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泉生热袍菌结构基因组的选靶研究
1
作者
裴剑锋
来鲁华
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2005年第5期499-503,共5页
对泉生热袍菌进行了结构基因组的选靶研究,从泉生热袍菌的蛋白组中挑选了20个蛋白质作为第一批进行结构测定的目标,以发现新的蛋白质折叠模式.选靶研究主要使用了BLAST搜索,PSI-BLAST搜索和ProtoNet数据库搜索等方法.另外,还用PredictPr...
对泉生热袍菌进行了结构基因组的选靶研究,从泉生热袍菌的蛋白组中挑选了20个蛋白质作为第一批进行结构测定的目标,以发现新的蛋白质折叠模式.选靶研究主要使用了BLAST搜索,PSI-BLAST搜索和ProtoNet数据库搜索等方法.另外,还用PredictProtein程序对选中的蛋白质进行了二级结构和外形预测.选中的20个蛋白质中有8个被克隆、表达和纯化,其中2个得到了单晶并收集了X衍射数据.实验结果和最近一些文献报道的结果表明,挑选的一些蛋白质具有新的折叠模式,表明了这种选靶策略的有效性.
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关键词
泉生热袍菌
结构基因组
选靶
蛋白质结构
BLAST
PSI-BLAST
ProtoNet
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职称材料
题名
泉生热袍菌结构基因组的选靶研究
1
作者
裴剑锋
来鲁华
机构
北京大学化学与分子工程学院分子动态与稳态结构国家重点实验室
北京大学理论生物学中心
出处
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2005年第5期499-503,共5页
文摘
对泉生热袍菌进行了结构基因组的选靶研究,从泉生热袍菌的蛋白组中挑选了20个蛋白质作为第一批进行结构测定的目标,以发现新的蛋白质折叠模式.选靶研究主要使用了BLAST搜索,PSI-BLAST搜索和ProtoNet数据库搜索等方法.另外,还用PredictProtein程序对选中的蛋白质进行了二级结构和外形预测.选中的20个蛋白质中有8个被克隆、表达和纯化,其中2个得到了单晶并收集了X衍射数据.实验结果和最近一些文献报道的结果表明,挑选的一些蛋白质具有新的折叠模式,表明了这种选靶策略的有效性.
关键词
泉生热袍菌
结构基因组
选靶
蛋白质结构
BLAST
PSI-BLAST
ProtoNet
Keywords
thermoanaerobacter tengcongensis
structural genomics
target selection
protein structure
BLAST
PSI-BLAST
ProtoNet
分类号
Q933 [生物学—微生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
泉生热袍菌结构基因组的选靶研究
裴剑锋
来鲁华
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2005
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