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基于机器学习算法筛选膀胱肿瘤预后相关基因并分析其与免疫浸润细胞的关系 被引量:1
1
作者 周玉贺 王成宇 +4 位作者 符博 黄珍林 宁向辉 贾占奎 杨锦建 《河南外科学杂志》 2023年第1期1-5,共5页
目的 筛选膀胱肿瘤预后相关的基因,并分析其与免疫浸润细胞的关系。方法 从高通量基因表达数据库(GEO)获得的芯片数据(GSE13507、GSE40355)作为训练组,用于筛选出差异表达基因(DEGs)。利用套索算法(LASSO)与支持向量机的递归特征消除算... 目的 筛选膀胱肿瘤预后相关的基因,并分析其与免疫浸润细胞的关系。方法 从高通量基因表达数据库(GEO)获得的芯片数据(GSE13507、GSE40355)作为训练组,用于筛选出差异表达基因(DEGs)。利用套索算法(LASSO)与支持向量机的递归特征消除算法(SVM-RFE)从DEGs中筛选出膀胱肿瘤的关键基因。以癌症基因图谱计划数据库(TCGA)下载的膀胱肿瘤RNA-seq FPKM数据为验证组,验证关键基因的敏感性与特异性。下载TCGA临床数据用于对关键基因的生存分析,并用GEPIA数据库进行验证。利用CIBERSORT网站对验证组数据进行免疫浸润细胞分析,并探索预后相关的基因与免疫浸润细胞的关系。结果 训练组中得到了176个差异基因,其中上调基因21个、下调基因155个。LASSO回归和SVM-RFE算法分别获得13、34个特征基因,取交集后共得到5个膀胱肿瘤关键基因(CYTL1、SRPX、ADH1B、PMP2、IQGAP3)。关键基因在验证组中均表现出了较高的敏感性与特异性。生存分析发现不同表达量的PMP2(P=0.002)、CYTL1(P=0.032)患者生存率有显著差异。在肿瘤组织中M0、M1巨噬细胞表现为高水平,未活化的肥大细胞表现为低水平,PMP2、CYTL1表达量与滤泡辅助性T细胞,CD8 T细胞负相关,而与未活化记忆CD4 T细胞、初始B细胞正相关。肿瘤微环境中具有高丰度活化的CD4记忆T细胞(P=0.017)、CD8 T细胞(P=0.049)患者预后更好。结论 CYTL1、PMP2基因与患者预后相关,可作为今后治疗的潜在靶点。肿瘤免疫微环境中PMP2、CYTL1基因表达量与滤泡辅助性T细胞、CD8 T细胞负相关,而与未活化的CD4记忆T细胞、初始B细胞正相关。活化的CD4记忆T细胞、CD8 T细胞可能是膀胱肿瘤患者的保护因素。 展开更多
关键词 膀胱肿瘤 机器学习 免疫浸润细胞
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肾脏固有细胞和浸润细胞在肾小管间质病变中的作用 被引量:12
2
作者 杨莉 李晓玫 王海燕 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第8期1007-1011,共5页
Tubulointerstitial lesions, occurring in many kinds of renal diseases, have been found to be the predominant factor in the impairment of renal function. The severe and extensive lesions often predict a poor outcome in... Tubulointerstitial lesions, occurring in many kinds of renal diseases, have been found to be the predominant factor in the impairment of renal function. The severe and extensive lesions often predict a poor outcome in future. It has been tested recent years that the infiltrating inflammatory cells might play important roles in the onset and deterioration of tubulointerstitial injuries. On the other hand, the resident cells, including the tubular epithelial cells and the fibroblasts, also directly take part in tubulointerstitial inflammation and fibrosis. Researches also display implicated interactions between the infiltrating cells and the resident cells, which contribute to the amplification of inflammation and the progress of fibrosis. 展开更多
关键词 固有细胞 浸润细胞 间质性肾炎 成纤维细胞 单核细胞 T淋巴细胞
