塑化剂邻苯二甲酸二丁酯与小牛胸腺DNA的沟槽结合

运用多种光谱学方法,结合化学计量学多元曲线分辨-交替最小二乘法(MCRALS),以及分子模拟技术,在人体生理酸度(pH=7.4)条件下研究了邻苯二甲酸二丁酯(DBP)与小牛胸腺DNA(ctDNA)的相互作用。采用MCR-ALS法分析了DBP与ctDNA作用的紫外光谱数据矩阵,结果表明DBP与ctDNA作用形成了DBP-ctDNA复合物。荧光猝灭实验显示,ctDNA对DBP的荧光猝灭属于形成复合物的单一静态猝灭,其主要驱动力为疏水作用和氢键。通过单双链、熔点和粘度等实验证明DBP与ctDNA发生了沟槽结合,结合区域为A、T碱基富集区。圆二色谱和琼脂糖凝胶电泳分析表明,DBP与ctDNA结合导致ctDNA结构变得更为松散,但未造成质粒DNA损伤。分子模拟形象直观地展现了两者的结合姿态,预测结果与实验结果吻合。

原儿茶酸与小牛胸腺DNA的沟槽结合

利用荧光光谱法和分子模拟技术,并结合DNA单双链、盐效应、熔点和粘度测量等实验,研究了生理酸度条件下(pH7.4)原儿茶酸与小牛胸腺DNA(ctDNA)的结合性质和结合模式。结果表明,ctDNA能够结合原儿茶酸,并通过静态方式猝灭原儿茶酸的内源荧光,两者的结合常数在103 L·mol^-1数量级,氢键和疏水作用是原儿茶酸与ctDNA结合的主要驱动力。原儿茶酸的加入没有明显改变ctDNA的熔点和粘度,单链ctDNA猝灭原儿茶酸荧光的能力大于双链ctDNA,并且NaCl浓度的增加对原儿茶酸-ctDNA复合物的荧光强度没有明显的影响,表明原儿茶酸与ctDNA主要通过沟槽模式结合。分子模拟显示原儿茶酸的结合位点在ctDNA的小沟区,且与碱基胸腺嘧啶(T)形成氢键。分子模拟结果进一步确证了二者之间的沟槽作用模式。

吡柔比星与c-myc G4-DNA相互作用的研究

目的研究吡柔比星与c-mycG4-DNA的相互作用．并探讨其可能的抗肿瘤作用机制。方法采用紫外可见吸收光谱、圆二色光谱（CD）、等温滴定微量量热试验（ITC）、核磁NMR滴定以及荧光能量共振转移（FRET）熔点试验等方法，研究吡柔比星与c-mycG4-DNA的相互作用；采用PCR-Stop方法研究吡柔比星对c-mycG4-DNA复制的抑制。结果在电子吸收光谱中，吡柔比星的特征吸收峰随c-mycG4-DNA浓度的增加出现明显的减色效应和红移，减色率AH=9．2％（△λ=4nm）；根据热力学计算的结合常数K11为1．0×10^4μmol／L；随着吡柔比星的加入pmycG4-DNA的圆二色光谱在265nrn处的信号变化均匀缓慢，在300nm处出现1个负的诱导信号：在吡柔比星作用下，c-mycG4-DNA5＇-末端表面碱基G21-A25发生明显变化，并且熔点升高20．2℃；PCR-Stop试验证实，随着吡柔比星浓度的增加，c-mycG4一DNA的复制能力不断减弱。结论吡柔比星能够以沟槽方式与c-mycG4-DNA相互作用，稳定c-mycG4-DNA四链体结构，并抑制其复制功能．吡柔比星抗肿瘤活性可能与它能够结合并稳定c-mycG4-DNA密切相关。

三元铜(Ⅱ)配合物Cu(IDA)(NBZIM)(H_2O)与DNA相互作用研究

采用紫外光谱法、荧光光谱法、粘度法及循环伏安法研究了三元铜(Ⅱ)配合物Cu(IDA)(NBZIM)(H_2O)(IDA=亚氨基二乙酸根,NBZIM=6-硝基苯并咪唑)与小牛胸腺DNA(CTDNA)的相互作用.紫外光谱研究表明,随着DNA的加入,配合物的紫外吸收呈现明显的减色效应,但未发生红移;荧光光谱研究发现,配合物对EB-DNA复合物的荧光有明显的淬灭作用;粘度试验中,配合物对DNA溶液的粘度未产生明显影响;电化学性质研究发现,随着DNA的加入,配合物循环伏安曲线中氧化峰和还原峰的峰电流都发生了明显的降低,但峰电势均未发生明显变化,这些试验结果表明该配合物与CT-DNA是以沟槽模式相结合的.

