基于自然语言处理进行新冠肺炎确诊患者流行病学史的变化趋势分析的探索

目的:探讨陕西省自1月23日以来确诊患者接触史的变化趋势,以及不同时期应关注的重点场所。验证自然语言处理和大数据分析技术在流行病学史分析中应用的可行性。方法:收集陕西省2020年1月23日至2月20日卫健委公布的疫情数据,应用自然语言处理技术对确诊患者情况进行分词处理,计算每日的热点词语出现频率并排序。通过对词频和共词频率的统计,分析确诊患者的流行病学史变化趋势。结果:陕西省自1月23日起,前8日确诊患者描述中,标志着输入性疫情的"返回"等词频较高;自第9日起,标志以家庭为主要场所的聚集性疫情的各类"亲属关系"词频显著提高;第14日开始,体现其他场所的聚集性疫情的词汇频率明显提升。发病地区词频较高的为:西安市、安康市等;与陕西确诊病例相关的外省市地区词频较高为武汉/湖北、孝感市和杭州市。结论:通过词频分析可以发现陕西省疫情由输入性转向聚集性的转折点大致发生在2月1日。家庭作为聚集场所的传播方式为主要传播方式,后期有其他传播场所值得关注。本研究也验证了使用自然语言处理和词频分析等大数据分析技术可以在经典的流行病学史分析基础上,拓展新的思路,呈现新的表达方式。

发热伴意识不清，勿忘询问流行病学史

在发热原因待查病例中，有部分患者会伴有意识障碍，常见的疾病包括病毒性脑炎、细菌性脑炎、真菌性脑炎、结核性脑炎等，以及狂犬病、神经梅毒、艾滋病等特殊传染性疾病，此外，我们还容易漏诊一种疾病——疟疾。病例摘要患者，男，55岁，汉族。主诉“间断发热、呕吐1月，意识不清2天”由当地医院转入我科。患者于1个月前出现间断发热、呕吐胃内容物，无咳嗽、咯痰，无腹痛、腹泻，意识清楚，当时未予重视。4月26日，患者无明显诱因出现乏力，伴有发热，体温最高38.5℃，无其他不适，于当地诊所输液后体温恢复正常（具体用药不详），27日开始出现恶心、呕吐，呕吐物为胃内容物。

详细询问流行病学史,避免漏诊炭疽病

2021年8月9日,北京市疾控中心通报1例外地来京就诊的肺炭疽病例,患者来自河北省承德市围场满族蒙古族自治县,在当地有牛、羊及其制品接触史,发病4天后由救护车转运来京就诊。8月12日,山西省吕梁市文水县又报告陆续有9名村民出现四肢丘疹,继而变为水泡、溃破结痂变黑,且有水肿、淋巴肿等相似症状,9人均从事肉牛饲养、屠宰和贩卖工作,初步判断为皮肤炭疽病例。目前,全国已有河北承德、山西吕梁、山东滨州三地出现了炭疽确诊病例,且根据国家卫健委疾病预防控制局官网数据显示,7月份我国报告了炭疽病例66例。

基于门诊医生站新冠肺炎流行病学史调查的设计与实现

目的借由医院信息化系统配合实现新冠肺炎疫情期的流行病学史调查。方法根据《新型冠状病毒肺炎诊疗方案》对门诊医生站系统进行嵌入式流程改造,实现对就诊患者的快速流行病学史调查工作,完成相关内容的快速录入。结果截止到目前为止,完成来院患者176 076人流行病学史调查,其中潜在疑似患者有247人。结论通过门诊医生站系统改造强制就诊环节进行流行病史的调查和录入,对病患及时分诊以及院内二次感染防控具有积极意义。

对新入院病人精准采集疑似新型冠状病毒肺炎流行病学史的策略探讨

自2019年12月以来,武汉陆续发现多例新型冠状病毒肺炎病人,随后疫情不断蔓延,我国其他地区也相继出现了此类病例。2020年2月11日,世界卫生组织正式将造成武汉肺炎疫情的新型冠状病毒命名为SARS-CoV-2。SARS-CoV-2是一种从未在人类中发现的新型冠状病毒,其引发的新型冠状病毒肺炎传播迅速广泛,传染性强,人群普遍易感。

