浙贝碱与DNAG-四链体复合物的分子动力学模拟研究

目的:探讨浙贝碱与平行型DNA G-四链体的结合特征,为发展新型DNA G-四链体稳定剂提供理论基础。方法:采用分子对接方法确定浙贝碱在平行型DNA G-四链体中的初始结合位置,通过动力学模拟寻找平衡结构。结果:浙贝碱能够选择性的作用于平行型DNA G-四链体的沟槽与loop共同形成的位点,并在动力学过程中稳定存在。结论:浙贝碱作为一种非平面非共轭结构的天然小分子可选择性结合于DNA G-四链体的沟槽位点,有望发展为新型以端粒DNA G-四链体为靶点的抗肿瘤药物。