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基于朴素贝叶斯分类器的蛋白质界面残基识别(英文)
被引量:
1
1
作者
王池社
程家兴
+1 位作者
苏守宝
徐栋哲
《计算机科学与探索》
CSCD
2009年第3期293-302,共10页
蛋白质相互作用中界面残基的识别在药物设计与生物体的新陈代谢等方面有着广泛应用。基于朴素贝叶斯分类器对属性条件独立性的要求,构建了由蛋白质序列谱和溶剂可及表面积组成的蛋白质相互作用特征模型。在一个具有代表性的蛋白质异源...
蛋白质相互作用中界面残基的识别在药物设计与生物体的新陈代谢等方面有着广泛应用。基于朴素贝叶斯分类器对属性条件独立性的要求,构建了由蛋白质序列谱和溶剂可及表面积组成的蛋白质相互作用特征模型。在一个具有代表性的蛋白质异源复合物组成的数据集中取得了68.1%的准确率、0.201 的相关系数、40.2%的特异度和 49.9%的灵敏度,取得了比其他方法更优的结果,且远优于随机的实验结果。通过一个三维可视化的结果更好地验证了方法的有效性。
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关键词
朴素贝叶斯分类器
蛋白质相互作用界面
序列谱
残基溶剂可及表面积
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职称材料
题名
基于朴素贝叶斯分类器的蛋白质界面残基识别(英文)
被引量:
1
1
作者
王池社
程家兴
苏守宝
徐栋哲
机构
安徽大学计算智能与信号处理教育部重点实验室
巢湖学院计算机科学与技术系
中国科技大学近代力学系
出处
《计算机科学与探索》
CSCD
2009年第3期293-302,共10页
基金
The Projects of Provincial Natural Scientific Fund from the Bureau of Education of Anhui Province No.KJ2007B066,KJ2007A087
the Science and Research Fund from the Bureau of Anhui Province for Young Teachers No.2007jql140~~
文摘
蛋白质相互作用中界面残基的识别在药物设计与生物体的新陈代谢等方面有着广泛应用。基于朴素贝叶斯分类器对属性条件独立性的要求,构建了由蛋白质序列谱和溶剂可及表面积组成的蛋白质相互作用特征模型。在一个具有代表性的蛋白质异源复合物组成的数据集中取得了68.1%的准确率、0.201 的相关系数、40.2%的特异度和 49.9%的灵敏度,取得了比其他方法更优的结果,且远优于随机的实验结果。通过一个三维可视化的结果更好地验证了方法的有效性。
关键词
朴素贝叶斯分类器
蛋白质相互作用界面
序列谱
残基溶剂可及表面积
Keywords
nayve Bayes classifier
protein-protein interactions
sequence profile
residue accessible surface area
分类号
TP39 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于朴素贝叶斯分类器的蛋白质界面残基识别(英文)
王池社
程家兴
苏守宝
徐栋哲
《计算机科学与探索》
CSCD
2009
1
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