突发疫情下住院患者流行病学史精准化筛查的实践研究

目的在突发疫情期间,探索利用信息化技术对住院患者流行病学史进行实时精准化筛查。方法依托医院现有的个人数字助手(PDA),完成患者及陪护人员的流行病学史筛查及信息汇总流程。比较系统改进应用前后住院患者流行病学史筛查人均耗时、3小时内流行病学史筛查完成率、当日住院患者流行病学史漏筛率、护士满意度等指标。结果信息系统应用后,住院患者流行病学史筛查人均耗时明显缩短,3小时内流行病学史筛查完成率较之前明显提高,当日住院患者流行病学史漏筛率降低,护士满意度提高,差异均有统计学意义(P<0.01)。结论基于信息化技术可以实现住院患者流行病学史在突发疫情期间的快速、动态、精准化筛查,提高护士工作效率及满意度,提升医院疫情防控的管理效率及应对能力。

2016年深圳市宝安区抗-HCV阳性病例流行病学史分析

目的分析2016年深圳市宝安区各医疗机构报告丙型肝炎(简称丙肝)病毒(HCV)抗体阳性病例流行病学史,探寻宝安区防控丙肝疫情的针对性措施。方法利用《丙型肝炎病例报告表》收集抗-HCV阳性病例,分析基本人口学资料、实验室检测原因、流行病学史等内容。结果 2016年共报告抗-HCV阳性病例849例,全年散在发病。男女性别比1.70∶1。年龄集中在20~55岁(占83.86%)。职业以家务及待业、工人、商业服务为主(占81.15%)。深圳户籍占16.96%。丙肝无关联检测占80.21%,主动检测占9.31%。完整收集流行病学史的545例病例中既往流行病学史占比前5位:有手术史(占33.76%)、口腔诊疗史(占24.22%)、接受过血液或血液制品史(占23.12%)、不安全注射史(占22.75%)、有创操作史(占15.41%),同时存在性别、年龄差异(P<0.05)。结论在宝安区丙肝防控工作中,应加大防控丙肝医源性感染的力度,加强人群丙肝健康教育的针对性以促进感染高风险人群主动检测。

中国人群布鲁氏菌病流行病学史及临床表现的系统评价和meta分析

目的研究中国人群中布鲁氏菌病(简称布病)的流行病学史、临床表现及误诊情况。方法检索PubMed、EMBASE、MedLine、CNKI、万方数据库和维普数据库,截至2019年2月,收集关于布病流行病学史、临床表现及误诊情况的文献研究,统计分析采用R软件。结果检索文献中最终纳入83篇,共7 885例患者,78.03%患者有羊、牛等动物密切接触史;患者发热症状的发生率为84.58%(95%CI:83.76%~85.37%),关节疼痛为63.87%(95%CI:62.78%~64.95%),肌肉痛为63.45%(95%CI:61.81%~65.07%)。其中成人布病患者中发热症状的发生率为93.53%(95%CI:91.51%~95.19%),多汗为72.00%(95%CI:68.51%~75.30%),关节疼痛为64.82%(95%CI:61.27%~68.26%);儿童布病患者中发热症状的发生率为91.85%(95%CI:89.10%~94.09%),乏力为53.31%(95%CI:47.65%~58.91%),多汗为49.77%(95%CI:44.98%~54.57%);布病患者就诊误诊率非牧区(70.80%)高于牧区(33.70%)。结论通过了解中国人群布病的流行病学史,掌握不同年龄段布病患者临床表现间的差异,可提高布病的诊断水平,减少误诊,并可及早开展治疗。

北京部分SARS临床诊断病例流行病学接触史与IgG抗体水平关系分析

目的 通过对 30 2名SARS临床确诊病人的血清抗体IgG检测结果进行分析 ,探讨流行病学接触史与血清抗体阳性率之间的相关性 ,以及接触史在临床诊断中的意义。方法 样品为北京市疾病预防控制中心在SARS流行期内采集的住院的和康复的SARS临床确诊病人的血清 ,按照流行病学接触史分组分析。采用ELISA抗体检测方法检测抗SARS病毒IgG。 结果 有流行病学接触史组的血清抗体阳性率与无接触史组具有显著差异。结论 流行病学接触史对SARS病例的诊断具有重要意义。在SARS临床诊断过程中应综合流行病学资料、实验室IgG检测结果和临床症状进行诊断。

