧光光谱法研究肿瘤芳香族氨基酸残基含量的变化 被引量:4
9
作者 张源 林哲绚 韩溟 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2017年第9期2822-2825,共4页
用同步荧光光谱法评估原发性肝细胞癌患者血浆、肝癌荷瘤小鼠以及培养细胞(HepG2和HL-7702)中酪氨酸(Tyr)和色氨酸(Trp)残基水平变化。固定发射波长λem和激发波长λex之间的波长差Δλ分别为20和60nm,激发和发射单色器同时进行扫描,确... 用同步荧光光谱法评估原发性肝细胞癌患者血浆、肝癌荷瘤小鼠以及培养细胞(HepG2和HL-7702)中酪氨酸(Tyr)和色氨酸(Trp)残基水平变化。固定发射波长λem和激发波长λex之间的波长差Δλ分别为20和60nm,激发和发射单色器同时进行扫描,确定350nm为Trp的同步特征发射峰位置,318nm为Tyr的同步特征发射峰位置。结果表明,肝癌患者及荷瘤小鼠血浆蛋白质所含Tyr和Trp残基的荧光强度明显增加。相反,肝癌细胞或荷瘤小鼠肿瘤组织中Tyr和Trp残基荧光强度却随生长时间增长而减少。进一步实验表明,具有抗癌活性的苦参碱处理癌细胞后,细胞Tyr和Trp残基的荧光强度升高。这些结果表明,Tyr和Trp残基的变化可能参与了肿瘤的发生发展。 展开更多
关键词 同步荧光光谱 色氨酸残基 酪氨酸残基 肝细胞癌
下载PDF
蛋白质中RNA-结合残基预测的随机森林模型 被引量:10
10
作者 马昕 郭静 孙啸 《东南大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第1期50-54,共5页
构建了用于预测蛋白质序列中RNA-结合残基的分类模型.在模型的特征提取方面,除了与功能相关的结构特征和序列正交编码信息以外,还提出了一个新颖的特征PSSM-PP.该特征不仅包含蛋白质序列的进化保守特征,还包含与蛋白质和RNA结合有关的... 构建了用于预测蛋白质序列中RNA-结合残基的分类模型.在模型的特征提取方面,除了与功能相关的结构特征和序列正交编码信息以外,还提出了一个新颖的特征PSSM-PP.该特征不仅包含蛋白质序列的进化保守特征,还包含与蛋白质和RNA结合有关的氨基酸理化特征.在设计模型时,考虑到样本数据量大的问题,选用了快速的随机森林算法.该预测模型总体预测准确率达到87.02%,特异性达到95.62%,敏感性达51.16%,Matthew相关系数为0.533 6.此外,还构建了RNA结合残基的预测平台. 展开更多
关键词 随机森林 位置特异性矩阵 嵌套式交叉验证 RNA-结合残基
下载PDF
人纤维蛋白溶酶原中色氨酸残基的化学修饰 被引量:6
11
作者 赵陈光 刘兰英 +1 位作者 邱爱东 刘淑英 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 1997年第5期744-747,共4页
以N-溴代琥珀酰亚胺为修饰剂,对人纤维蛋白溶酶原(HPg)中色氨酸(Trp)残基的分布及其与酶活力的关系进行了研究,发现每个HPg分子有19个Trp残基,5个位于分子表面;有2个是快反应残基,其中1个是活性必需的氨基酸.酶被修饰后其荧... 以N-溴代琥珀酰亚胺为修饰剂,对人纤维蛋白溶酶原(HPg)中色氨酸(Trp)残基的分布及其与酶活力的关系进行了研究,发现每个HPg分子有19个Trp残基,5个位于分子表面;有2个是快反应残基,其中1个是活性必需的氨基酸.酶被修饰后其荧光光谱及圆二色谱发生了变化. 展开更多
关键词 纤维蛋白溶酶原 色氨酸残基 化学修饰 HPg TRP
下载PDF
蛋白质中残基远程相互作用预测算法研究综述 被引量:6
12
作者 张海仓 高玉娟 +2 位作者 邓明华 郑伟谋 卜东波 《计算机研究与发展》 EI CSCD 北大核心 2017年第1期1-19,共19页
蛋白质是由多个氨基酸残基顺序连接而成的长链.在天然状态下,蛋白质并不是无规则的自由状态,而是自发形成特定的空间结构,以执行其特定的生物学功能.驱动蛋白质形成特定空间结构的主要因素是残基间的非共价相互作用,包括疏水作用、静电... 蛋白质是由多个氨基酸残基顺序连接而成的长链.在天然状态下,蛋白质并不是无规则的自由状态,而是自发形成特定的空间结构,以执行其特定的生物学功能.驱动蛋白质形成特定空间结构的主要因素是残基间的非共价相互作用,包括疏水作用、静电相互作用、范德华力等.因此,对残基之间远程相互作用的准确预测将有助于对蛋白质空间结构的预测,进而有助于对蛋白质生物学功能的了解.在蛋白质进化过程,有相互作用残基对之间存在一种"共进化"模式,即当一个残基发生变异时,与其有相互作用的残基也要发生相应的变异,以维持相互作用,进而维持整体空间结构以及生物学功能.基于上述生物学观察,研究者开发了多个统计模型和算法以预测残基对之间的相互作用:1)概述残基之间远程相互作用的两大类基本预测算法,包括无监督学习方法和监督学习方法;2)使用蛋白质结构预测CASP比赛结果来客观比较上述各类算法的性能,分析各个算法的特点和优势;3)从生物学观察和统计模型2个角度分析总结了未来的发展趋势. 展开更多