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二期梅毒皮疹中梅毒螺旋体基因检测和浸润细胞研究(英文) 被引量:2
3
作者 李文海 张建中 《北京大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期485-487,共3页
目的 :探讨二期梅毒皮疹的形成机制和细胞免疫在梅毒皮疹形成中的作用。方法 :用巢式PCR方法对2 4例 10 %甲醛溶液固定、石蜡包埋的二期梅毒疹标本进行了梅毒螺旋体DNA检测 ;用免疫组化方法对二期梅毒皮损中的浸润细胞进行检测。结果 :... 目的 :探讨二期梅毒皮疹的形成机制和细胞免疫在梅毒皮疹形成中的作用。方法 :用巢式PCR方法对2 4例 10 %甲醛溶液固定、石蜡包埋的二期梅毒疹标本进行了梅毒螺旋体DNA检测 ;用免疫组化方法对二期梅毒皮损中的浸润细胞进行检测。结果 :2 4份二期梅毒疹标本中 10例 (4 5 .8% )检出了梅毒螺旋体DNA ,所有标本银染色未发现苍白螺旋体 (TP)。二期梅毒皮损浸润细胞中CD4 5RO(+)T细胞 10 0 %阳性 ,6 8.2 %有CD6 8(+)巨噬细胞 ,此外还有少量CD2 0 (+)B淋巴细胞和CD5 7(+)NK细胞。结论 :二期梅毒疹的形成原因可能为螺旋体感染皮肤局部所致 ;二期梅毒疹皮损中浸润细胞主要为T淋巴细胞和巨噬细胞 。 展开更多
关键词 二期梅毒皮疹 梅毒螺旋体 基因检测 浸润细胞 病因学 细胞免疫
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甲状腺自身免疫病原位浸润细胞与DR抗原异常表达及意义系列研究(简介)
4
作者 苏敏 牛恕淼 +6 位作者 李恒力 高慧 郭尚温 田东萍 冯学亮 施秉银 李健 《医学研究杂志》 1994年第11期21-22,共2页
甲状腺自身免疫病,因其发病机理未完全明了,临床上尚无有效治疗方法。本项目首家应用甲状腺粗针穿刺技术及免疫组化、免疫电镜方法进行了一系列原位研究,取得了重要成果。主要有以下四部分内容:
关键词 DR抗原 浸润细胞 免疫电镜 穿刺技术 抗原表达 滤泡上皮细胞 抗甲状腺药物 原位免疫组化 甲低 发病机理
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乳腺癌间质浸润细胞免疫学特征与组织学分级的关系
5
作者 钟丽萍 郭瑞珍 +2 位作者 肖庆帮 杨华 马明宗 《贵州医药》 CAS 1997年第6期340-342,共3页
为了探讨乳腺癌间质浸润细胞的局部免疫状态及对预后的影响,对90例乳腺癌进行组织学分级,间质浸润细胞用4种单克隆抗体(LCA,UCHL1,L26,Mac387)进行免疫组化标记。结果发现组织学分级不同,间质浸润细胞的量不同,间质细胞浸润程... 为了探讨乳腺癌间质浸润细胞的局部免疫状态及对预后的影响,对90例乳腺癌进行组织学分级,间质浸润细胞用4种单克隆抗体(LCA,UCHL1,L26,Mac387)进行免疫组化标记。结果发现组织学分级不同,间质浸润细胞的量不同,间质细胞浸润程度有随癌组织分化程度降低而减弱的现象。提示乳腺癌组织分化程度越高,间质浸润细胞越多,若伴有一定数量的淋巴细胞浸润,患者预后较好。 展开更多
关键词 乳腺癌 分级 间质浸润细胞 免疫组化
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红斑狼疮皮损中浸润细胞免疫表型和角质形成细胞HLA-DR抗原表达的研究
6
作者 王晓云 冒长峙 王正文 《临床皮肤科杂志》 CSCD 北大核心 1999年第3期150-153,共4页
应用抗HLADR、CD3、CD4、CD8、CD20的单克隆抗体和streptravidinperoxidasestaining(SP)技术对10名正常人皮肤,16例SLE皮损和19例DLE皮损进行了免疫组化研究。... 应用抗HLADR、CD3、CD4、CD8、CD20的单克隆抗体和streptravidinperoxidasestaining(SP)技术对10名正常人皮肤,16例SLE皮损和19例DLE皮损进行了免疫组化研究。观察到正常人皮肤角质形成细胞未见HLADR抗原表达,而SLE(6/16),DLE(8/19)皮损处角质形成细胞可以表达HLADR抗原。在SLE、DLE真皮内浸润细胞主要为T淋巴细胞(CD3+浸润细胞),且以TH细胞(CD4+浸润细胞)占优势。另外,还发现在两种LE表皮角质形成细胞表达HLADR抗原处,真皮内可见CD3+浸润细胞和激活的T淋巴细胞(HLADR+浸润细胞)。讨论了LE皮损角质形成细胞HLADR抗原表达及其与病损内浸润细胞免疫表型的关系。LE皮损处HLADR+角质形成细胞可能具有抗原递呈作用,而角质形成细胞异常表达HLADR抗原则可能与真皮内浸润单个核细胞或淋巴细胞释放的IFNα,TNFγ等有关。 展开更多
关键词 红斑狼疮 角质形成细胞 浸润细胞 HLA-DR抗原
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慢性及急性实验性自身免疫性葡萄膜炎中眼浸润细胞比较 被引量:2
7
作者 陈梓琳 周红颜 +1 位作者 庄伟波 陈军 《海南医学院学报》 CAS 2020年第1期25-29,共5页