基于EM算法和流行病学史数据的COVID-19传播模式分析

2019年12月中国发现一种新型冠状病毒,后被命名为COVID-19.目前,大量的研究都集中在COVID-19确诊病例数据的建模分析.然而,信息含量更加丰富的流行病史数据却没有得到很好地分析.流行病史数据包含每个感染个体的接触史信息,能够更加全面地反映病毒的传播特征.但是,流行病学史数据中也存在一定的数据缺失,为建模分析带来挑战.本研究以分支过程为基础,建立带有异质性的病毒传播模型来分析流行病学史数据.利用EM算法来处理流行病学史数据中的常见的数据缺失现象.我们通过模拟数据集验证了EM算法的有效性,并将新方法应用于分析实际的数据(来源于公开数据),得出了新的COVID-19传播特征信息.

疑似新冠肺炎患者临床与流行病学特征分析

目的研究疑似新型冠状肺炎患病毒者的临床与流行病学特征。方法以2020年1月21日-2月16日新疆医科大学第一附属医院发热门诊接诊并符合疑似新冠肺炎的患者162例为研究对象,根据国家卫生健康委员会颁布的第6版《新型冠状病毒肺炎诊疗方案》及新冠病毒核酸初筛结果分为确诊组和疑似组,比较两组患者流行病学、临床表现、实验室指标及肺部CT特征的差异。结果162例疑似患者中,确诊为患者3例(1.85%)。疑似组中有104例(65.41%)患者有异地旅居史或密切接触史,确诊组中2例(66.67%)有武汉旅居史,1例(33.33%)有四川旅居史。疑似组患者的主要临床表现为发热(79.25%)、咳嗽(47.80%)、乏力(42.14%),确诊组患者主要临床表现为发热(66.67%)、乏力(33.33%)。两组患者血液指标(白细胞计数、淋巴细胞计数、中性粒细胞计数、血红蛋白、血小板、谷丙转氨酶、谷草转氨酶、白介素-6)差异无统计学意义(P>0.05)。与疑似组比较,确诊组患者血液中降钙素原水平降低,差异有统计学意义(P<0.05)。确诊组患者肺部CT以外带渗出样改变为主(66.67%),疑似组患者肺部CT异常改变128例(80.50%),其中双肺病变76例(47.80%),多发病变85例(53.46%),渗出样病变107例(67.30%)。疑似组患者中47例转往专科病区诊治(29.56%),112例居家医学观察14 d(70.44%),经随访目前体温均恢复正常,不适症状得以改善,预后良好。结论新冠肺炎的临床表现及影像学表现多样,易漏诊及误诊,精准诊断需依赖流行病学、临床表现、核酸检测、实验室检查及肺部CT的综合判断。

2004年唐山市布鲁氏菌病流行病学调查分析

目的 :了解 2 0 0 4年唐山市布鲁氏菌病现状。方法 :结合临床症状、流行病学史及实验室诊断 ,对本年发生的 9例布鲁氏菌病人及密切接触者进行流行病学调查及分析。结论 :在我市主要传染源主要为病羊 ,羊种布鲁氏菌型为主要病原体 ,病人分布带有明显的职业特征。

2010年～2015年成人麻疹流行病学及临床表现分析

麻疹是近10年来常见的主要在儿童中流行的出疹性急性呼吸道传染病，由于流行病学史的变迁，使成人麻疹的发病率占了一定的比例。本文回顾了（2011-2015）年以来，我院收治的成人麻疹患者的流行病学及临床表现，现分析如下。

15748例体检者丙型肝炎病毒感染流行病学调查

丙型肝炎病毒（HCV）属黄病毒科,有6种主要基因型及多种不同亚型,感染途径以血液接触为主,以及性接触和垂直传播。HCV基因组为单股正链RNA,复制所依赖的多聚酶缺乏校对功能,对环境适应性强,以逃避宿主免疫监视作用,易发生突变。HCV感染后隐匿性强,多数人长时间无明显临床症状,但病毒持续损害肝脏细胞,病变进行性发展,导致肝硬化、肝细胞癌的发生。本文通过对15748例体检者中HCV感染情况、分子生物学检测结果及流行病学史进行调查分析,为丙型肝炎防治提供参考资料。

