基于生物信息学分析抑制素在消化系统恶性肿瘤中的表达及预后价值

目的探索肿瘤组织中抑制素(prohibitin,PHB)的表达情况,分析其对消化系统恶性肿瘤(digestive system malignant tumor,DT)患者预后的影响以及作用机制。方法①使用癌症基因组图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)和基因型-组织表达(Genotype-Tissue Expression,GTEx)数据库比较肿瘤组织和正常组织中PHB的表达差异。②收集2023年10月甘肃省人民医院诊治的5对胃癌及癌旁组织和5对结肠癌及癌旁组织,RT-qPCR检测PHB mRNA表达水平。③采用RT-qPCR和Western blot检测正常胃黏膜细胞(GES-1)和胃癌细胞(AGS、MKN45和HGC27)、正常结肠细胞NCM-460和人结肠癌细胞株SW480中PHB的表达差异。④利用R语言分析PHB对DT患者预后、肿瘤微环境、肿瘤突变负荷和微卫星不稳定性的影响。⑤采用CIBERSORT算法分析肿瘤组织中PHB表达与肿瘤免疫细胞浸润之间的相关性。基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)探讨PHB的生物学功能。⑥利用R语言分析PHB与药物敏感性的关系。结果①PHB在结肠癌、胆管癌、食管癌、肝癌、直肠癌和胃癌组织中均显著高表达(P<0.01)。②RT-qPCR和Western blot检测结果显示PHB在胃癌和结肠癌组织和细胞中高表达(P<0.01)。③PHB的差异表达与肝癌(P=0.002)预后不良相关。在胆管癌、胃癌、胰腺癌、肝癌和食管癌中,PHB与肿瘤突变负荷和微卫星不稳定性呈正相关(P<0.05)。④PHB的表达在结肠癌中与M2型巨噬细胞呈正相关(P=0.03);在胆管癌中与活化CD4^(+)记忆T细胞呈正相关(P<0.05);在食管癌中与活化肥大细胞呈正相关(P=0.03);在肝癌中与M0、M2型巨噬细胞和单核细胞呈正相关(P<0.05);在直肠癌中与静息树突状细胞、嗜酸性粒细胞和活化CD4^(+)记忆T细胞呈正相关(P<0.05);在胃癌中与M0型巨噬细胞、活化肥大细胞、中性粒细胞、静息自然杀伤细胞、活化CD4^(+)记忆T细胞和滤泡辅助性T细胞呈正相关(P<0.05)。⑤PHB在Ⅰ类受体、PPAR和钙离子信号通路中主要富集(P<0.05)。⑥PHB的表达与氨萘非特、普拉西诺特和阿比特龙等13种药物敏感性呈正相关(P<0.05)。结论PHB表达与DT中多种免疫细胞浸润及不良预后有关,其可能成为新型DT生物标志物及潜在的免疫调节靶点。

饮食相关炎症指数与消化系统恶性肿瘤发病关系的流行病学研究进展

饮食的炎症效应与恶性肿瘤的发生发展密切相关,因此饮食相关炎症指数作为探究饮食、炎症和肿瘤关系的方法学工具应运而生。本文复习了肿瘤流行病学相关研究文献,针对饮食相关炎症指数与消化系统常见肿瘤的流行病学研究进展进行归纳和总结。现有流行病学证据提示:促炎饮食与消化系统恶性肿瘤发病风险增加有关,其中与结直肠癌关联最强,其次是食管癌和胃癌,然后是胰腺癌,与肝癌的研究证据最少;食管癌的研究证据级别较低,胃癌的研究存在性别差异和混杂因素调整的问题,胰腺癌的研究结果存在异质性;针对目前研究进展和不足,未来可考虑开展前瞻性研究或人群队列研究,以及加强对肝癌等常见肿瘤的相关营养流行病学研究。本文可为消化系统肿瘤预防和控制中促进相关健康饮食行为的宣教工作提供参考。