关键词 残基远程相互作用预测 蛋白质三级结构预测 图模型 共进化 机器学习
下载PDF
岩豆凝集素的纯化及其分子残基的化学修饰和活性关系 被引量:7
13
作者 鲍锦库 周红 +1 位作者 曾仲奎 杨莉 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 1996年第3期214-219,共6页
岩豆种子经侵取、硫酸铵分级、DEAE-纤维素离子交换和SephadexG-100分子筛层析,获得FPLC上单一的凝集素样品,对此纯化的凝集素样品用N-溴代丁二酰亚胺、N-乙基顺丁烯二酰亚胺、二流苏糖醇,碘乙酸和对氯汞... 岩豆种子经侵取、硫酸铵分级、DEAE-纤维素离子交换和SephadexG-100分子筛层析,获得FPLC上单一的凝集素样品,对此纯化的凝集素样品用N-溴代丁二酰亚胺、N-乙基顺丁烯二酰亚胺、二流苏糖醇,碘乙酸和对氯汞苯甲酸修饰其分子内的色氨酸和巯基.经计算,该凝集素分子内含有4个色氨酸和24个流基,当色氨酸被修饰后其凝集活性全部丧失,而巯基被修饰后对其凝血活性无任何影响,表明巯基与凝集素分子的凝血活性无关,而色氨酸则是凝集活性所必需的基团. 展开更多
关键词 岩豆 凝集素 提纯 分子残基 化学修饰
下载PDF
利用酪氨酸残基的共振瑞利散射研究溶液中蛋白质构象 被引量:6
14
作者 张源 林哲绚 +1 位作者 李慧 罗文鸿 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2006年第11期2089-2092,共4页
基于酪氨酸残基K带激发峰在较高浓度的蛋白质溶液中表现出特征散射峰,通过Δλ=0同步荧光扫描识别,建立用荧光分光光度法测定酪氨残基K带的共振散射峰强度及其波长位移来推测溶液中蛋白质构象变化的新方法。方法不受蛋白质色氨酸残基的... 基于酪氨酸残基K带激发峰在较高浓度的蛋白质溶液中表现出特征散射峰,通过Δλ=0同步荧光扫描识别,建立用荧光分光光度法测定酪氨残基K带的共振散射峰强度及其波长位移来推测溶液中蛋白质构象变化的新方法。方法不受蛋白质色氨酸残基的干扰,图谱简单明了直观。文章叙述了方法建立的实验基础,并用构建的方法研究了盐效应、酸碱性效应对蛋白质构象变化的影响,最后通过测定不同温度下酶活性的实验验证了方法对温度影响酶蛋白质构象变化的分析的正确性。 展开更多
关键词 蛋白质构象 酪氨酸残基 共振瑞利散射
下载PDF
菊粉酶中色氨酸残基的化学修饰及其荧光光谱 被引量:4
15
作者 刘仙 高国粉 +3 位作者 杨丽 何潇潇 孟哲 滕利荣 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2007年第1期103-105,共3页
Tryptophan(Trp) residues in inulinase were modified by chemical reagent N-bromossuccinimide(NBS).The results of Spande′s method indicate that there were seventeen Trp residues in inulinase and five of them were locat... Tryptophan(Trp) residues in inulinase were modified by chemical reagent N-bromossuccinimide(NBS).The results of Spande′s method indicate that there were seventeen Trp residues in inulinase and five of them were located on the surface of the enzyme.Three of these Trp residues were none-essential residues which showed the fastest rate by Zhou′s plot.Two relative faster reacting residues were both essential for the activity of the enzyme.The other twelve were the slowest or none-reactive residues for the reaction.The study on fluorescence quenching of inulinase shows that KI could not quench all of the fluorescence from Trp residues in inulinase which indicate that there are two kinds of Trp residues in inulinase acrylamide(Acr),a polarized quencher without electronic charge could quench almost all of the fluorescence from Trp residues in inuoinase while there are still seventy percernt of the activity of the enzyme left.The collisional quenching constants(K_D) of inulinase at different concentrations of Acr were calculated in terms of Stern-Volmer equation. 展开更多
