凉山黑绵羊线粒体DNA D-loop序列遗传多样性和遗传进化研究

为了探讨凉山黑绵羊遗传多样性及不同地理群体间的母系遗传进化情况,试验选取60只来源于四川省凉山彝族自治州的普格县、盐源县、布拖县3个地理黑绵羊群体,每个县均为20只,公母各半,提取血液基因组DNA,用PCR方法扩增线粒体DNA(mtDNA)D-loop序列并测序,统计试验黑绵羊D-loop序列的突变位点和单倍型,计算单倍型多样性(Hd)、核苷酸多样性(Pi)、平均核苷酸变异数(K)和Tajima’s D值,分析各群体之间的遗传距离,并基于遗传距离和单倍型构建系统进化树。结果表明:试验黑绵羊mtDNA D-loop序列有1 106,1 176,1 180,1 181,1 182 bp 5个长度类型,主要为1 180 bp、1 181 bp两种类型;存在101个不包括插入/缺失的变异位点;共有46种单倍型,其中8种为共享单倍型;不同群体的单倍型存在较大差异,Hd平均值为0.988,Pi平均值为0.016,K平均值为18.090,Tajima’s D平均值为-0.180 69;布拖黑绵羊与普格黑绵羊和盐源黑绵羊之间的遗传距离较远,而普格黑绵羊和盐源黑绵羊之间的遗传距离较近;3个地理黑绵羊群体分布在A、B两个支系中,其中有76.7%的个体分布在A支系。说明3个地理黑绵羊群体具有丰富的遗传多样性;它们之间的遗传距离较近,至少有两个母系起源;并且3个地理黑绵羊群体的mtDNA D-loop序列属于中性突变,表明凉山黑绵羊仅经历了自然选择,今后开展人工选择的空间极大,是一类亟待保护、值得开发的绵羊种群。

一带一路沿线国家马品种的系统进化研究

目的:旨在通过研究一带一路沿线国家马品种的系统进化树,由此探究其母系进化关系以及中国4个马品种(河曲马、乌审马、巴尔虎马、乌珠穆沁马)与其他马品种间的母系进化关系。方法:本研究对目前GenBank上登陆的一带一路沿线18个国家的22个马品种(俄罗斯2个品种、中国4个品种、其余16个国家各1个品种)的65匹家马的mtDNA D-loop区碱基序列进行系统发育分析。利用生物信息学软件DNAMAN4和Mega6.3,以邻接法(neighbor joining,NJ)构建了22个马品种的NJ系统进化树。结果:NJ树明显分出了2个分支,一个是由一带一路沿线大部分欧洲国家马品种聚成的分支,另一个是由一带一路沿线大部分亚洲国家马品种聚成的分支,这一结果具有明显的地理分布特征。结果还表明中国马品种中的河曲马和乌审马分在了亚洲分支,而巴尔虎马和乌珠穆沁马分在了欧洲分支。结论:从家马母系起源看,中国家马的母系起源可能具有两种或以上的母系起源;巴尔虎马和乌珠穆沁马是与欧洲家马品种有密切的母系起源,河曲马和乌审马是与亚洲家马品种有密切的母系起源。