目的探讨实验性自身免疫性葡萄膜炎(experimental autoimmune uveitis,EAU)眼浸润细胞在C57BL/6及B10.RⅢ品系小鼠中的差异。方法通过完全弗氏佐剂结合光感受器间维生素A类结合蛋白在C57BL/6和B10.RⅢ品系小鼠中建立慢性及急性EAU疾病模... 目的探讨实验性自身免疫性葡萄膜炎(experimental autoimmune uveitis,EAU)眼浸润细胞在C57BL/6及B10.RⅢ品系小鼠中的差异。方法通过完全弗氏佐剂结合光感受器间维生素A类结合蛋白在C57BL/6和B10.RⅢ品系小鼠中建立慢性及急性EAU疾病模型,通过视网膜成像技术及视觉电生理技术分析比较两种EAU小鼠临床评分,通过流式细胞技术分析疾病高峰期炎性眼组织中浸润细胞类型及比例。结果急性EAU比慢性EAU更早发病、更早到达疾病高峰且临床评分高1。在炎性眼组织中,急性EAU小鼠的CD4+T淋巴细胞和CD11b+细胞比例显著高于慢性EAU小鼠,而CD8+T淋巴细胞、自然杀伤性细胞及自然杀伤性T细胞在两种EAU小鼠模型中无显著性差异,其中眼浸润CD11b+细胞中,急性EAU小鼠巨噬细胞及骨髓来源抑制性细胞比例显著高于慢性EAU小鼠。结论急性EAU和慢性EAU的疾病差异与眼浸润CD4+T淋巴细胞、巨噬细胞及骨髓来源抑制性细胞相关。 展开更多
关键词 实验性自身免疫性葡萄膜炎 自身免疫性葡萄膜炎 浸润细胞
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膀胱癌肿瘤微环境中抑制性免疫浸润细胞的研究进展 被引量:4
8
作者 黄楠(综述) 邓红彬(审校) 《现代医药卫生》 2021年第17期2966-2971,共6页
免疫治疗在早期及晚期膀胱癌患者中均可发挥作用,但是仍有部分患者不能从免疫治疗中获益。肿瘤微环境介导的免疫逃逸可能是这部分患者对免疫治疗无应答的主要原因之一。在肿瘤微环境中发现一群抑制性免疫浸润细胞,能够通过内在及外在途... 免疫治疗在早期及晚期膀胱癌患者中均可发挥作用,但是仍有部分患者不能从免疫治疗中获益。肿瘤微环境介导的免疫逃逸可能是这部分患者对免疫治疗无应答的主要原因之一。在肿瘤微环境中发现一群抑制性免疫浸润细胞,能够通过内在及外在途径介导肿瘤免疫抑制的形成。该类细胞包括髓样抑制细胞、肿瘤相关巨噬细胞、调节性T细胞、肿瘤相关中性粒细胞。该文就这些抑制性免疫浸润细胞在膀胱癌中的免疫抑制及促癌机制、潜在的治疗靶点、与预后的相关性进行综述。 展开更多
关键词 膀胱癌 肿瘤微环境 免疫浸润细胞 免疫抑制 综述
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喉癌间质肥大细胞与其他浸润细胞的关系
9
作者 曲静 王会珍 +1 位作者 彭希平 王周南 《山西医科大学学报》 CAS 2000年第4期292-294,共3页
为了探讨肥大细胞 (MC)在喉癌间质反应中的作用 ,用光镜、电镜技术研究了 45例喉鳞癌组织及癌旁组织中MC形态学特征及其与其他浸润细胞的关系。结果发现癌间质中MC呈活跃的脱颗粒状态 ,并与淋巴细胞、浆细胞、巨噬细胞、嗜酸粒细胞、成... 为了探讨肥大细胞 (MC)在喉癌间质反应中的作用 ,用光镜、电镜技术研究了 45例喉鳞癌组织及癌旁组织中MC形态学特征及其与其他浸润细胞的关系。结果发现癌间质中MC呈活跃的脱颗粒状态 ,并与淋巴细胞、浆细胞、巨噬细胞、嗜酸粒细胞、成纤维细胞关系密切。癌旁组织中淋巴细胞浸润程度高的 ,MC数量多 (P <0 0 1) ;癌组织中有明显胶原纤维包裹的 ,MC数量多 (P <0 0 1)。结果提示 :喉癌间质中的MC与其他浸润细胞有协同作用 。 展开更多
关键词 喉肿瘤 肥大细胞 浸润细胞 光镜 电镜
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肝细胞癌肿瘤突变负荷与肿瘤微环境免疫浸润细胞关联性研究
10
作者 曲家麟 王力 +1 位作者 姜曼 张晓春 《临床医学进展》 2021年第6期2880-2890,共11页
目的:肝细胞癌是我国常见肿瘤之一,并占癌症死亡人数的第二位。随着免疫治疗的普及,免疫检查点抑制剂也逐步应用于肝癌,部分患者取得了良好的治疗效果。但是目前仍缺少准确地预测免疫检查点抑制剂的生物标志物。肿瘤突变负荷及免疫浸润... 目的:肝细胞癌是我国常见肿瘤之一,并占癌症死亡人数的第二位。随着免疫治疗的普及,免疫检查点抑制剂也逐步应用于肝癌,部分患者取得了良好的治疗效果。但是目前仍缺少准确地预测免疫检查点抑制剂的生物标志物。肿瘤突变负荷及免疫浸润细胞是常用的免疫检查点抑制剂的生物标志物,可以有效预测其疗效,在恶性黑色素瘤及非小细胞肺癌中已经得到证实。但在肝癌中此类研究尚少,为了探究肿瘤突变负荷及免疫浸润细胞之间是否存在协同关系以便更好预测免疫检查点抑制剂在肝癌中的疗效,我们展开了本次研究。方法:从TCGA数据库中下载肝癌患者的基因表达数据、基因突变数据及临床数据。将所有患者根据肿瘤突变负荷分为高突变负荷组及低突变负荷组,从两组患者的数据中鉴定出差异表达最明显的基因。利用功能富集分析及蛋白质–蛋白质相互作用网络分析差异基因的生物学功能。CIBERSORT算法用于分析两组患者之间肿瘤微环境免疫浸润细胞的特征,Kaplan-Meier生存分析用以分析两组之间患者的生存时间有无差别。结果:TP53是肝细胞癌中突变频率最高的基因,在高肿瘤突变负荷组及低肿瘤突变复合组中,MAGEA3、MAGEA6及MAGEA12基因表达差异最为显著,其功能与细胞增殖、上皮–间质转化等恶性表型密切相关。在肿瘤微环境免疫浸润细胞差别中,低肿瘤突变复合组的记忆性CD4+ T细胞数量显著高于高肿瘤突变复合组,且生存期明显延长。结论:在肝细胞癌患者中,低肿瘤突变负荷组的CD4+ T细胞数量显著高于高肿瘤突变复合组,并且有更好的临床预后。这显示在肝细胞癌中,以TMB高低作为判断肝细胞癌免疫检查点抑制剂的唯一生物标志物尚有待商榷,应结合更多指标综合评估。 展开更多