光谱法及分子模拟法研究杨梅素与ct-DNA的相互作用

采用紫外光谱、荧光光谱结合亚甲基蓝荧光探针(MB)、圆二色谱(CD)以及分子模拟等技术研究了生理条件下杨梅素与小牛胸腺DNA(ct-DNA)的相互作用,探索了其可能的结合位点与作用机制。热力学参数显示ΔH<0、ΔS<0,说明杨梅素与ct-DNA通过氢键和范德华力发生相互作用。光谱研究显示,ct-DNA能够猝灭杨梅素的内源荧光,猝灭方式为静态猝灭,两者的结合常数为1.86×103mol-1,结合位点数为1。在竞争性实验中杨梅素未能将MB从MB-DNA复合体系中游离出来,说明其与ct-DNA的作用方式为沟槽结合。圆二色光谱研究表明,杨梅素的加入未能破坏ct-DNA的双螺旋结构,两者的作用方式为沟槽结合。进一步通过分子模拟研究得到杨梅素与DNA结合的最低能量构象,杨梅素A环7-O和B环3’-O分别与DNA的碱基DA18和DA6在边缘小沟处通过氢键结合,周围富含碱基A和T,与光谱学研究结果一致,结合距离分别为2.061和1.918。

2,3-二氢-9,10-二羟基-1,4-蒽醌与DNA相互作用的电化学研究

合成了准刚性环化合物2,3-二氢-9,10-二羟基-1,4-蒽醌(DHHA),并用核磁共振谱、红外光谱和质谱确定了结构.循环伏安实验表明DHHA在玻碳电极上有一对明显的氧化还原峰,在加入DNA后,其氧化峰电位出现了正移,且峰电流出现了明显的降低,表明二者的作用模式可能为沟槽结合,当DNA浓度处于9.0×10–6mol/L-4.5×10–5mol/L之间时,DNA的浓度与氧化峰的电流强度具有良好的线性关系,所以,在此范围内可以对DNA进行定量检测.计时库仑实验、微分脉冲实验以及紫外-可见光谱实验都进一步证实DHHA与DNA的相互作用,且它们的作用模式可能为沟槽结合.

光谱法与共焦荧光成像法研究罗丹明B与ct-DNA的相互作用

采用吸收光谱、荧光光谱以及共焦荧光成像技术研究生理条件下罗丹明B(Rhodamine B,RB)与小牛胸腺DNA(ct-DNA)的相互作用以及相互作用模式。光谱研究结果显示,在450~650 nm的吸收光谱范围内,ct-DNA溶液对罗丹明B有减色作用;在560~660 nm荧光发射光谱范围内,ct-DNA对罗丹明B有荧光猝灭作用。同时,随着ct-DNA的加入,罗丹明B溶液的荧光偏振值发生变化,说明罗丹明B与ct-DNA能发生相互作用。在竞争性实验中,罗丹明B未能将亚甲基蓝(MB)从MB-ct-DNA复合体系中置换出来,说明罗丹明B与ct-DNA通过沟槽结合方式发生相互作用。共焦荧光成像结果显示,ct-DNA加入后,罗丹明B的荧光猝灭十分明显。利用罗丹明B和4',6-二脒基-2-苯基吲哚(DAPI)对He La细胞染色后进行共焦荧光成像,结果进一步证实罗丹明B与ct-DNA是通过沟槽结合作用将细胞核染成红色。