免疫检查点B7-H4在消化系统恶性肿瘤中的研究进展

消化系统恶性肿瘤是中国癌症相关死亡的重要原因之一,其复杂的分子机制一直是临床和基础研究领域的焦点。B7-H4作为免疫球蛋白超家族B7家族的一员,具备多种生物学功能,主要通过抑制T细胞的活化和增殖、阻断细胞因子的合成来降低免疫响应。该蛋白在多种肿瘤组织中表达增高,与肿瘤细胞的增殖、分化、凋亡以及侵袭和转移密切相关,并且其表达水平与患者的预后紧密相连。尽管B7-H4在肿瘤的发生和发展中起着至关重要的作用,但其具体作用机制尚待进一步明确。本文就消化系统恶性肿瘤中B7-H4的研究进展进行综述,以期为未来的研究提供新的方向。

PET影像组学在消化系统肿瘤诊疗中的研究进展

影像组学采用医工相结合的方式,将传统图像转化为高维度、深层次的数字定量特征,挖掘图像的潜在生物标志物和异质性。消化系统恶性肿瘤在中国的发病率和死亡率均较高,近年来在人工智能发展和大数据时代的推动下,PET影像组学应用发展迅速,并在消化系统肿瘤的诊断、鉴别、疗效及预后评估等方面取得了一些有前景的研究成果,向无创性精确医学分析迈进。本文对PET影像组学在消化系统肿瘤中的诊疗进展进行综述,并分析面临的挑战与展望。

《中国肿瘤临床》文章推荐:免疫检查点B7-H4在消化系统恶性肿瘤中的研究进展

消化系统恶性肿瘤是中国癌症相关死亡的重要原因之一,其复杂的分子机制一直是临床和基础研究领域的焦点。B7-H4作为免疫球蛋白超家族B7家族的一员,具备多种生物学功能,主要通过抑制T细胞的活化和增殖、阻断细胞因子的合成来降低免疫响应。该蛋白在多种肿瘤组织中表达增高,与肿瘤细胞的增殖、分化、凋亡以及侵袭和转移密切相关,并且其表达水平与患者的预后紧密相连。尽管B7-H4在肿瘤的发生和发展中起着至关重要的作用,但其具体作用机制尚待进一步明确。

基于生物信息学分析PDE2A基因在消化系统肿瘤预后及免疫浸润的临床意义

背景消化系统肿瘤是最常见的恶性肿瘤之一,然而其预后仍不好.探索潜在生物标志物是肿瘤研究的重要方向.我们拟利用生物信息学方法探索消化系统的潜在标志物.目的探究在消化系统肿瘤中PDE2A表达与免疫浸润相关性,探索PDE2A在消化系统肿瘤中的预后价值.方法通过HPA、TIMER和UALCAN数据库分析PDE2A在不同消化系统肿瘤中的mRNA及蛋白表达,利用GEPIA数据库探索PDE2A在不同消化系统肿瘤患者预后的影响.通过TIMER数据库探索PDE2A表达与不同消化系统肿瘤免疫浸润相关性.利用cBioPortal数据库分析PDE2A在不同消化系统肿瘤的遗传突变信息.通过STRING数据库探索PDE2A的潜在蛋白相互作用网络.结果PDE2A基因mRNA和蛋白在肝癌、胃癌、胰腺癌、结肠癌和食管癌组织中表达低于正常癌旁组织.PDE2A高表达的肝癌和胰腺癌患者较PDE2A低表达的患者预后良好.PDE2A表达与肝癌、胃癌、胰腺癌、结肠癌和食管癌不同免疫细胞如CD4+T淋巴细胞、CD8+T淋巴细胞、B细胞、巨噬细胞和中性粒细胞呈正相关或负相关.PDE2A基因在胃癌、胰腺癌、结肠癌及食管癌中存在错义突变等遗传改变.结论PDE2A表达与消化系统肿瘤免疫浸润有关.PDE2A高表达的肝癌和胰腺癌患者预后良好.PDE2A基因可能为潜在的消化系统肿瘤免疫治疗靶点和预后标志物.