关键词 菊粉酶 色氨酸残基 化学修饰 荧光猝灭
下载PDF
HLA氨基酸残基配型在免疫致敏受者肾移植中的应用探讨 被引量:3
16
作者 王长希 张白玉 +4 位作者 陈立中 毕颖 费继光 朱兰英 郑克立 《中山大学学报(医学科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期70-73,共4页
[目的]探讨人类自细胞抗原(HLA)氨基酸残基配型(Res M)在免疫致敏尤其是高敏受者肾脏移植中的临床意义。[方法]对47例致敏受者采用酶联免疫吸附法(ELUSA)检测体内预存的群体反应性抗体-IgG(PRA-IgG)的水平及特异性;采用一步法单克隆抗... [目的]探讨人类自细胞抗原(HLA)氨基酸残基配型(Res M)在免疫致敏尤其是高敏受者肾脏移植中的临床意义。[方法]对47例致敏受者采用酶联免疫吸附法(ELUSA)检测体内预存的群体反应性抗体-IgG(PRA-IgG)的水平及特异性;采用一步法单克隆抗体技术和微量序列特异性引物聚合酶链反应(Micro-PCR-SSP)技术进行HLA Ⅰ类和Ⅱ类分型。[结果]47例致敏受者的PRA-IgG水平为8.3%-96.4%,平均为38.8%,供受者间按传统的HLA抗原错配(MM)原则,0-1错配(MM)、2 MM的患者分别为5例(10.6%)、9例(19.1%),而按Res M的原则,0-1 MM、2 MM患者分别提高到22例(46.8%)、17例(36.1%)(P<0.001);其中PRA≥50%的18例高敏受者中,0-1MM 13例(72.2%),而PRA<50%的29例受者中,0-1MM 9例(31%),两者间差异有统计学意义(P<0.001);47致敏受者肾移植术后3个月内排斥反应的发生率为35%,在18例PRA≥50%的高敏受者中,仅有4例(22.2%)发生排斥反应,29例PRA<50%的受者中,11例(37.9%)发生排斥反应(P>0.05).[结论] HLA氨基酸残基配型可显著提高供受者的相配率,良好的HLA配型对减少高敏受者肾移植的排斥反应、提高移植物的存活率具有重要意义。 展开更多
关键词 肾移植 HIJA抗原 组织相容性试验 残基 配型
下载PDF
透明质酸酶的色氨酸残基修饰与荧光光谱研究 被引量:3
17
作者 滕利荣 初宇卓 +4 位作者 张晓萍 王静 韩松 于笑坤 刘兰英 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2005年第9期1662-1664,共3页
Tryptophan residues in Hyaluronidase(HAase) were modified by N-bromosuccinimide(NBS). The results indicated that there were eleven tryptophan residues in HAase and one of them was exposed, which was proved to be essen... Tryptophan residues in Hyaluronidase(HAase) were modified by N-bromosuccinimide(NBS). The results indicated that there were eleven tryptophan residues in HAase and one of them was exposed, which was proved to be essential for the activity of the enzyme. The study on fluorescence quenching of HAase showed that KI could not quench all of the fluorescence from Trp residues in HAase . Acrylamide(Acr), a polarized quencher without electronic charge, could quench almost all of the fluorescence from Trp residues in HAase . The collisional quenching constants(K-D) of HAase at different concentrations of Acr were calculated in terms of Stern-Volmer equation. The results implied that some of Trp residues were buried in the interior of HAase, and the Trp residue on the surface of HAase was not located in the hydrophobic pocket. 展开更多