流行性腮腺炎的诊治策略——抗病毒、对症治疗,防治并发症

[诊断标准]临床诊断：流行病学史结合症状体征确诊：血清学及病原学检测流行病学史发病前2-3周有与流行性腮腺炎患者接触史或当地有本病流行。 症状体征①腮腺或其他唾液腺非化脓性肿胀，含食酸性食物胀痛加剧。②剧烈头痛、嗜睡、呕吐、脑膜刺激征阳性，脑脊液呈非化脓性改变（与其他病毒性脑膜炎相似）。③恶心、呕吐，伴中上腹部疼痛与压痛，局部肌紧张。④睾丸肿痛（常为单侧）。

SARS早期影像学表现及鉴别诊断

SARS是一种新的冠状病毒（coronavinis）引起的具有较强的传染性，发病急，症状重，严重威胁人体健康和生命的疾病。目前，该病的诊断还是依据流行病学史，临床表现，实验室，影像学检查以及治疗情况等进行综合诊断。胸部影像学检查在SARS的诊断，病情监测、治疗和出院判断中是非常重要的指标。尤其是在诊断中起着至关重要的作用，因影像学检查不妥当或因对其影像表现不熟悉而误诊或漏诊，造成交叉感染或疫情扩散已有报道。因此如何安全快速完成胸部影像学检查准确快速做出胸部影像学判断，

流行性脑脊髓膜炎诊断要点

疑似病例的诊断 ①有流脑流行病学史：冬春季节发病（2～4月为流行高峰），1周内有流脑病人密切接触史，或当地有本病发生或流行；既往未接种过流脑菌苗。②临床表现及脑脊液检查符合化脓性脑膜炎表现。

1例输血性恶性疟病例实验室诊断与流行病学分析

目的通过对1例输血性恶性疟病例实验室诊断和流行病学分析,为当地输入疟疾防治提供科学依据。方法收集和分析患者病历资料、流行病学资料以及供血者流行病资料;对患者血样进行疟原虫镜检、疟疾快速试纸条(RDT)和巢式PCR方法检测。结果患者无外出史、无疟疾既往病史、有输血史,外周血涂片查见恶性疟原虫,RDT为单一恶性疟阳性,巢式PCR为恶性疟阳性;随访给患者供血者,有境外疟疾流行区外出史和疟疾既往病史,血样RDT为单一恶性疟原虫阳性,但疟原虫镜检阴性。结论该患者为输血引起的恶性疟病例,建议相关部门加强献血者献血时疟疾筛查工作,以避免类似因输血引起的疟疾病例发生。

云南省首例输入性寨卡病毒病病例流行病学调查及病原分子特征分析

目的 对云南省首例输入性寨卡病毒病病例进行描述性流行病学分析以及实验室检测结果分析,为防控输入性传染病疫情提供参考。方法 对2019年云南省首个输入性寨卡病毒病病例进行流行病学调查与处置,并对病例的血清和尿液标本进行核酸检测;同时对病例标本进行高通量测序,测序结果在CLC Genomics Workbench软件上进行分析拼接,最后利用Mega软件进行病毒基因分子特征分析和系统进化树构建及同源性分析。结果 该病例回国前在缅甸有发热、头痛和眼眶疼痛的症状,入境后核酸检测结果显示寨卡病毒阳性。系统发育树显示该云南寨卡病毒株属亚洲系东南亚流行分支,基因同源性分析表明该寨卡病毒株与东南亚、太平洋和美国寨卡病毒株的同源性在97.3%~99.1%。该寨卡病毒具有139N、982V、2634M的基因分子特征。结论 2019年7月云南省首例输入性寨卡病毒病病例的寨卡病毒株属于亚洲系东南亚分支。该病例于缅甸感染,其流行病学调查结果与实验室诊断结果一致。云南与东南亚接壤,面临着巨大的新发再发传染病输入风险,全省应加强边境传染病监测与检测工作。