组织成像质谱流式在消化系统肿瘤中的应用

组织成像质谱流式(IMC)是一种融合了质谱、高分辨激光消融、免疫组织/细胞化学的新技术。以独特的高维视角全面、精准地描绘组织和肿瘤微环境中复杂的表型、信号通路、肿瘤免疫的相互作用,在消化系统肿瘤中广泛应用。本文围绕IMC在描绘肿瘤微环境全景图、揭示肿瘤空间异质性、阐明肿瘤药理学机制、助力新药开发、动态评估免疫治疗疗效在消化系统肿瘤中应用展开综述。

免疫抑制酸性蛋白在消化系统恶性肿瘤中的测定和意义

目的 探讨免疫抑制酸性蛋白 (IAP)与消化系统各种恶性肿瘤的关系。方法 用放射免疫法测定57例消化系统各种恶性肿瘤患者血清IAP水平。结果 各种恶性肿瘤IAP值均不同程度增高 ,尤以胃癌明显 ,各种恶性肿瘤的IAP阳性率为50.00 %～85.71% ,各种恶性肿瘤平均IAP值和IAP阳性率均高于慢性胃炎和正常对照 (均P<0.01) ,慢性胃炎患者和正常对照的IAP值与IAP阳性率差异无显著性意义 (均P>0.05)。结论

WHO(2000)消化系统肿瘤分类的学习心得

通过WHO(2 0 0 0 )消化系统肿瘤分类的学习心得进行交流 ,并与旧版分类进行比较。新版分类突出的特点是增加了肿瘤遗传学和临床特点 ,内容包括肿瘤的流行病学、病原学、临床特点 (症状、体征、影像学、内窥镜和大体变化 )、肿瘤的扩散及分期、遗传易感性、分子遗传学和预后等。这对深入认识理解肿瘤分类尤为重要。并对新分类中增加的胃肠道上皮内肿瘤。

蛋白质组学在消化系统肿瘤中的研究进展

随着蛋白质组学相关技术的迅速发展 ,蛋白质组学已成为当今细胞生物学领域中极其活跃的学科。蛋白质组学的核心技术包括双相电泳、质谱分析、蛋白质组信息学。蛋白质组学从新的角度研究肿瘤 ,寻找肿瘤标记蛋白 ,进而阐明其表达水平的变化与肿瘤发生、发展不同阶段的相互关系 ,对肿瘤的早期诊断具有重要意义。作者就蛋白质组学研究相关技术。

微粒子酶免疫法检测血清五项肿瘤标志物在鉴别诊断消化系统肿瘤和良性疾病中的价值

目的研究血清甲胎蛋白(AFP)、癌胚抗原(CEA)、糖链抗原(CA)125、CA19-9和β2微球蛋白(β2-MG)对消化系统6种肿瘤与相应良性疾病的诊断价值。方法应用微粒子酶免疫法检测379例消化系统恶性肿瘤患者、329例相应良性疾病患者的血清AFP、CEA、CA125、CA19-9和β2-MG浓度,并进行比较研究。结果五项肿瘤标志物联合检测,阳性率大幅提升,胃癌组、结直肠癌组、胰腺癌组和胆囊癌组与相应良性疾病组间阳性率差异均有统计学意义(P<0.01),消化系统肿瘤整体阳性率从16.1%～36.9%提升到56.7%。对肿瘤和相应良性病的诊断特异性为:AFP62.3%～100.0%、CEA81.3%～100.0%、CA12550.0%～100.0%、CA19-958.2%～87.0%、β2-MG53.8%～100.0%。结论血清AFP、CEA、CA125、CA19-9和β2-MG对消化系统肿瘤与相应良性疾病的鉴别诊断有重要意义,联合检测则更提升了敏感性。

肿瘤相关巨噬细胞来源的外泌体在消化系统肿瘤中的作用机制及治疗进展

肿瘤相关巨噬细胞是肿瘤微环境中的重要细胞群,分泌多种细胞因子促进肿瘤进展。肿瘤相关巨噬细胞通过向肿瘤细胞递送包含蛋白质、脂质和多种类型核糖核酸的外泌体促进肿瘤增殖、侵袭、转移、血管生成,并增强肿瘤细胞的耐药性。本研究综述肿瘤相关巨噬细胞分泌的外泌体对消化系统肿瘤的调节作用及其分子机制,并从外泌体角度介绍防治消化系统肿瘤的策略,为临床药物的开发提供新思路。

