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巨蛎属(Crassostrea)四种牡蛎精子Bindin蛋白海藻糖凝集素结构域(Fucose binding lectin)多样性研究
被引量:
1
1
作者
吴琪
李莉
张国范
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第2期251-255,共5页
提取巨蛎属中熊本牡蛎、葡萄牙牡蛎和日本巨牡蛎的基因组DNA,应用PCR技术扩增了三种牡蛎的海藻糖凝集素结构域(Fucose binding lectin,F-lectin),结合GenBank中长牡蛎海藻糖凝集素结构域的序列利用邻接法对得到的序列进行了系统进化分析...
提取巨蛎属中熊本牡蛎、葡萄牙牡蛎和日本巨牡蛎的基因组DNA,应用PCR技术扩增了三种牡蛎的海藻糖凝集素结构域(Fucose binding lectin,F-lectin),结合GenBank中长牡蛎海藻糖凝集素结构域的序列利用邻接法对得到的序列进行了系统进化分析,并利用非同义替换率和同义替换率之间的比值分析了巨蛎属四种牡蛎海藻糖凝集素结构域上可能的受正选择的位点。结果表明,四种巨蛎属牡蛎的海藻糖凝集素结构域序列中长牡蛎与葡萄牙牡蛎的F-lectin比长牡蛎与熊本牡蛎的关系更近,葡萄牙牡蛎三种单倍型(an1,an2,an3)定位在不同的支上,an1与长牡蛎海藻糖凝集素结构域的关系更近,an2与an3与熊本牡蛎之间的关系更近。在巨蛎属中,海藻糖凝集素结构域的3D模型中,发现五个可能的受正向选择的位点(40,66,67,123,125),并且这五个位点都围绕在三个重要的识别氨基酸(H37,R64,R70)周围,推测这五个正向选择位点也许与牡蛎种特异的受精识别有关。
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关键词
巨蛎属
结合
素
蛋白
海藻糖凝集素结构域
多样性
正选择位点
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职称材料
题名
巨蛎属(Crassostrea)四种牡蛎精子Bindin蛋白海藻糖凝集素结构域(Fucose binding lectin)多样性研究
被引量:
1
1
作者
吴琪
李莉
张国范
机构
中国科学院海洋研究所
中国科学院研究生院
出处
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第2期251-255,共5页
基金
国家自然科学基金重点项目
40730845号
+5 种基金
国家重点基础研究发展计划(973项目)资助
2010CB126401号
国家高技术研究发展计划(863计划)资助
2010AA1019004号
国家公益性行业(农业)科研专项
3-53号
文摘
提取巨蛎属中熊本牡蛎、葡萄牙牡蛎和日本巨牡蛎的基因组DNA,应用PCR技术扩增了三种牡蛎的海藻糖凝集素结构域(Fucose binding lectin,F-lectin),结合GenBank中长牡蛎海藻糖凝集素结构域的序列利用邻接法对得到的序列进行了系统进化分析,并利用非同义替换率和同义替换率之间的比值分析了巨蛎属四种牡蛎海藻糖凝集素结构域上可能的受正选择的位点。结果表明,四种巨蛎属牡蛎的海藻糖凝集素结构域序列中长牡蛎与葡萄牙牡蛎的F-lectin比长牡蛎与熊本牡蛎的关系更近,葡萄牙牡蛎三种单倍型(an1,an2,an3)定位在不同的支上,an1与长牡蛎海藻糖凝集素结构域的关系更近,an2与an3与熊本牡蛎之间的关系更近。在巨蛎属中,海藻糖凝集素结构域的3D模型中,发现五个可能的受正向选择的位点(40,66,67,123,125),并且这五个位点都围绕在三个重要的识别氨基酸(H37,R64,R70)周围,推测这五个正向选择位点也许与牡蛎种特异的受精识别有关。
关键词
巨蛎属
结合
素
蛋白
海藻糖凝集素结构域
多样性
正选择位点
Keywords
Crassostrea
Bindin
Fucose-binding lectin
Polymorphism
Positive selection
分类号
Q18 [生物学—普通生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
巨蛎属(Crassostrea)四种牡蛎精子Bindin蛋白海藻糖凝集素结构域(Fucose binding lectin)多样性研究
吴琪
李莉
张国范
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2011
1
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职称材料
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