关键词 细胞 免疫检查点抑制剂 肿瘤突变负荷 免疫浸润细胞
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扁平苔藓的浸润细胞
11
作者 阎淑玲 邱丙森 《国外医学(皮肤性病学分册)》 北大核心 1990年第3期149-151,共3页
扁平苔藓(LP)是一种慢性炎症性疾病,其病因和发病机理不明。十多年来,已逐渐应用玫瑰花环试验、放射自显影、电镜、组织化学和免疫组织化学等方法,对皮肤和粘膜损害处浸润细胞作了较深入的研究。目前已开展鉴定浸润细胞种类及亚群、定... 扁平苔藓(LP)是一种慢性炎症性疾病,其病因和发病机理不明。十多年来,已逐渐应用玫瑰花环试验、放射自显影、电镜、组织化学和免疫组织化学等方法,对皮肤和粘膜损害处浸润细胞作了较深入的研究。目前已开展鉴定浸润细胞种类及亚群、定位、比例、来源、功能、活性程度及相互作用的研究。在LP浸润细胞中,一致认为T淋巴细胞占优势,有少许巨噬细胞,B淋巴细胞极少。除此以外,病变区郎格罕细胞(LC) 展开更多
关键词 扁平苔藓 浸润细胞
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急性排异及其浸润细胞的研究进展 被引量:1
12
作者 季曙明 《肾脏病与透析肾移植杂志》 CAS CSCD 1996年第1期76-82,共7页
关键词 肾移植 急性排异 细胞浸润 排斥反应
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免疫组化检测风湿性心脏瓣膜浸润细胞表型和穿孔素
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作者 熊丁丁 杨英珍 +1 位作者 徐德民 蒋振斌 《中国心血管杂志》 1997年第1期15-16,24,共3页
为了探测细胞介导的细胞毒作用在风湿性心脏瓣膜病(风心病)发病中的意义,我们应用免疫组织化学技术,对9例风心病、6例非风心病瓣膜标本的浸润淋巴细胞表型和穿孔素进行了检测.结果:1.风心瓣膜的浸润细胞中,发现有CD4+细胞5例,CD8+细胞7... 为了探测细胞介导的细胞毒作用在风湿性心脏瓣膜病(风心病)发病中的意义,我们应用免疫组织化学技术,对9例风心病、6例非风心病瓣膜标本的浸润淋巴细胞表型和穿孔素进行了检测.结果:1.风心瓣膜的浸润细胞中,发现有CD4+细胞5例,CD8+细胞7例,CD16+细胞5例,非风心瓣膜仅1例有少量的CD4+细胞;2.穿孔素仅见于有CD8+和/或CD16+细胞浸润的7例风心瓣膜中.结果初步表明,细胞介导的细胞毒作用可能是风心病发病的主要机理之一,穿孔素则可能是CD8+和CD16+等效应细胞释放的、致瓣膜损伤的主要效应分子. 展开更多
关键词 免疫组化 检测 风湿性心脏瓣膜病 细胞浸润 细胞表型 穿孔素 淋巴细胞 细胞毒作用
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美国皮肤利什曼病皮损中浸润细胞的流式细胞检测分析
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作者 Da- Cruz A.M. Bertho A.L. +2 位作者 Oliveira- Neto M.P. Coutinho S.G. 刘艳 《世界核心医学期刊文摘(皮肤病学分册)》 2005年第12期41-42,共2页
Background: CD4+ and CD8+ T lymphocytes play different roles in the outcome of leishmaniasis. However, T- cell distribution in lesions shows significant variability in in situ immunocytochemical studies. Objectives: I... Background: CD4+ and CD8+ T lymphocytes play different roles in the outcome of leishmaniasis. However, T- cell distribution in lesions shows significant variability in in situ immunocytochemical studies. Objectives: In this report flow cytometry was used to determine the predominant T- cell subsets in leishmaniasis lesions, and their relationship with Leishmania- responsive circulating T cells. Patients and methods: Mononuclear cells from