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不同感染复数下海洋蛭弧菌DA5对溶藻弧菌的控制效率
被引量:
4
1
作者
陆友云
温崇庆
+6 位作者
李志桦
刘杨锋
邹乐诗
梁栩云
陈国权
黄子靖
薛明
《广东海洋大学学报》
CAS
2018年第2期30-36,共7页
【目的】研究宿主菌密度和感染复数对海洋蛭弧菌捕食弧菌效率的影响。【方法】以溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)zouA(下称"zouA")为宿主,通过海水共培养实验研究海洋蛭弧菌菌株DA5(下称"DA5")在初始宿主密度10~3~1...
【目的】研究宿主菌密度和感染复数对海洋蛭弧菌捕食弧菌效率的影响。【方法】以溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)zouA(下称"zouA")为宿主,通过海水共培养实验研究海洋蛭弧菌菌株DA5(下称"DA5")在初始宿主密度10~3~10~8 cfu/mL下24 h的生长,评估低感染复数和高感染复数下DA5对zouA 10 d的生物控制效果。【结果】DA5捕食所需最低zouA密度约为5×10~5 cfu/mL;在zouA密度≥10~6 cfu/mL时,DA5方对其发挥控制效应,且感染复数越高捕食效率越高,即使感染复数低至0.001,一定时间后DA5亦可有效控制zouA数量。而当初始zouA密度低至10~4 cfu/mL时,DA5需在感染复数≥100条件下方可显著控制zouA。【结论】宿主密度与感染复数均影响海洋蛭弧菌DA5对溶藻弧菌的控制效果。
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关键词
海洋蛭弧菌
溶藻
弧菌
宿主密度
感染复数
生物控制
下载PDF
职称材料
海洋蛭弧菌DA5全基因组测序及序列分析
2
作者
陆友云
薛明
+1 位作者
李志桦
温崇庆
《热带海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第6期112-119,共8页
为深入挖掘和利用海洋蛭弧菌及其基因资源,本研究利用IlluminaHiSeq测序平台对一株属于嗜盐噬菌弧菌(Halobacteriovorax)的海洋蛭弧菌DA5进行了全基因组测序,对基因组进行组装、基因预测和功能注释,并与其他8株蛭弧菌进行了比较基因组...
为深入挖掘和利用海洋蛭弧菌及其基因资源,本研究利用IlluminaHiSeq测序平台对一株属于嗜盐噬菌弧菌(Halobacteriovorax)的海洋蛭弧菌DA5进行了全基因组测序,对基因组进行组装、基因预测和功能注释,并与其他8株蛭弧菌进行了比较基因组分析。结果显示:DA5基因组大小为3.27Mb, GC含量为36.5%,预测编码基因3175个。在DA5基因组中注释到303个基因具有直系同源蛋白簇分类,与代谢通路相关基因1239个。比较基因组分析表明:DA5符合海洋蛭弧菌基因组的基本特征,与其他8株蛭弧菌共有467个同源基因家族,而DA5特有基因为266个。DA5中与细胞运动相关基因62个,其中编码甲基受体趋化蛋白、鞭毛蛋白、鞭毛马达及其开关蛋白基因均与嗜盐噬菌弧菌BAL6_X的对应基因亲缘关系最近。对DA5全基因组序列的注释和功能分析,为深入研究其捕食特性和作用机制,并更有效地利用其防控海水养殖细菌病害提供了基础。
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关键词
海洋蛭弧菌
嗜盐噬菌
弧菌
全基因组测序
基因功能
比较基因组分析
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职称材料
两种培养基对对虾苗池海洋蛭弧菌的分离及其多样性分析
被引量:
10
3
作者
薛明
关敏丽
+1 位作者
王飞燕
温崇庆
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第9期1723-1732,共10页
【目的】明确海水(Sw)和聚蛋白胨20(Pp20)两种双层琼脂培养基对海洋蛭弧菌的分离计数效果,了解对虾苗池可培养海洋蛭弧菌多样性。【方法】采用双层平板法,比较Sw和Pp20培养基对2株海洋蛭弧菌和对虾苗池未知海洋蛭弧菌的计数效果。通过...