消化系统恶性肿瘤患者有根舌苔和无根舌苔与免疫功能的相关性研究

目的研究消化系统恶性肿瘤患者舌苔的有无与细胞免疫及体液免疫功能的相关性。方法将消化系统恶性肿瘤患者分为有根舌苔组及无根舌苔组,应用流式细胞技术检测CD淋巴亚群,采用免疫透视比浊法测定体液免疫相关指标,并将数据进行t检验及u检验。结果消化系统恶性肿瘤有根舌苔组患者细胞免疫指标CD4+、CD4+/CD8+、NK细胞均高于无根舌苔组,而有根舌苔组恶性肿瘤患者体液免疫指标与无根舌苔组相当。结论有根舌苔消化系统恶性肿瘤患者较无根舌苔患者的细胞免疫功能更强。

微粒子酶联免疫分析法检测血清β_2-MG对消化系统肿瘤的诊断价值

目的研究血清β2微球蛋白(β2-MG)对消化系统肿瘤的诊断价值。方法应用微粒子酶联免疫分析法(MEIA)检测354例消化系统肿瘤患者,299例消化系统良性疾病病人和100例健康体检者的β2-MG浓度,并进行比较分析。结果β2-MG在各消化肿瘤组的阳性率在19.1%～44.4%之间,与良性疾病组相比均有差异(P<0.05),与健康体检组相比差异亦有统计学意义(P<0.05);β2-MG在各消化系统肿瘤组的平均浓度在2.07～2.67 mg/L之间,与良性疾病组相比均有差异(P<0.05),与体检组相比亦差异显著(P<0.05)。结论血清β2-MG在多种消化系统肿瘤中有较高的阳性率和表达量,检测β2-MG有助于这些疾病的诊断。

肠道菌群在消化系统肿瘤发生发展中的作用机制研究进展

肠道菌群在外部环境和机体的共同作用下保持稳定,对机体的吸收消化、营养代谢、炎症反应和免疫调节等均具有重要意义[1]。近年来,随着二代、三代测序技术和生物芯片技术的迅猛发展,人类对肠道菌群在健康和疾病中的作用有了进一步的发现[2]。

消化系统恶性肿瘤患者细胞免疫功能分析及其临床意义

目的:检验消化系统恶性肿瘤患者外周血T淋巴细胞亚群,了解细胞免疫功能状态及其变化。方法:用实用McAb-A-E直接法检验消化系统恶性肿瘤患者72例及37例健康正常对照组的外周血抗凝血CD3+、CD4+、CD8+及CD4+/CD8+指标。并将恶性肿瘤组与健康正常对照组进行比较。结果:恶性肿瘤组CD3(+%)、CD4(+%)、CD8(+%)和CD4+/CD8+分别为:63.88±14.26、34.44±12.14、37.42±10.01和0.96±0.38;健康对照组分别为:69.24±9.46、44.41±5.96、33.30±4.38和1.35±0.20。恶性肿瘤组与健康对照组、正常值CD3+、CD4+、CD8+和CD4+/CD8+相比,恶性肿瘤组(食道癌、胃癌、肝癌、肠癌)CD3+和CD4+细胞阳性率和CD4+/CD8+比值均降低,CD8+细胞阳性率增高,方差分析结果均P<0.05和0.01,有统计学意义。结论:消化系统恶性肿瘤患者的CD3+、CD4+细胞阳性率和CD4+/CD8+比值均降低,CD8+细胞阳性率增高,说明消化系统恶性肿瘤患者的细胞免疫功能处于抑制状态。

蛋白质组学在消化系统肿瘤中的研究进展

蛋白质组学是系统研究分子体系、亚细胞系、细胞、组织、器官乃至整体等生物体系内蛋白质组成及其活动规律的科学。近些年来,它已成为全面分析蛋白质表达变化的有力研究工具,并被广泛应用到各种疾病研究之中。此文旨在介绍蛋白质组学的相关研究技术及其在消化系统肿瘤中的应用。