lesions or peripheral blood (PBMC) of 34 cutaneous (CL), four mucosal (ML) and four disseminated leishmaniasis were phenotypically characterized by flow cytometry. Leishmania- responsive T cells were obtained after in vitro stimulation of PBMC with leishmanial antigens. Results/conclusions: Variable amounts of γ δ lymphocytes were present in all lesions, with no association with duration of illness. The highest percentages of interleukin- 2R- and interferon- γ R- positive cells were observed in ML lesions and could render these T cells more susceptible to the effects of these cytokines. The distribution of intralesional T- lymphocyte subsets was quite variable (CD4+ > CD8+ =18 cases, CD8+ >CD4+ =12 cases and CD4+  CD8+ =4 cases) without any association with clinical parameters, and could explain the controversy regarding proportions of these T- cell subsets in leishmaniasis lesions. Low percentages of Leishmania- reactive CD8+ T cells were observed in blood while an enrichment of CD8+ cells was shown in the inflammatory infiltrate, suggesting that local immunoregulatory factors could favour the recruitment and/or proliferation of local CD8+ lymphocytes. Increased percentages of CD8+ cells observed in older lesions are consistent with the hypothesis that they can mediate healing, although their involvement in tissue damage cannot be ruled out. It is possible that these mechanisms can influence the clinical outcome or even the response to therapy. 展开更多
关键词 皮肤利什曼病 浸润细胞 流式细胞检测 外周血单核细胞 细胞亚群 免疫细胞化学 免疫调节因子 阳性细胞 临床参数 播散性
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浸润细胞、相关的细胞因子和趋化因子受体在皮肌炎皮损中的表达
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作者 Caproni M. Torchia D. +2 位作者 Cardinali C. P. Fabbri 崔荣 《世界核心医学期刊文摘(皮肤病学分册)》 2005年第3期51-52,共2页
Background: There have been only two reports on immunophenotypic characteriza tion in the cutaneous lesions of dermatomyositis (DM) that emphasize the importa nce of the infiltrating CD4+ T lymphocytes. Objectives: To... Background: There have been only two reports on immunophenotypic characteriza tion in the cutaneous lesions of dermatomyositis (DM) that emphasize the importa nce of the infiltrating CD4+ T lymphocytes. Objectives: To characterize the imm unophenotype of the cells that infiltrate the lesional skin of DM and to evaluat e the possible