河北白鹅线粒体DNA D-loop序列遗传多样性分析

为了更好地保护和利用河北省地方品种——河北白鹅的遗传资源,试验采用PCR和测序技术对30只河北白鹅的线粒体DNA(mtDNA)控制区(D-loop)序列进行研究,并与GenBank中公布的家鹅品种mtDNA D-loop序列进行比对,分析河北白鹅mtDNA D-loop的遗传多样性及起源。结果表明:河北白鹅mtDNA D-loop序列中碱基A、C、G和T的含量分别为29.44%、28.96%、15.68%、25.92%,并检测到1个变异位点,组成H1、H2两种单倍型,平均核苷酸差异为0.494,核苷酸多样度为0.000 79,单倍型多样度为0.494。河北白鹅单倍型H1与丰城鹅、永康灰鹅、籽鹅、太湖鹅和鸿雁聚为一类,河北白鹅单倍型H2与莱茵鹅、伊犁鹅聚为一类。说明河北白鹅遗传多样性较低,单倍型H1起源于鸿雁,单倍型H2与伊犁鹅等亲缘关系较近。

河北白鹅线粒体全基因组结构及其起源进化分析

为了研究河北白鹅线粒体基因组结构及起源,试验采用直接测序或克隆测序对河北白鹅mt DNA基因组序列进行分析。结果表明：河北白鹅线粒体全基因组长为16 667 bp,其中包括13个编码蛋白质基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和1个系列控制（D-loop）区。经过系统发育分析可知河北白鹅起源于鸿雁。