【目的】明确海水(Sw)和聚蛋白胨20(Pp20)两种双层琼脂培养基对海洋蛭弧菌的分离计数效果,了解对虾苗池可培养海洋蛭弧菌多样性。【方法】采用双层平板法,比较Sw和Pp20培养基对2株海洋蛭弧菌和对虾苗池未知海洋蛭弧菌的计数效果。通过宿主范围测试和16S rRNA基因序列分析评估两种培养基分离苗池海洋蛭弧菌的多样性。【结果】宿主菌含量高时,Sw培养基对两株已知海洋蛭弧菌的计数值均显著高于(P<0.05)Pp20。Sw和Pp20培养基从同一苗池水样分别分离得到21和22株蛭弧菌。根据宿主裂解范围差异,43株分离物可分为15种裂解模式,其中Sw和Pp20培养基各分离到12和8种。16S rRNA基因序列分析表明,所有分离物都被鉴定为噬菌弧菌属(Bacteriovorax)菌株,并可分为6个类群,Sw和Pp20培养基分别分离到6和4个类群。【结论】Sw培养基在分离计数海洋蛭弧菌及其多样性检测上效果均优于Pp20;对虾苗池可培养海洋蛭弧菌具有较高多样性,并以类群XIII、X及一个潜在新类群为优势种群。
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关键词
海洋蛭弧菌
对虾苗池
海水培养基
Pp20培养基
16S
RRNA基因
多样性
原文传递
题名
不同感染复数下海洋蛭弧菌DA5对溶藻弧菌的控制效率
被引量:
4
1
作者
陆友云
温崇庆
李志桦
刘杨锋
邹乐诗
梁栩云
陈国权
黄子靖
薛明
机构
广东海洋大学水产学院
出处
《广东海洋大学学报》
CAS
2018年第2期30-36,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31372536)
广东省科技计划项目(2015A020209160)
文摘
【目的】研究宿主菌密度和感染复数对海洋蛭弧菌捕食弧菌效率的影响。【方法】以溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)zouA(下称"zouA")为宿主,通过海水共培养实验研究海洋蛭弧菌菌株DA5(下称"DA5")在初始宿主密度10~3~10~8 cfu/mL下24 h的生长,评估低感染复数和高感染复数下DA5对zouA 10 d的生物控制效果。【结果】DA5捕食所需最低zouA密度约为5×10~5 cfu/mL;在zouA密度≥10~6 cfu/mL时,DA5方对其发挥控制效应,且感染复数越高捕食效率越高,即使感染复数低至0.001,一定时间后DA5亦可有效控制zouA数量。而当初始zouA密度低至10~4 cfu/mL时,DA5需在感染复数≥100条件下方可显著控制zouA。【结论】宿主密度与感染复数均影响海洋蛭弧菌DA5对溶藻弧菌的控制效果。
关键词
海洋蛭弧菌
溶藻
弧菌
宿主密度
感染复数
生物控制
Keywords
marine Bdellovibrio-and-like organisms
Vibrio alginolyticus
prey density
multiplicity of infection
biocontrol
分类号
S917.1 [农业科学—水产科学]
下载PDF
职称材料
题名
海洋蛭弧菌DA5全基因组测序及序列分析
2
作者
陆友云
薛明
李志桦
温崇庆
机构
广东海洋大学水产学院
出处
《热带海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第6期112-119,共8页
基金
国家自然科学基金项目(31372536)
广东省科技计划项目(2015A020209160)~~
文摘