T-helper (Th) polarization Th1/Th2 through detection of specifi c cytokines, chemokine receptors and markers of cellular activation. Methods: Sk in biopsy specimens derived from pathognomonic lesions (Gottron’s papules and Gottron’s sign) of eight patients withDMwere immunostainedwith a large panel o fmonoclonal antibodies to CD3, CD4, CD8, myeloperoxidase(MPO), eosinophil cation ic protein, tryptase, CD40, CD40 ligand (CD40L), HLA-DR, interleukin (IL)- 2, IL- 4, IL- 5, IL- 13, interferon-γ , tumour necrosis factor-α , recept or 3 for CXC chemokines (CXCR3) and receptor 3 for CC chemokines, using the alka line phosphatase-antialkaline phosphatase method. Control specimens were obtai ned from five healthy subjects and from six patients with discoid lupus erythema tosus. Results: Activated CD4+ Th lymphocytes (HLA-DR+ CD40L+ ) were the principal infiltrating cells in the lesional skin of DM; the CD4/CD8 ratio was a pproximately 2· 5. A mixed Th1/Th2 profile and higher Th1 cytokine production t ogether with significant staining for CXCR3 were detected. Neutrophil granulocyt es were the second most abundant population; eosinophil granulocytes were very p oorly represented. Conclusions: Activated CD4+ T cells presumably mediate the main pathogenetic mechanisms in pathognomonic skin lesions. The interaction betw een CD40 andCD40L could be an important mecha nismof cellular activation in cutaneous immune-mediated inflammation by ind uction of secretion of proinflammatory cytokines and chemokines. Neither Th1 nor Th2 clear polarization was found, although there was a slight Th1 prevalence. T here was a significant quantity of MPO+ cells (neutrophil granulocytes) in the in-flamed tissue, and they might have a role in sustaining the chronic inflam mation. 展开更多
关键词 皮肌炎 浸润细胞 趋化因子受体 单克隆抗体检测 髓过氧化物酶 免疫表型 碱性磷酸酶 类胰蛋白酶 活性作用 干扰素γ
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在原发性胃淋巴瘤中浸润细胞核抗原、p53、p21的表达和细胞凋亡
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作者 汪志明 《国外医学(外科学分册)》 2003年第1期61-62,共2页
关键词 免疫组织化学 P53基因 P21基因 原发性胃淋巴瘤 浸润细胞核抗原 细胞凋亡
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痛风基因表达谱的差异基因表达及免疫细胞浸润分析
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作者 陈锋 李华南 +3 位作者 章晓云 黄慧莲 陈跃平 任国武 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期592-598,共7页