异咯嗪修饰富勒烯-聚丙烯酸的合成及其与DNA的相互作用

利用自由基聚合反应合成了聚丙烯酸修饰的富勒烯(C60-PAA),进一步通过酯化反应将核黄素类似物6,7-二甲基-9-(2′-羟乙基)-异咯嗪(DHIX)与C60-PAA共价连接,得到C60-PAA-DHIX.利用傅立叶红外光谱(FT-IR)、核磁共振氢谱(1HNMR)、紫外-可见吸收光谱(UV-Vis)、荧光光谱对产物的化学结构进行了表征.循环伏安法表明,C60-PAA-DHIX中富勒烯基团的第一还原电位要高于DHIX基团的第一还原电位.ESR实验表明C60-PAA-DHIX能与N,N-二甲基苯胺发生多步光诱导电子转移反应,即DHIX基团与N,N-二甲基苯胺发生光诱导电子转移生成DHIX负离子自由基(DHIX-.),DHIX-.能进一步将电子传递给富勒烯生成富勒烯负离子自由基.DNA熔解曲线、紫外-可见吸收光谱和荧光光谱结果表明,C60-PAA-DHIX通过沟槽结合与CTDNA作用,而C60-PAA与DNA的作用较弱.无氧条件下,C60-PAA-DHIX具有比C60-PAA更强的DNA光损伤能力.

洛美沙星与Al^(3+)及DNA相互作用的光谱研究

利用荧光和紫外光谱法研究了洛美沙星与Al3+及DNA的相互作用。实验结果表明,Al3+能够与洛美沙星(LMX)形成二元配合物,并且一定浓度范围内Al3+对DNA和LMX的结合具有明显的促进作用。讨论了LMX-Al(Ⅲ)配合物与DNA的结合机理,证实LMX-Al(Ⅲ)配合物通过沟槽结合的方式与DNA结合,为进一步研究洛美沙星药物的抗菌杀菌机理提供了参考依据。

诺氟沙星-Cu(Ⅱ)-DNA三元络合物的光谱

诺氟沙星(NFA)是一种具有荧光活性并通过抑制促旋酶成为抗菌谱广的药物。采用紫外-可见分光光度法和固定波长同步荧光光度法(CW-SFS)研究了NFA-Cu2+-DNA三元络合物体系,考查了各成分间的相互作用,并由测量数据计算得到结合常数。

咖啡酸与小牛胸腺DNA的相互作用

在生理酸度条件下(pH 7.4),运用紫外-可见吸收光谱、多元曲线分辨-交替最小二乘法(MCR-ALS)、圆二色谱(CD)、傅立叶红外光谱(FT-IR)并结合分子模拟,研究了咖啡酸(CA)与小牛胸腺DNA(ctDNA)的相互作用。实验结果表明,CA与ctDNA的结合未引起ctDNA的熔点和粘度产生明显变化,NaCl浓度的增加,对CA-ctDNA体系紫外吸光度无明显影响,且单链DNA与CA的结合常数大于双链DNA,表明二者是以沟槽方式结合。计算出的热力学参数表明,疏水作用是CA与ctDNA相互作用的主要驱动力。FT-IR和分子模拟结果显示,CA主要与胸腺嘧啶(T碱基)结合。CD光谱分析结果表明,CA诱导ctDNA构象发生由B型向A型转变。

光谱法研究铜配合物Cu(ODA)(NBZIM)(H_2O)与DNA的相互作用

通过紫外光谱和荧光光谱法研究了三元铜配合物Cu(ODA)(NBZIM)(H_2O)(ODA=一缩二乙醇酸,NBZIM=6-硝基苯并咪唑)与小牛胸腺DNA(CT-DNA)之间的相互作用。紫外光谱研究中,随着DNA的加入,配合物的紫外吸收呈现明显的减色效应,但未发生红移;荧光光谱研究中,EB-DNA复合物的荧光随着配合物的加入而明显的猝灭。实验结果表明配合物Cu(ODA)(NBZIM)(H_2O)与CT-DNA之间的相互作用模式为沟槽结合。

光谱法研究氧氟沙星-铽络合物与脱氧核糖核酸的相互作用

以氧氟沙星 铽 (Tb3+ )作为荧光探针 ,利用荧光光谱、吸收光谱研究了氧氟沙星 铽 (Tb3+ )络合物与脱氧核糖核酸 (DNA)的相互作用。研究表明 :在实验条件下 ,脱氧核糖核酸能显著增强氧氟沙星 Tb3+ 体系的荧光 ,据此建立了脱氧核糖核酸的测定方法 ,线性范围为 5 .0× 1 0 - 6 ～ 1 .0× 1 0 - 4mol L ;检出限为 1 .7× 1 0 - 6mol L,通过人血清中DNA测定的回收率实验 ,结果令人满意。实验还表明 :氧氟沙星 Tb3+ 探针与DNA分子之间主要是沟槽式结合。