关键词 透明质酸酶 色氨酸残基 化学修饰 荧光猝灭
下载PDF
关于静电作用对酶活性部位残基pK_a影响的定量计算 被引量:2
18
作者 来鲁华 罗宇 +2 位作者 徐筱杰 邵美成 唐有祺 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1989年第4期385-387,共3页
随着基因技术的发展,人们几乎已经可以任意替换蛋白质序列中的特定残基。由于理论上对蛋白质性能的预测工作还远远跟不上实验的发展,只能花费大量的人力、物力利用实验方法筛选突变体。这就迫切需要建立一套能够正确预测蛋白质性质的方... 随着基因技术的发展,人们几乎已经可以任意替换蛋白质序列中的特定残基。由于理论上对蛋白质性能的预测工作还远远跟不上实验的发展,只能花费大量的人力、物力利用实验方法筛选突变体。这就迫切需要建立一套能够正确预测蛋白质性质的方法。静电作用在酶促反应中起到了重要作用。基于表面带电残基对酶活性部位残基pK_α的影响,可利用替换表面残基的方法改变酶促反应随pH的变化趋势,是蛋白质工程研究中的一种有效方法。由于表面极性残基处于高介电常数的溶剂(水)与低介电常数的蛋白质的界面上,对此问题尚未有圆满的理论方法进行解决。我们利用Kirkwood理论定量地表述了表面荷电残基的替换对酶活性部位残基pK_α的影响,为研究酶突变体的性质,如突变体的电化学性质、酶催化反应随pH变化趋势的改变,酶专一性的改变等提供了一种简便的方法。 展开更多
关键词 活性残基 PKA 静电作用 计算
下载PDF
β-甘露聚糖酶末端残基变体对其酶学特性的影响 被引量:3
19
作者 唐存多 李剑芳 +2 位作者 邬敏辰 魏喜换 赵梅 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期655-660,共6页
本研究用宇佐美曲霉Aspergillus usamii的5家族β-甘露聚糖酶AuMan5A为母本,借助同源建模、分子对接及分子动力学模拟等理性设计方法,将AuMan5A的N-末端和C-末端分别截去3个无规则的氨基酸残基,构建出截短的β-甘露聚糖酶AuMan5AN3C3.将... 本研究用宇佐美曲霉Aspergillus usamii的5家族β-甘露聚糖酶AuMan5A为母本,借助同源建模、分子对接及分子动力学模拟等理性设计方法,将AuMan5A的N-末端和C-末端分别截去3个无规则的氨基酸残基,构建出截短的β-甘露聚糖酶AuMan5AN3C3.将AuMan5A和AuMan5AN3C3的编码基因分别在毕赤酵母GS115中进行表达,对表达产物进行了初步纯化并分析比较了其酶学特性及各自的表达水平.结果表明,reAuMan5A和reAuMan5AN3C3的最适温度Topt均为70℃,reAuMan5AN3C3在60℃的半衰期t1/260为38 min,较reAuMan5A(t1/260=40 min)略有降低;在相同表达条件下,reAuMan5AN3C3上清液的β-甘露聚糖酶活性为73.4 U/mL,较reAuMan5A的52.8 U/mL提高了39.0%;纯化的reAuMan5AN3C3酶比活性为182.7 U/mg protein,较reAuMan5A的126.3 U/mg protein提高了44.7%.与reAuMan5A相比,reAuMan5AN3C3对角豆胶的Km值下降不明显,Vmax值有显著提高. 展开更多
关键词 Β-甘露聚糖酶 理性设计 末端残基变体 表达 酶学性质
下载PDF
HLA氨基酸残基配型标准在肾移植中的应用 被引量:4
20
作者 武国军 王禾 +6 位作者 张波 王鹏飞 潘光辉 张峻 汤群辉 李欣 郭炜 《第四军医大学学报》 北大核心 2002年第24期2286-2288,共3页
目的 评价HLA氨基酸残基配型新标准在肾移植中的应用 .方法 应用血清学和基因分型方法对 134例肾移植供受者进行HLA Ⅰ ,Ⅱ类抗原分型 ,并比较氨基酸残基配型标准与传统的HLA六抗原无错配标准的关系 .结果 HLA氨基酸残基配型标准可... 目的 评价HLA氨基酸残基配型新标准在肾移植中的应用 .方法 应用血清学和基因分型方法对 134例肾移植供受者进行HLA Ⅰ ,Ⅱ类抗原分型 ,并比较氨基酸残基配型标准与传统的HLA六抗原无错配标准的关系 .结果 HLA氨基酸残基配型标准可以提高肾移植供受者的相配率 ,六抗原无错配率可由 0 .75 %提高到 2 .2 4 % ,六抗原完全错配的几率由 15 .6 7%降至 2 .2 4 % . 展开更多
关键词 HLA抗原 残基配型 临床应用 肾移植
下载PDF
上一页 1 2 41 下一页 到第
使用帮助 返回顶部