目的:研究痛风患者的差异基因表达及免疫细胞浸润情况,寻找痛风发病的关键基因及免疫细胞,探究免疫细胞与痛风的关系。方法:从GEO数据库下载痛风的芯片GSE160170,借助R语言筛选差异基因,随后采用STRING数据库对差异基因进行分析,并借助C... 目的:研究痛风患者的差异基因表达及免疫细胞浸润情况,寻找痛风发病的关键基因及免疫细胞,探究免疫细胞与痛风的关系。方法:从GEO数据库下载痛风的芯片GSE160170,借助R语言筛选差异基因,随后采用STRING数据库对差异基因进行分析,并借助Cytoscape软件筛选关键基因,再对其进行富集分析,同时对免疫细胞浸润情况进行分析。结果:研究发现IL-6、IL-1β、TNF、CCL3、CXCL8和CXCL1为痛风发病的关键基因,主要通过IL-17、Toll样受体、NOD样受体、NF-κB等信号通路发挥细胞对脂多糖、细菌来源分子及生物刺激的反应等过程导致疾病发生;免疫浸润结果表明记忆性B细胞、活化的NK细胞、活化的树突状细胞、活化的肥大细胞和嗜酸性粒细胞在痛风患者中表达显著;免疫细胞间的相关性分析结果表明滤泡辅助性T细胞与活化的肥大细胞表达呈正相关,未活化的NK细胞与单核细胞表达呈负相关。结论:关键基因和差异表达的免疫细胞与痛风发病机制密切相关,为痛风的免疫机制研究提供了新思路。 展开更多
关键词 痛风 单钠尿酸盐 生物信息学 免疫细胞 细胞浸润
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CRISPR/CAS9敲除PD-1的肿瘤浸润T淋巴细胞回输对小鼠结肠癌的治疗作用
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作者 瞿紫微 李晓辉 +3 位作者 郭建辉 陈华涛 吴彪 孟庆彬 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期1189-1196,共8页
目的:探讨应用成簇规律间隔的短回文重复序列及其相关蛋白(CRISPR/Cas9)技术敲除程序性死亡分子-1(PD-1)的肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)回输对结肠癌小鼠的治疗作用。方法:皮下注射CT26构建小鼠结肠癌模型,从3只模型小鼠肿瘤组织中提取TIL,并... 目的:探讨应用成簇规律间隔的短回文重复序列及其相关蛋白(CRISPR/Cas9)技术敲除程序性死亡分子-1(PD-1)的肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)回输对结肠癌小鼠的治疗作用。方法:皮下注射CT26构建小鼠结肠癌模型,从3只模型小鼠肿瘤组织中提取TIL,并提取外周血淋巴细胞;对TIL进行PD-1基因敲除;回输实验分为对照组(Control)、输注淋巴细胞组(Lym)、输注荷瘤小鼠TIL组(TIL)、慢病毒空载对照组(pVSV-G-PX458-NC)组、PX458-PD-1-sgRNA1组(PD-1-sgRNA1),每组10只;测量各组小鼠肿瘤组织质量及肿瘤抑制率;TUNEL法检测各组小鼠肿瘤组织细胞凋亡;ELISA检测各组小鼠肿瘤组织TNF-α和IFN-γ含量;免疫组化检测肿瘤组织CD4+T、CD8+T细胞表达;免疫荧光法检测肿瘤组织细胞增殖核抗原-67(Ki-67)和血管内皮生长因子(VEGF)表达;Western blot检测肿瘤组织PD-1及其主要配体PD-L1表达。结果:PD-1-sgRNA1能明显抑制小鼠肿瘤细胞体内生长,抑制肿瘤组织Ki-67和VEGF表达及PD-1、PD-L1表达,提高肿瘤组织细胞凋亡率、TNF-α、IFN-γ含量、CD4+T、CD8+T细胞表达(均P<0.05)。结论:CRISPR/CAS9敲除PD-1的TIL回输能明显抑制结肠癌小鼠肿瘤组织Ki-67和VEGF表达,增加CD4+T、CD8+T细胞,诱导肿瘤细胞凋亡,发挥抑制肿瘤生长作用。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas9 PD-1 结肠癌 肿瘤浸润淋巴细胞 肿瘤生长
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穿孔素在扁平苔癣患者外周血淋巴细胞及皮肤浸润细胞中的表达
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作者 Prpi Massari L. Katelan M. +1 位作者 Gruber F. 田中伟 《世界核心医学期刊文摘(皮肤病学分册)》 2005年第2期22-23,共2页
Background: Current evidence suggests that lichen planus is a T-cell-mediated autoimmune disease in which cytotoxic mechanisms have been poorly investigated. Objectives: We investigated the expression of perforin in s... Background: Current evidence suggests that lichen planus is a T-cell-mediated autoimmune disease in which cytotoxic mechanisms