负电荷生物染料氨基黑10B与DNA相互作用机理的研究

采用电子吸收光谱、粘度测定和电化学等方法研究了氨基黑10B(AB)与鲱鱼精DNA在B-R缓冲溶液中的相互作用。电子吸收光谱实验表明,DNA的加入能引起AB在618 nm处的最大吸收峰出现增色效应,说明二者的结合不属于典型的静电或嵌插结合模式,而可能通过沟槽方式结合,且伴随有氢键作用。粘度法实验证实了这一结果。电化学实验进一步表明DNA的加入能引起AB分子的扩散速率降低,从而导致AB的氧化峰电流出现减小。同时考察了AB与DNA结合前后的电子转移速率,结果表明AB与DNA之间形成了一种非电活性的超分子复合物。

厚朴水提物与大肠杆菌基因组DNA的结合方式

利用荧光光谱、紫外-可见光谱、离子强度试验及DAPI-大肠杆菌DNA竞争性分析方法对生厚朴和姜厚朴水提物与大肠杆菌基因组DNA的作用方式进行研究。结果显示:加入DNA后姜厚朴和生厚朴水提物最大吸收峰的荧光强度出现淬灭;紫外-可见光谱显示水提物-DNA体系在305～325 nm内均衡存在,同时随着大肠杆菌DNA浓度的增加,姜厚朴和生厚朴水提物的吸光度值逐渐增大,发生增色效应;水提物-大肠杆菌DNA体系的荧光强度随NaCl浓度的增大而增加,说明厚朴及姜厚朴水提物与大肠杆菌DNA可能发生静电作用和/或沟槽作用;在竞争性试验中,加入厚朴及姜厚朴水提物后,荧光扫描图谱显示DAPI-大肠杆菌DNA体系出现减色效应。姜厚朴及生厚朴水提物与大肠杆菌DNA间通过沟槽结合的方式相互作用并生成非荧光型复合物。

沙丁胺醇与小牛胸腺DNA相互作用研究

在生理酸度条件下(pH7.4),运用紫外–可见吸收光谱、荧光光谱、圆二色谱(CD)和傅立叶红外光谱(FT–IR)并结合分子模拟、DNA熔点及粘度测定,研究了沙丁胺醇(Sal)与小牛胸腺DNA(ctDNA)的相互作用。结果表明,ctDNA以静态方法猝灭Sal的内源荧光,25℃时ctDNA与Sal的结合常数为1.26×104L·mol,氢键和范德华力是两者结合的主要驱动力。Sal存在下,ctDNA的熔点无明显变化,KI荧光猝灭效应和盐效应不明显,证实Sal与ctDNA主要通过沟槽模式结合。FT-IR与分子模拟结果显示,Sal倾向于与ctDNA的胸腺嘧啶(T碱基)结合。CD和凝胶电泳分析表明,Sal与ctDNA结合没有对DNA产生明显损伤,DNA仍维持B型构象。

光谱法研究替诺昔康与小牛胸腺DNA相互作用

目的研究替诺昔康与小牛胸腺DNA(ctDNA)之间的相互作用。方法借助紫外光谱和荧光光谱考察了替诺昔康与ctDNA之间的相互作用,同时通过热变性研究、黏度法试验考察了替诺昔康与ctDNA的相互作用模式。结果ctDNA加入使替诺昔康紫外光谱出现轻微减色效应,且随着ctDNA浓度的增大,减色效应变强;替诺昔康的加入使ctDNA-盐酸小檗碱发生荧光猝灭,且其猝灭程度具有浓度相关性。替诺昔康对于ctDNA溶液的黏度和热变性温度影响不大。结论替诺昔康与ctDNA是以沟槽方式结合,并且替诺昔康可以使ctDNA-盐酸小檗碱发生静态荧光猝灭。