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Disprot无序蛋白数据库分析与统计
被引量:
1
1
作者
张欢
李盘靖
王彤
《山东理工大学学报(自然科学版)》
CAS
2018年第6期67-70,共4页
无序蛋白是一种在天然条件下没有稳定的三维结构但却能正常行使重要生物学功能的一类蛋白质.实验以Disport无序蛋白数据库为基础,经过CD-HIT去重处理建立数据集.分别选择20种氨基酸在无序区与有序区中的分布和无序倾向性两个方面对该数...
无序蛋白是一种在天然条件下没有稳定的三维结构但却能正常行使重要生物学功能的一类蛋白质.实验以Disport无序蛋白数据库为基础,经过CD-HIT去重处理建立数据集.分别选择20种氨基酸在无序区与有序区中的分布和无序倾向性两个方面对该数据集进行对比分析.结果表明,氨基酸Ala、Asp、Glu、Gly、Lys、Pro、Gln、Ser具有形成无序区的倾向.氨基酸Leu、Thr、Val虽然在无序区和有序区中都具有倾向性,但在由DP值得到的分析中,Leu、Thr、Val不易于形成无序区;氨基酸Gln虽然在无序区和有序区中都不具有倾向性,但在DP值分析中却易于形成无序区.氨基酸Ala、Glu、Ser在二元组氨基酸对中使用最频繁.
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关键词
无序
蛋白
氨基酸无序倾向性
数据库分析
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职称材料
题名
Disprot无序蛋白数据库分析与统计
被引量:
1
1
作者
张欢
李盘靖
王彤
机构
山东理工大学计算机科学与技术学院
出处
《山东理工大学学报(自然科学版)》
CAS
2018年第6期67-70,共4页
文摘
无序蛋白是一种在天然条件下没有稳定的三维结构但却能正常行使重要生物学功能的一类蛋白质.实验以Disport无序蛋白数据库为基础,经过CD-HIT去重处理建立数据集.分别选择20种氨基酸在无序区与有序区中的分布和无序倾向性两个方面对该数据集进行对比分析.结果表明,氨基酸Ala、Asp、Glu、Gly、Lys、Pro、Gln、Ser具有形成无序区的倾向.氨基酸Leu、Thr、Val虽然在无序区和有序区中都具有倾向性,但在由DP值得到的分析中,Leu、Thr、Val不易于形成无序区;氨基酸Gln虽然在无序区和有序区中都不具有倾向性,但在DP值分析中却易于形成无序区.氨基酸Ala、Glu、Ser在二元组氨基酸对中使用最频繁.
关键词
无序
蛋白
氨基酸无序倾向性
数据库分析
Keywords
intrinsically disordered proteins
disorder tendency of amino acids
analysis of database
分类号
TP30 [自动化与计算机技术—计算机系统结构]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
Disprot无序蛋白数据库分析与统计
张欢
李盘靖
王彤
《山东理工大学学报(自然科学版)》
CAS
2018
1
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职称材料
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