have been poorly investigated. Objectives: We investigated the expression of perforin in subpopulations of peripheral blood lymphocytes(PBL) in exacerbation and remission phases of the disease as well as in skin lesions. Methods: We performed a simultaneous detection of perforin (intracellular molecule) and cell surface antigens on PBL by flow cytometry, and skin lesions were investigated by immunohistochemistry. Results: The most interesting finding was a significant increase of perforin expression in cytotoxic T lymphocytes (CD3+perforin+cells) in the exacerbation phase of disease(P < 0.05), which was mostly located in the CD8+subpopulation (CD8+perforin+) (P < 0.01). Using immunohistochemistry we confirmed the infiltration of T lymphocytes in skin lesions, especially of CD4+and CD8+phenotypes, compared with uninvolved (P < 0.05) and healthy skin (P < 0.01). The expression of perforin was also significantly higher in lesional skin compared with nonlesional and healthy skin (P < 0.05). Conclusions: Our results clearly show the upregulation of perforin expression in peripheral blood as well as in lesions of patients with lichen planus and therefore suggest an important role for perforin in this autoimmune disease. 展开更多
关键词 扁平苔癣 皮肤浸润 穿孔素 细胞亚群 外周血淋巴细胞 阳性细胞 自身免疫性疾病 免疫组织化学法 淋巴细胞浸润 流式细胞
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基于对比增强CT的影像组学模型可预测乳腺癌患者的肿瘤浸润淋巴细胞水平
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作者 李永 崔书君 +2 位作者 杨飞 张凡 殷晓霞 《影像科学与光化学》 CAS 2024年第2期148-154,共7页
目的:基于对比增强CT开发用于预测乳腺癌(BC)患者肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)水平的新型影像组学模型。方法:回顾性纳入210名非特殊浸润性BC患者(训练集:147名,验证集:63名),使用Pyradiomics软件包提取患者对比增强CT图像中的高维影像组学特... 目的:基于对比增强CT开发用于预测乳腺癌(BC)患者肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)水平的新型影像组学模型。方法:回顾性纳入210名非特殊浸润性BC患者(训练集:147名,验证集:63名),使用Pyradiomics软件包提取患者对比增强CT图像中的高维影像组学特征,然后利用Mann-Whitney U检验、斯皮尔曼相关系数和最小绝对值收敛和选择算子(LASSO)算法进行特征逐步筛选。筛选后的最优特征通过非线性支持向量机(NLSVM)方法在训练集中开发了影像组学模型,并在验证集中对模型的判别能力进行验证。之后利用沙普利加和解释(SHAP)算法对模型进行全局解释与特征重要性排序。结果:模型训练组和验证组的曲线下面积(AUC)分别为0.824(95%CI:0.762~0.886)和0.766(95%CI:0.624~0.909),影像组学模型有3个正向影响特征与4个负向影响特征,其中log-sigma-5-0-mm-3D_firstorder_Maximum对模型的影响力最大,其值越大时,模型输出SHAP值越小。结论:基于对比增强CT的影像组学模型可以帮助临床医生在治疗前准确预测BC患者的肿瘤浸润淋巴细胞水平,促进BC患者的个性化治疗。 展开更多
关键词 影像组学 肿瘤浸润淋巴细胞 乳腺癌 预测模型
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