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运用COBRA方法研究聚球藻代谢网络
1
作者
赵圆圆
付子爔
申铁
《贵州师范大学学报(自然科学版)》
CAS
2019年第3期67-71,83,共6页
生物过程的系统级建模和模拟,在定量和动态获得细胞功能方面具有指导作用。利用基于约束的代谢网络分析方法在计算机中模拟细胞代谢,分析聚球藻代谢网络的基本拓扑结构和网络内在联系。通过对代谢网络中的反应进行逐一删除,使用FBA和FV...
生物过程的系统级建模和模拟,在定量和动态获得细胞功能方面具有指导作用。利用基于约束的代谢网络分析方法在计算机中模拟细胞代谢,分析聚球藻代谢网络的基本拓扑结构和网络内在联系。通过对代谢网络中的反应进行逐一删除,使用FBA和FVA方法分析敲除反应后的代谢网络的流量分布,以及该反应的敲除对其余反应的影响,并找到代谢网络中对整个系统有影响的反应,进一步验证其网络理论和模型方法的可行性。
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关键词
基于约束的重建和
分析
方法
流量
平衡
分析
流量可变性分析
代谢网络
聚球藻
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职称材料
题名
运用COBRA方法研究聚球藻代谢网络
1
作者
赵圆圆
付子爔
申铁
机构
贵州师范大学贵州省信息与计算科学重点实验室
出处
《贵州师范大学学报(自然科学版)》
CAS
2019年第3期67-71,83,共6页
基金
国家自然科学基金(No.31460233)
文摘
生物过程的系统级建模和模拟,在定量和动态获得细胞功能方面具有指导作用。利用基于约束的代谢网络分析方法在计算机中模拟细胞代谢,分析聚球藻代谢网络的基本拓扑结构和网络内在联系。通过对代谢网络中的反应进行逐一删除,使用FBA和FVA方法分析敲除反应后的代谢网络的流量分布,以及该反应的敲除对其余反应的影响,并找到代谢网络中对整个系统有影响的反应,进一步验证其网络理论和模型方法的可行性。
关键词
基于约束的重建和
分析
方法
流量
平衡
分析
流量可变性分析
代谢网络
聚球藻
Keywords
COBRA Toolbox
FBA
FVA
metabolic network
Synechococcus
分类号
TP391.9 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
运用COBRA方法研究聚球藻代谢网络
赵圆圆
付子爔
申铁
《贵州师范大学学报(自然科学版)》
CAS
2019
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