为深入挖掘和利用海洋蛭弧菌及其基因资源,本研究利用IlluminaHiSeq测序平台对一株属于嗜盐噬菌弧菌(Halobacteriovorax)的海洋蛭弧菌DA5进行了全基因组测序,对基因组进行组装、基因预测和功能注释,并与其他8株蛭弧菌进行了比较基因组分析。结果显示:DA5基因组大小为3.27Mb, GC含量为36.5%,预测编码基因3175个。在DA5基因组中注释到303个基因具有直系同源蛋白簇分类,与代谢通路相关基因1239个。比较基因组分析表明:DA5符合海洋蛭弧菌基因组的基本特征,与其他8株蛭弧菌共有467个同源基因家族,而DA5特有基因为266个。DA5中与细胞运动相关基因62个,其中编码甲基受体趋化蛋白、鞭毛蛋白、鞭毛马达及其开关蛋白基因均与嗜盐噬菌弧菌BAL6_X的对应基因亲缘关系最近。对DA5全基因组序列的注释和功能分析,为深入研究其捕食特性和作用机制,并更有效地利用其防控海水养殖细菌病害提供了基础。
关键词
海洋蛭弧菌
嗜盐噬菌
弧菌
全基因组测序
基因功能
比较基因组分析
Keywords
marine Bdellovibrio-and-like organisms
Halobacteriovorax
whole-genome sequencing
gene function
comparative genomic analysis
分类号
Q933 [生物学—微生物学]
下载PDF
职称材料
题名
两种培养基对对虾苗池海洋蛭弧菌的分离及其多样性分析
被引量:
10
3
作者
薛明
关敏丽
王飞燕
温崇庆
机构
广东海洋大学水产学院
出处
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第9期1723-1732,共10页
基金
国家自然科学基金项目(No.31372536)
广东省自然科学基金项目(No.S2012040007698)
广东海洋大学大学生创新实验基金项目(No.1056610002)
文摘
【目的】明确海水(Sw)和聚蛋白胨20(Pp20)两种双层琼脂培养基对海洋蛭弧菌的分离计数效果,了解对虾苗池可培养海洋蛭弧菌多样性。【方法】采用双层平板法,比较Sw和Pp20培养基对2株海洋蛭弧菌和对虾苗池未知海洋蛭弧菌的计数效果。通过宿主范围测试和16S rRNA基因序列分析评估两种培养基分离苗池海洋蛭弧菌的多样性。【结果】宿主菌含量高时,Sw培养基对两株已知海洋蛭弧菌的计数值均显著高于(P<0.05)Pp20。Sw和Pp20培养基从同一苗池水样分别分离得到21和22株蛭弧菌。根据宿主裂解范围差异,43株分离物可分为15种裂解模式,其中Sw和Pp20培养基各分离到12和8种。16S rRNA基因序列分析表明,所有分离物都被鉴定为噬菌弧菌属(Bacteriovorax)菌株,并可分为6个类群,Sw和Pp20培养基分别分离到6和4个类群。【结论】Sw培养基在分离计数海洋蛭弧菌及其多样性检测上效果均优于Pp20;对虾苗池可培养海洋蛭弧菌具有较高多样性,并以类群XIII、X及一个潜在新类群为优势种群。
关键词
海洋蛭弧菌
对虾苗池
海水培养基
Pp20培养基
16S
RRNA基因
多样性
Keywords
Marine Bdellovibrio-and-like organisms
Shrimp hatchery system
Seawater medium
Pp20 medium
16S rRNA gene
Diversity
分类号
S945.49 [农业科学—水产养殖]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
不同感染复数下海洋蛭弧菌DA5对溶藻弧菌的控制效率
陆友云
温崇庆
李志桦
刘杨锋
邹乐诗
梁栩云
陈国权
黄子靖
薛明
《广东海洋大学学报》
CAS
2018
4
下载PDF
职称材料
2
海洋蛭弧菌DA5全基因组测序及序列分析
陆友云
薛明
李志桦
温崇庆
《热带海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
0
下载PDF
职称材料
3
两种培养基对对虾苗池海洋蛭弧菌的分离及其多样性分析
薛明
关敏丽
王飞燕
温崇庆
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
10
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