基于TMT和PRM技术的湿性年龄相关性黄斑变性泪液蛋白质组学研究

目的研究未经诊治湿性年龄相关性黄斑变性(age related macular degeneration, AMD)患者的泪液蛋白质组学,绘制蛋白质图谱,筛选差异表达蛋白以鉴定潜在的生物标志物。方法以2017年7月至2018年3月于重庆医科大学附属第二医院眼科门诊就诊的33例未经诊治湿性AMD(nAMD)患者和同时期及地点的30例排除眼底疾病的正常老年人泪液为对象,采用串联质谱标签法(tandem mass tag, TMT)对鉴定两组样本的差异表达蛋白进行定量,对所鉴定的差异表达蛋白进行生物信息学分析,并筛选出有潜在研究前景的候选蛋白,并使用平行反应监测(parallel reaction monitoring, PRM)技术靶向验证候选蛋白在人群泪液nAMD中的表达情况。结果通过TMT相对定量蛋白质组学从未经诊治的湿性AMD患者和正常老年人的泪液中共定量到3 473个蛋白质,其中包含差异表达蛋白382个(122种蛋白上调,260种蛋白下调,P<0.05),通过GO功能富集分析和KEGG通路富集分析发现这些差异表达蛋白主要参与免疫反应和氧化应激的调节。选择MAOA、Transaldolase和LAMP-2作为潜在的生物标记物,并通过PRM成功验证到这3个候选蛋白的表达情况与TMT定量蛋白质组结果一致。结论采用TMT相对定量结合PRM靶向验证技术能有效地筛选出湿性AMD与正常人泪液中的382个差异蛋白,并验证提供3种潜在的生物标记物。

关注泪液蛋白质组学研究在眼表疾病中的临床意义和应用

研究显示泪液是一种非常有价值的体液，可用于眼表疾病的生物标志物的检测。我们系统评述包括干眼、睑缘炎、变态反应性结膜炎、圆锥角膜、感染性角膜炎、结膜松弛症、TAO等眼表疾病泪液蛋白质的变化，并分析了糖尿病、眼表外伤及屈光手术后、长期佩戴眼表角膜接触镜、长期局部使用青光眼药物对眼表泪液蛋白质的影响，希望眼科医师了解泪液蛋白质在各种眼表疾病状况下的特异性变化，为这些疾病的优化治疗提供有用线索。

关注泪液蛋白质组学研究在眼表疾病中的临床意义和应用

目的近年来,基因工程得到了快速的发展,蛋白质组学的研究也引起了人们的高度重视,已经成为了一门备受关注的新型学科,加强蛋白组织学的研究在临床各种疾病的诊断和治疗中具有重要的指导作用,是改善疾病预后的重要途径。本文就泪液蛋白质组学研究在眼表疾病中的临床意义和应用进行综述,旨在为相关研究人员提供重要的参考。