基于生物信息学未分化甲状腺癌LncRNA基因与免疫浸润机制及中药预测的研究

目的基于GEO数据库对未分化甲状腺癌基因数据进行差异分析、基因富集分析和免疫浸润分析,为深入了解未分化甲状腺癌免疫相关机制及治疗提供理论依据。方法利用GEO数据库检索有关ATC的芯片,根据样本数量及芯片类型,筛选出符合条件的芯片,借助R语言软件筛选出符合条件的差异基因,筛选ATC中差异表达的lncRNA,构建LncRNA-miRNA-mRNA网络图,并构建蛋白质-蛋白质相互作用关系网络(PPI)并进行GO富集分析和KEGG通路分析。同时利用CIBERSORT反卷积法对22种免疫细胞在未分化甲状腺癌中的浸润情况进行分析。并通过Coremine Medical进行治疗中药预测。结果经检索GEO数据库找到编码为GSE65144的基因芯片,利用R语言分析筛选出LncRNA差异基因127个,其中上调基因51个,下调基因76个,并对差异基因绘制ceRNA网络;将得出的LncRNA进行PPI网络分析,筛选出核心基因20个,排名靠前的有MYC、JUN、EGLN3、KIF23、YWHAH。GO富集分析显示其参与了RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录调控、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、细胞增殖的正调控、细胞迁移的正调控等生物学过程,KEGG主要富集通路为癌症信号通路、MAPK信号通路、PI3K-AKT信号通路等。免疫浸润结果显示甲状腺未分化癌(anaplastic thyroid carcinoma,ATC)中巨噬细胞M0和巨噬细胞M2显著增高,而浆细胞和T细胞γ-δ显著减少。单核细胞和中性粒细胞呈显著正相关(r=0.90),活化的肥大细胞和中性粒细胞呈显著正相关(r=0.88),活化的肥大细胞和单核细胞呈显著正相关(r=0.72),嗜酸性粒细胞和CD_(4)T细胞呈显著正相关(r=0.72),T细胞γ-δ和滤泡辅助T细胞呈显著正相关(r=0.71)。并且,巨噬细胞M2和浆细胞呈显著负相关(r=-0.70),T细胞γ-δ和活化的树突状细胞呈显著负相关(r=-0.68),T细胞γ-δ和巨噬细胞M0呈显著负相关(r=-0.56)。预测中药主要集中在清热解毒药和补虚药,归经主要为肝、脾、肾经。结论ATC患者基因差异表达和免疫细胞浸润率的个体差异比较显著。在ATC肿瘤组织中具有高比例浸润的免疫细胞是其治疗的潜在目标。中药治疗是一个新的方向,有待后续的临床及基础实验加以验证。

TIMP-1在乳腺癌中的表达及其抗浸润机制研究

[目的]研究乳腺癌组织中金属蛋白酶组织抑制因子 (TIMP_1)的表达状况及其与Ⅳ型胶原 (ColⅣ )的分布形式的关系 ,揭示乳腺癌的浸润转移机制 ,同时为可能应用新治疗方法提供理论依据。[方法]应用SP免疫组化方法检测95例乳腺癌组织和30例乳腺非癌组织中TIMP_1的表达情况和ColⅣ的分布形式。[结果] (1)在95例乳腺癌组织中 ,TIMP_1的阳性表达率为32.6%(31/95) ;ColⅣ分布形式中包裹型占14.7%(14/95)、崩解型占85.3%(81/95)。与对照组比较均有显著差异 (P<0.01)。(2)TIMP_1的表达与组织学分级有关 (Ⅰ级/Ⅲ级 ,P<0.05) ,级别越高 ,阳性率越高。(3)TIMP_1的表达与ColⅣ的分布形式相关(P<0.05) ,TIMP_1阳性者 ,则崩解型ColⅣ出现的机率小。[结论]乳腺癌TIMP_1的表达与肿瘤浸润或转移呈负相关 ,TIMP_1则通过下调MMP对ColⅣ的降解活性而抑制肿瘤细胞的侵袭 。

乳腺导管原位癌浸润机制的研究进展

乳腺导管原位癌(DCIS)是可以治愈的早期癌症。近年来,人们一直认为DCIS是浸润性导管癌(IDC)的非专一性前体,识别出哪些DCIS具有进展能力,并发掘其进展机制是该领域的重要研究方向。肿瘤微环境被认为是肿瘤进展的重要参与者。在疾病发展过程中,构成微环境的细胞中存在显著的基因表达和表观遗传学改变,可作为治疗的生物标志物和靶点。此外,通过分析DCIS和IDC的基因表达谱发现两者具有很高的基因组相似性,但仍检测出一些质的差异,表明在某些样本中发生了从DCIS到IDC的进展。

乳腺导管原位癌浸润机制分析

乳腺导管原位癌是可以治愈的早期癌,但他可以进一步发展为浸润癌。因此,研究其浸润机制有助于乳腺导管原位癌的早期发现及早期诊断与治疗。本文就乳腺导管原位癌雌孕激素受体、表观遗传学、基因变异、癌细胞迁移能力、血管内皮生长因子、基质金属蛋白酶及癌周微环境等方面对其浸润机制做一简要分析,以期为更好地认识乳腺癌的发生、发展、浸润及转移提出新的研究方向和依据,最终应用于临床。

一种浸润冻结机制冰核测量装置(FINDA)的搭建与应用

为了定量评估降水(雨、雪、雹等)和大气中冰核浓度,搭建了一种新型的离线式冰核测量装置(FINDA)用于检测浸润冻结机制的冰核。对多通道测温元件进行了改装和校准,并利用红外热成像仪动态校准了冷台水平温差,开发了自动化软件实现对测量过程的控制和数据分析。通过超纯水冻结实验、雪水及大气样品中冰核检验评估了FINDA的测量性能。结果表明,FINDA温度测量偏差随温度降低而线性增大,-25℃时误差为±0.75℃;超纯水初始冻结温度平均为-21.27±1.45℃,中值冻结温度(T50)平均为-25.65±0.64℃;对同一降雪融水样品中冰核浓度温度谱检测,FINDA与其他冻滴设备测量结果基本一致,同冰核浓度下温度偏差小于3℃;大气样品中冰核-20℃时比在线连续流量扩散云室测量值略高,与国际上其他学者的结论一致。FINDA能够有效获得0--25℃每隔0.25℃的冰核浓度谱,超纯水和试验操作引入的冰核对测量结果影响很小。设备的广泛应用可帮助深入了解大气冰核在混合云降水中的作用,为预报和云模式的本地化改进及对云降水理论研究提供重要的实验数据和理论基础。

嗜酸性粒细胞在鼻息肉发病中的作用及机制研究

慢性鼻-鼻窦炎特别是鼻息肉发病机制不清,以嗜酸性粒细胞(eosinophil,Eos)浸润为主的鼻息肉有更高的复发率和更差的疗效,故Eos在其发病中的作用尤为重要。本文将Eos作为主线,探究其在鼻息肉形成过程中聚集及作用机制,为鼻息肉治疗提供依据。

关于高职院校人才培养质量提高的深度思考

提高高职院校人才培养质量,必须重新设计职业教育人才培养制度,必须科学准确界定职业教育人才培养标准,必须构建权威的人才培养模式,必须进行专业(课程)供给侧深度改革,必须全面提高教师的综合育人能力,必须构建全面全程"浸润式"育人机制,必须构建质量导向评价体系。