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基于株高性状的玉米EST序列与水稻基因组的比较研究 被引量:3
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作者 严建兵 王毅 +3 位作者 汤华 黄益勤 李建生 郑用琏 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第7期657-667,共11页
从已公布的玉米分子标记中 ,挑选出均匀覆盖玉米全基因组、平均间距小于 10cM的 2 2 4个SSR和RFLP分子标记 ,从NCBI上查找这些标记所在的玉米EST或基因的原始序列 ,逐一与水稻数据库的序列信息进行同源性比较。结果表明 :在PN<1e 5... 从已公布的玉米分子标记中 ,挑选出均匀覆盖玉米全基因组、平均间距小于 10cM的 2 2 4个SSR和RFLP分子标记 ,从NCBI上查找这些标记所在的玉米EST或基因的原始序列 ,逐一与水稻数据库的序列信息进行同源性比较。结果表明 :在PN<1e 5水平上 ,从水稻数据库中共找到 16 939段同源序列 ,平均每段玉米的序列可以在水稻数据库中找到75 .6段同源序列 ;在PN<1e 10水平上 ,一共找到 785 3段同源序列 ,将其中 2 72 9段序列与水稻的物理图谱和分子标记连锁图进行比对定位 ,最终将 896段同源序列整合在水稻分子标记连锁图上 ,形成了在序列水平上的玉米和水稻的比较基因组图谱。基于这一图谱 ,对已定位的玉米和水稻株高QTL的分子标记进行了比较基因组的定位分析。 10个玉米株高QTL紧密连锁的 18个分子标记中有 10个标记在与之同源的水稻染色体区域也定位了控制水稻株高的QTL或基因 ,暗示有相当一部分控制玉米和水稻株高的QTL是同源的。但进一步的分析表明 ,玉米与水稻基因组的连续共线性区域可能低于预期估计 ;在此基础上提出了一种利用水稻基因组数据进行禾本科植物比较基因组 ,发掘新分子标记和克隆大基因组植物基因的策略。 展开更多
关键词 玉米 分子标记 比较基因组 水稻数据库
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Modeling Carbon Dynamics in Paddy Soils in Jiangsu Province of China with Soil Databases Differing in Spatial Resolution 被引量:9
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作者 XU Sheng-Xiang SHI Xue-Zheng +5 位作者 ZHAO Yong-Cun YU Dong-Sheng WANG Shi-Hang ZHANG Li-Ming C. S. LI TAN Man-Zhi 《Pedosphere》 SCIE CAS CSCD 2011年第6期696-705,共10页
A number of process-based models have been developed for quantifying carbon(C)sequestration in agro-ecosystems.The DeNitrification-DeComposition(DNDC)model was used to simulate and quantify long-term(1980-2008)soil or... A number of process-based models have been developed for quantifying carbon(C)sequestration in agro-ecosystems.The DeNitrification-DeComposition(DNDC)model was used to simulate and quantify long-term(1980-2008)soil organic carbon(SOC)dynamics in the important rice-producing province,Jiangsu,China.Changes in SOC storages were estimated from two soil databases differing in spatial resolution:a county database consisting of 68 polygons and a soil patch-based database of 701 polygons for all 3.7 Mha of rice fields in Jiangsu.The simulated SOC storage with the coarse resolution county database ranged between 131.0-320.6 Tg C in 1980 and 170.3-305.1 Tg C in 2008,respectively,while that estimated with the fine resolution database was 201.6 and 216.2 Tg C in 1980 and 2008,respectively.The results modeled with the soil databases differing in spatial resolution indicated that using the soil input data with higher resolution substantially increased the accuracy of the modeled results;and when lacking detailed soil datasets,the DNDC model,parameterized with the most sensitive factor(MSF) method to cope with attribute uncertainty,could still produce acceptable results although with deviations of up to 60% for the case study reported in this paper. 展开更多
关键词 1:1 000000 soil map C sequestration rate DeNitrification-DeComposition (DNDC) greenhouse gas soil organic carbon (SOC)
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