16SrRNA基因测序技术在呼吸系统疾病与气道微生物中的研究进展

呼吸系统疾病是世界各地病死率较高的疾病之一,呼吸道病毒和细菌感染已经被确定为人口病死的主要原因。根据感染的区域不同,主要分为上呼吸道感染和下呼吸道感染两种类型。定植于健康人肺部的微生物群大多属于四个门类:厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门和变形菌门,它们与人体气道局部黏膜免疫系统相互作用共存,维持呼吸系统的免疫平衡与稳定。近年来,宏基因组学技术的发展为研究共生菌提供了可能性,随着SrRNA和基因测序技术的应用,微生物菌群与呼吸系统疾病之间的关系引起广泛的关注,也证明了呼吸系统疾病与呼吸道微生物菌群之间有着密不可分的关系,这不仅有助于呼吸系统疾病的诊断,而且为患者的治疗及预后提供方向。本文就目前关于呼吸系统疾病与气道微生物的相关研究在PubMed、中国知网、万方医学和维普医学上检索“呼吸系统疾病、16SRrRNA、慢性阻塞性肺疾病、哮喘、慢性咳嗽、囊性纤维化、气道微生物”等关键词,对相关文献进行回顾和总结并作简要综述。

慢性阻塞性肺疾病与气道微生物群关系的研究现状

慢性阻塞性肺疾病(COPD)已成为高患病率、高病死率的全球疾病负担之一。在传统的支气管舒张剂、糖皮质激素、抗生素等治疗措施之外,新的防治措施和治疗靶点亟待开发。近年来随着基因测序技术的发展,关于COPD气道微生物群的研究已取得较多进展。本文将从COPD气道微生物群的群谱特征及其与COPD的相关性,气道微生物群影响COPD发生、发展的作用机制,吸烟和糖皮质激素对COPD气道微生物群的影响以及微生物相关疗法在COPD治疗中的应用等几个方面进行综述,以期为COPD的预防和治疗提供基于微生物的靶向治疗新思路。

微生物组学在肺癌发生发展中的作用机制及研究进展

肺癌是我国最常见的、预后较差的恶性肿瘤之一,大多数患者确诊时即为晚期。有研究表明肺癌患者的微生态特征有别于健康人群,呼吸道的微生物可以通过多种机制影响肺癌的发生发展。近年来微生物组学与疾病相关性研究已成为继人类基因组计划又一研究热点,然而目前有关肺癌与呼吸道微生物组特征的研究相对较少,因此,需要更深入地探讨肺癌与微生物菌群间的潜在联系,通过研究呼吸道微生物在肺癌发生发展中的作用机制,以期在为肺癌的临床诊治、预后评估提供更明确的科学依据。本文对目前关于微生物菌群与肺癌相关研究进行综述,并为临床上诊断与治疗肺癌提供新的思路。

二代测序技术检测呼吸道非典型病原体应用进展

二代测序(next-generation sequencing,NGS)技术可以对患者样本中的微生物遗传物质进行综合分析,能更全面地检测病原微生物,目前正逐步应用于临床感染性疾病的病原体检测工作。特别是对于病原体复杂、传统病原学检测技术阳性率低的呼吸道非典型病原体感染,NGS技术因其检测全面、检出率高的优势逐渐在临床上推广使用。本文主要就NGS在呼吸道非典型病原体感染的病原学诊断、治疗指导和暴发调查等方面的应用进行综述。